MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 1176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017042	ATATA	2	10	434	443	60 %	40 %	0 %	0 %	383480872
2	NC_017042	ACTAA	2	10	753	762	60 %	20 %	0 %	20 %	383480872
3	NC_017042	GTTTT	2	10	2163	2172	0 %	80 %	20 %	0 %	383480874
4	NC_017042	ATTTA	2	10	5932	5941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017042	TAAAT	2	10	6077	6086	60 %	40 %	0 %	0 %	383480878
6	NC_017042	GATTA	2	10	6749	6758	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017042	GCATC	2	10	7288	7297	20 %	20 %	20 %	40 %	383480881
8	NC_017042	TATTT	2	10	7341	7350	20 %	80 %	0 %	0 %	383480881
9	NC_017042	AAATA	2	10	8639	8648	80 %	20 %	0 %	0 %	383480881
10	NC_017042	AAAAG	2	10	8876	8885	80 %	0 %	20 %	0 %	383480881
11	NC_017042	TCACT	2	10	9718	9727	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017042	TTTTA	2	10	9776	9785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017042	AATTA	2	10	12450	12459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017042	TAAAG	2	10	12859	12868	60 %	20 %	20 %	0 %	383480887
15	NC_017042	AAAAT	2	10	14960	14969	80 %	20 %	0 %	0 %	383480888
16	NC_017042	TGTTC	2	10	15189	15198	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017042	GCTTA	2	10	17221	17230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017042	ATGAA	2	10	17516	17525	60 %	20 %	20 %	0 %	383480890
19	NC_017042	GGATT	2	10	17927	17936	20 %	40 %	40 %	0 %	383480891
20	NC_017042	TAAAT	2	10	18442	18451	60 %	40 %	0 %	0 %	383480891
21	NC_017042	TTTAA	2	10	19228	19237	40 %	60 %	0 %	0 %	383480891
22	NC_017042	TATTT	2	10	19417	19426	20 %	80 %	0 %	0 %	383480892
23	NC_017042	ATTTT	2	10	19553	19562	20 %	80 %	0 %	0 %	383480892
24	NC_017042	GTCCG	2	10	20266	20275	0 %	20 %	40 %	40 %	383480892
25	NC_017042	ATATC	2	10	21550	21559	40 %	40 %	0 %	20 %	383480893
26	NC_017042	ATATT	2	10	23410	23419	40 %	60 %	0 %	0 %	383480896
27	NC_017042	ATATA	2	10	23476	23485	60 %	40 %	0 %	0 %	383480896
28	NC_017042	TAAAT	2	10	26048	26057	60 %	40 %	0 %	0 %	383480899
29	NC_017042	TATTT	2	10	27233	27242	20 %	80 %	0 %	0 %	383480899
30	NC_017042	TAAAA	2	10	27973	27982	80 %	20 %	0 %	0 %	383480900
31	NC_017042	ATTTT	2	10	29999	30008	20 %	80 %	0 %	0 %	383480901
32	NC_017042	ACTTA	2	10	31947	31956	40 %	40 %	0 %	20 %	383480904
33	NC_017042	TAAAT	2	10	34780	34789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017042	AGGTT	2	10	36750	36759	20 %	40 %	40 %	0 %	383480908
35	NC_017042	ATAGT	2	10	37146	37155	40 %	40 %	20 %	0 %	383480908
36	NC_017042	ATGAA	2	10	37542	37551	60 %	20 %	20 %	0 %	383480908
37	NC_017042	TCTCT	2	10	38560	38569	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017042	GCATG	2	10	39048	39057	20 %	20 %	40 %	20 %	383480911
39	NC_017042	GATAT	2	10	39229	39238	40 %	40 %	20 %	0 %	383480911
40	NC_017042	TGCTT	2	10	40371	40380	0 %	60 %	20 %	20 %	383480913
41	NC_017042	AATAA	2	10	40492	40501	80 %	20 %	0 %	0 %	383480913
42	NC_017042	AATCC	2	10	40886	40895	40 %	20 %	0 %	40 %	383480914
43	NC_017042	AACAG	2	10	42133	42142	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017042	ACAGA	2	10	42243	42252	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017042	AAAGC	2	10	43272	43281	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017042	TTTAT	2	10	43348	43357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017042	AAATT	2	10	43475	43484	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017042	TATAT	2	10	44264	44273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017042	ATATA	2	10	44291	44300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017042	AAAGC	2	10	44926	44935	60 %	0 %	20 %	20 %	383480915
51	NC_017042	TAAAT	2	10	45069	45078	60 %	40 %	0 %	0 %	383480915
