MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia montanensis str. OSU 85-930 chromosome

Total Repeats: 19763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017043	TTA	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017043	TAC	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017043	TAT	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017043	AGT	2	6	260	265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017043	GAT	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017043	CGA	2	6	479	484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017043	ATA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017043	GCA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017043	AAG	2	6	769	774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017043	TTA	2	6	828	833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017043	AAT	3	9	840	848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017043	TGG	2	6	925	930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017043	AGA	2	6	935	940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017043	GAG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017043	TTG	2	6	987	992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017043	GTC	2	6	1007	1012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017043	GAG	2	6	1018	1023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017043	CAA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017043	TTA	2	6	1251	1256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482125
20	NC_017043	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482125
21	NC_017043	AAG	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482125
22	NC_017043	TGC	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482125
23	NC_017043	GAG	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482125
24	NC_017043	GAT	2	6	1644	1649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482125
25	NC_017043	ATA	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482125
26	NC_017043	TTA	2	6	1713	1718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482125
27	NC_017043	CCA	2	6	1838	1843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482125
28	NC_017043	AGC	2	6	2085	2090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482125
29	NC_017043	ATA	2	6	2146	2151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482125
30	NC_017043	AGG	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482125
31	NC_017043	GCG	2	6	2366	2371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482126
32	NC_017043	TGC	2	6	2469	2474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482126
33	NC_017043	AGT	2	6	2515	2520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
34	NC_017043	TTA	2	6	2577	2582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
35	NC_017043	GAT	2	6	2711	2716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
36	NC_017043	TTA	2	6	2727	2732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
37	NC_017043	GTG	2	6	2748	2753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383482126
38	NC_017043	AGC	2	6	2788	2793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482126
39	NC_017043	AAG	2	6	2880	2885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482126
40	NC_017043	ATT	2	6	2956	2961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
41	NC_017043	CGA	2	6	3106	3111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482126
42	NC_017043	ACA	2	6	3124	3129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482126
43	NC_017043	GCT	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482126
44	NC_017043	TAG	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
45	NC_017043	ATA	2	6	3297	3302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
46	NC_017043	GCT	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482126
47	NC_017043	AGT	2	6	3493	3498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
48	NC_017043	TTA	2	6	3621	3626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
49	NC_017043	CTT	2	6	3663	3668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482126
50	NC_017043	AGA	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482126
51	NC_017043	GAA	2	6	3704	3709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482126
52	NC_017043	ATA	3	9	3771	3779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
53	NC_017043	ATG	2	6	3837	3842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
54	NC_017043	GTA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
55	NC_017043	AGT	2	6	3866	3871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
56	NC_017043	GTT	2	6	3883	3888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482126
57	NC_017043	AGA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482126
58	NC_017043	CTA	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482126
59	NC_017043	ATA	3	9	4098	4106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
60	NC_017043	ATG	2	6	4134	4139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
61	NC_017043	CAA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383482126
62	NC_017043	ATC	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482126
63	NC_017043	TTA	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
64	NC_017043	TTG	2	6	4458	4463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482126
65	NC_017043	ATA	2	6	4487	4492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
66	NC_017043	TAA	2	6	4510	4515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482126
67	NC_017043	TAT	2	6	4536	4541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482126
68	NC_017043	GAT	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482126
69	NC_017043	TGC	2	6	4666	4671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482126
70	NC_017043	GTT	2	6	4773	4778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383482127
71	NC_017043	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482127
72	NC_017043	TTA	2	6	5370	5375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482127
73	NC_017043	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482127
74	NC_017043	AGC	3	9	5475	5483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482127
75	NC_017043	ATA	2	6	5538	5543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482127
76	NC_017043	TTA	2	6	5638	5643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482127
77	NC_017043	TTC	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482127
78	NC_017043	ATA	2	6	5677	5682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482127
79	NC_017043	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482127
80	NC_017043	TAG	2	6	5755	5760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482127
81	NC_017043	TTA	2	6	5794	5799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482127
82	NC_017043	GTC	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482127
83	NC_017043	TAG	2	6	5943	5948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482128
84	NC_017043	TAT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482128
85	NC_017043	TTA	2	6	6017	6022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482128
86	NC_017043	GAA	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017043	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017043	GAA	2	6	6230	6235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482129
89	NC_017043	ATT	2	6	6245	6250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482129