52	NC_017042	ATAAA	2	10	45428	45437	80 %	20 %	0 %	0 %	383480915
53	NC_017042	ATAAA	2	10	45572	45581	80 %	20 %	0 %	0 %	383480915
54	NC_017042	AAAAT	2	10	46353	46362	80 %	20 %	0 %	0 %	383480917
55	NC_017042	ATACT	2	10	47284	47293	40 %	40 %	0 %	20 %	383480917
56	NC_017042	AAAAC	2	10	48648	48657	80 %	0 %	0 %	20 %	383480920
57	NC_017042	GCAAG	2	10	49057	49066	40 %	0 %	40 %	20 %	383480921
58	NC_017042	AAATC	2	10	49370	49379	60 %	20 %	0 %	20 %	383480921
59	NC_017042	GCATC	2	10	50219	50228	20 %	20 %	20 %	40 %	383480922
60	NC_017042	ATTTA	2	10	50308	50317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017042	CGCTC	2	10	50403	50412	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_017042	TAAAA	2	10	52229	52238	80 %	20 %	0 %	0 %	383480926
63	NC_017042	AAAAT	2	10	55445	55454	80 %	20 %	0 %	0 %	383480929
64	NC_017042	ATATT	2	10	56090	56099	40 %	60 %	0 %	0 %	383480930
65	NC_017042	GATAT	2	10	56645	56654	40 %	40 %	20 %	0 %	383480930
66	NC_017042	AGGGG	2	10	59464	59473	20 %	0 %	80 %	0 %	383480934
67	NC_017042	ATTAT	2	10	59705	59714	40 %	60 %	0 %	0 %	383480934
68	NC_017042	GAAAA	2	10	59789	59798	80 %	0 %	20 %	0 %	383480934
69	NC_017042	GTATG	2	10	61111	61120	20 %	40 %	40 %	0 %	383480935
70	NC_017042	TTGTT	2	10	63902	63911	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017042	TTACG	2	10	65168	65177	20 %	40 %	20 %	20 %	383480939
72	NC_017042	GTTTG	2	10	65339	65348	0 %	60 %	40 %	0 %	383480939
73	NC_017042	CCTCT	2	10	65390	65399	0 %	40 %	0 %	60 %	383480939
74	NC_017042	ACTTA	2	10	66078	66087	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017042	ATATA	2	10	69922	69931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017042	ACTAA	2	10	73270	73279	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017042	TATAG	2	10	79806	79815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017042	ACAAA	2	10	82363	82372	80 %	0 %	0 %	20 %	383480958
79	NC_017042	AACAT	2	10	83315	83324	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017042	TAATA	2	10	84503	84512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017042	TGAAC	2	10	86726	86735	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017042	TTATA	2	10	86835	86844	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017042	AGGTA	2	10	88330	88339	40 %	20 %	40 %	0 %	383480962
84	NC_017042	TCTGC	2	10	89501	89510	0 %	40 %	20 %	40 %	383480962
85	NC_017042	CTTTG	2	10	89828	89837	0 %	60 %	20 %	20 %	383480962
86	NC_017042	ATGGT	2	10	90861	90870	20 %	40 %	40 %	0 %	383480962
87	NC_017042	GCTTT	2	10	90873	90882	0 %	60 %	20 %	20 %	383480962
88	NC_017042	TTTCT	2	10	91117	91126	0 %	80 %	0 %	20 %	383480962
89	NC_017042	TTTAT	2	10	91403	91412	20 %	80 %	0 %	0 %	383480962
90	NC_017042	TAAAA	2	10	94824	94833	80 %	20 %	0 %	0 %	383480965
91	NC_017042	TTTAA	2	10	95431	95440	40 %	60 %	0 %	0 %	383480965
92	NC_017042	TAAAT	2	10	95592	95601	60 %	40 %	0 %	0 %	383480965
93	NC_017042	AATTT	2	10	97031	97040	40 %	60 %	0 %	0 %	383480967
94	NC_017042	AGTTA	2	10	97252	97261	40 %	40 %	20 %	0 %	383480967
95	NC_017042	ATTAA	2	10	98697	98706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017042	AAAAT	2	10	101073	101082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017042	TAGAA	2	10	101759	101768	60 %	20 %	20 %	0 %	383480972
98	NC_017042	TGGAT	2	10	102505	102514	20 %	40 %	40 %	0 %	383480973
99	NC_017042	TAAAG	2	10	103542	103551	60 %	20 %	20 %	0 %	383480974
100	NC_017042	ATTTA	2	10	105424	105433	40 %	60 %	0 %	0 %	383480975
101	NC_017042	TGACC	2	10	106133	106142	20 %	20 %	20 %	40 %	383480975
102	NC_017042	TCGCT	2	10	106580	106589	0 %	40 %	20 %	40 %	383480975
103	NC_017042	TAAAT	2	10	107380	107389	60 %	40 %	0 %	0 %	383480976
104	NC_017042	ATAAA	2	10	108868	108877	80 %	20 %	0 %	0 %	383480977
105	NC_017042	TTTAT	2	10	109297	109306	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017042	AAAAT	2	10	111222	111231	80 %	20 %	0 %	0 %	383480980
107	NC_017042	AAAGA	2	10	111611	111620	80 %	0 %	20 %	0 %	383480980
108	NC_017042	GAAAG	2	10	111643	111652	60 %	0 %	40 %	0 %	383480980
109	NC_017042	TCTAT	2	10	111818	111827	20 %	60 %	0 %	20 %	383480981
110	NC_017042	AGTAG	2	10	112422	112431	40 %	20 %	40 %	0 %	383480981
111	NC_017042	GAAAG	2	10	113390	113399	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017042	AAATT	2	10	114954	114963	60 %	40 %	0 %	0 %	383480985
113	NC_017042	CATTA	2	10	116178	116187	40 %	40 %	0 %	20 %	383480986
114	NC_017042	TATAA	2	10	117529	117538	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017042	TTATT	2	10	117620	117629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017042	TTTAT	2	10	117683	117692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017042	TTTTA	2	10	119152	119161	20 %	80 %	0 %	0 %	383480989
118	NC_017042	GCTAG	2	10	119887	119896	20 %	20 %	40 %	20 %	383480990
119	NC_017042	TTTTG	2	10	119992	120001	0 %	80 %	20 %	0 %	383480990
120	NC_017042	TATTT	2	10	120534	120543	20 %	80 %	0 %	0 %	383480990
121	NC_017042	CTTGG	2	10	122590	122599	0 %	40 %	40 %	20 %	383480991
122	NC_017042	AATTA	2	10	123407	123416	60 %	40 %	0 %	0 %	383480991
123	NC_017042	TAACT	2	10	124354	124363	40 %	40 %	0 %	20 %	383480993
124	NC_017042	AGAAA	2	10	124969	124978	80 %	0 %	20 %	0 %	383480994
125	NC_017042	GTTTC	2	10	125409	125418	0 %	60 %	20 %	20 %	383480994
126	NC_017042	ATTTT	2	10	125958	125967	20 %	80 %	0 %	0 %	383480994
127	NC_017042	AAGAG	2	10	127416	127425	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017042	AGTAC	2	10	127871	127880	40 %	20 %	20 %	20 %	383480997
129	NC_017042	TTTCT	2	10	129171	129180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017042	TTGAT	2	10	131937	131946	20 %	60 %	20 %	0 %	383480999
131	NC_017042	TAAAG	2	10	132964	132973	60 %	20 %	20 %	0 %	383480999
132	NC_017042	ATTAT	2	10	133037	133046	40 %	60 %	0 %	0 %	383480999
133	NC_017042	TCGGT	2	10	138460	138469	0 %	40 %	40 %	20 %	383481007
134	NC_017042	GCTTT	2	10	139880	139889	0 %	60 %	20 %	20 %	383481008
135	NC_017042	GATAA	2	10	143083	143092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017042	TAAAA	2	10	144455	144464	80 %	20 %	0 %	0 %	383481010
137	NC_017042	CTTTA	2	10	147273	147282	20 %	60 %	0 %	20 %	383481014
138	NC_017042	GCTTA	2	10	147461	147470	20 %	40 %	20 %	20 %	383481014
139	NC_017042	CATTT	2	10	148164	148173	20 %	60 %	0 %	20 %	383481014
140	NC_017042	TTAAA	2	10	148189	148198	60 %	40 %	0 %	0 %	383481014
141	NC_017042	TAAAT	2	10	148261	148270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017042	AATAT	2	10	149384	149393	60 %	40 %	0 %	0 %	383481015
143	NC_017042	ACATA	2	10	150978	150987	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017042	CACTT	2	10	152286	152295	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017042	TTTCT	2	10	154198	154207	0 %	80 %	0 %	20 %	383481019
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156	NC_017042	ATTAA	2	10	161978	161987	60 %	40 %	0 %	0 %	383481025
157	NC_017042	ATACA	2	10	162182	162191	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017042	GAAAA	2	10	162526	162535	80 %	0 %	20 %	0 %	383481026
159	NC_017042	CGCAT	3	15	170532	170546	20 %	20 %	20 %	40 %	383481035
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161	NC_017042	TTGTA	2	10	176724	176733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017042	ATTTA	2	10	177663	177672	40 %	60 %	0 %	0 %	383481041
163	NC_017042	AATTA	2	10	178032	178041	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017042	TCAAA	2	10	179320	179329	60 %	20 %	0 %	20 %	383481043