90	NC_017043	GAA	2	6	6354	6359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482129
91	NC_017043	CTA	2	6	6397	6402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482129
92	NC_017043	AGG	2	6	6410	6415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383482129
93	NC_017043	TAA	2	6	6422	6427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482129
94	NC_017043	AGC	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482129
95	NC_017043	CTC	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383482129
96	NC_017043	CGG	2	6	6491	6496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482129
97	NC_017043	ATT	2	6	6501	6506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482129
98	NC_017043	TTA	2	6	6562	6567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482129
99	NC_017043	TAA	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482129
100	NC_017043	GAA	2	6	6612	6617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482129
101	NC_017043	TAA	2	6	6729	6734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482129
102	NC_017043	TGA	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017043	GCA	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482130
104	NC_017043	AAG	2	6	6896	6901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
105	NC_017043	TGC	2	6	6959	6964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482130
106	NC_017043	AGC	2	6	7169	7174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482130
107	NC_017043	TAT	2	6	7234	7239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482130
108	NC_017043	ATA	2	6	7325	7330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
109	NC_017043	GAA	2	6	7438	7443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
110	NC_017043	ACT	2	6	7564	7569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
111	NC_017043	ATC	2	6	7634	7639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
112	NC_017043	ATA	2	6	7642	7647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
113	NC_017043	TTA	3	9	7802	7810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482130
114	NC_017043	AAG	2	6	8021	8026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
115	NC_017043	TGA	2	6	8196	8201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482130
116	NC_017043	ATC	3	9	8234	8242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
117	NC_017043	ATC	2	6	8322	8327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
118	NC_017043	GGC	2	6	8419	8424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383482130
119	NC_017043	TAT	2	6	8447	8452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482130
120	NC_017043	TGC	2	6	8540	8545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482130
121	NC_017043	ATA	2	6	8567	8572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
122	NC_017043	GAA	2	6	8587	8592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
123	NC_017043	AAT	2	6	8632	8637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
124	NC_017043	AGT	2	6	8640	8645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482130
125	NC_017043	GCT	2	6	8801	8806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482130
126	NC_017043	TAA	2	6	8817	8822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
127	NC_017043	GAT	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482130
128	NC_017043	TAA	2	6	8880	8885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482130
129	NC_017043	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482130
130	NC_017043	CTA	2	6	9064	9069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482130
131	NC_017043	GAA	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
132	NC_017043	TGA	2	6	9156	9161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482130
133	NC_017043	GAA	2	6	9318	9323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383482130
134	NC_017043	GTC	2	6	9384	9389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482131
135	NC_017043	TAT	2	6	9504	9509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017043	ATT	2	6	9565	9570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017043	GTT	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017043	ACC	2	6	9641	9646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017043	GTA	3	9	9664	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017043	CCT	2	6	9686	9691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017043	CCA	2	6	9756	9761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383482132
142	NC_017043	TCT	3	9	9799	9807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383482132
143	NC_017043	TTC	2	6	10049	10054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017043	TTC	2	6	10058	10063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017043	CTA	2	6	10126	10131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017043	TAA	2	6	10144	10149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017043	TAA	2	6	10187	10192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017043	TAT	2	6	10276	10281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017043	AGT	2	6	10295	10300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017043	TAA	2	6	10337	10342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017043	TTA	2	6	10353	10358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017043	TGC	2	6	10525	10530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383482133
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154	NC_017043	TAA	2	6	10777	10782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482133
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162	NC_017043	ATT	2	6	11396	11401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482134
163	NC_017043	ATT	2	6	11413	11418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482134
164	NC_017043	TAT	2	6	11425	11430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482134
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192	NC_017043	CTC	2	6	12888	12893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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245	NC_017043	AAT	2	6	16206	16211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
246	NC_017043	TCG	2	6	16232	16237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_017043	TAC	2	6	16241	16246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_017043	TTC	2	6	16251	16256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_017043	TAA	2	6	16271	16276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_017043	TCA	2	6	16540	16545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482140
257	NC_017043	AAT	2	6	16546	16551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383482140
258	NC_017043	ACT	2	6	16552	16557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383482140
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260	NC_017043	TAT	2	6	16695	16700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383482140
261	NC_017043	TGA	2	6	16740	16745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482140
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273	NC_017043	TAG	2	6	17494	17499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383482141
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277	NC_017043	GCA	2	6	17716	17721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383482142
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