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170	NC_017042	TTTAT	2	10	185863	185872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017042	CGGAT	2	10	186022	186031	20 %	20 %	40 %	20 %	383481051
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173	NC_017042	ATTAT	2	10	187716	187725	40 %	60 %	0 %	0 %	383481053
174	NC_017042	TAGTT	2	10	188996	189005	20 %	60 %	20 %	0 %	383481053
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185	NC_017042	TTAAA	2	10	207085	207094	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017042	CTTGT	2	10	207575	207584	0 %	60 %	20 %	20 %	383481069
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190	NC_017042	TCATA	2	10	210313	210322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_017042	TCTTT	2	10	211527	211536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_017042	AAATC	2	10	213142	213151	60 %	20 %	0 %	20 %	383481079
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233	NC_017042	TTTAA	2	10	261478	261487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_017042	TATTT	2	10	261516	261525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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239	NC_017042	TAAAA	2	10	278853	278862	80 %	20 %	0 %	0 %	383481128
240	NC_017042	TAGCA	2	10	278964	278973	40 %	20 %	20 %	20 %	383481128
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244	NC_017042	TCGCT	2	10	286766	286775	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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250	NC_017042	AATTA	2	10	290471	290480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017042	TAAAT	2	10	290488	290497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017042	TAAAA	2	10	290523	290532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017042	AGACA	2	10	290585	290594	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
254	NC_017042	GTTTT	2	10	291067	291076	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017042	ATTAT	2	10	292655	292664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017042	TTAAA	2	10	293048	293057	60 %	40 %	0 %	0 %	383481144
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259	NC_017042	CCTTG	2	10	294236	294245	0 %	40 %	20 %	40 %	383481144
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261	NC_017042	ATATA	2	10	295486	295495	60 %	40 %	0 %	0 %	383481145
262	NC_017042	CAATA	2	10	296358	296367	60 %	20 %	0 %	20 %	383481145
263	NC_017042	AAATT	2	10	296681	296690	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017042	TTTCT	2	10	296696	296705	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_017042	TAAAG	2	10	297898	297907	60 %	20 %	20 %	0 %	383481147
266	NC_017042	GTCAA	2	10	299175	299184	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017042	AAGGC	2	10	300750	300759	40 %	0 %	40 %	20 %	383481150
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269	NC_017042	TAAAT	2	10	307348	307357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_017042	TATAT	2	10	308718	308727	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_017042	ATTAA	2	10	311236	311245	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017042	ATACT	2	10	313185	313194	40 %	40 %	0 %	20 %	383481161
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274	NC_017042	TCCCA	2	10	313846	313855	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
275	NC_017042	ATTAT	2	10	314499	314508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017042	CCATC	2	10	316518	316527	20 %	20 %	0 %	60 %	383481163
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404	NC_017042	GCTAA	2	10	458864	458873	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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