MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017042	ATATA	2	10	434	443	60 %	40 %	0 %	0 %	383480872
2	NC_017042	ACTAA	2	10	753	762	60 %	20 %	0 %	20 %	383480872
3	NC_017042	GTTTT	2	10	2163	2172	0 %	80 %	20 %	0 %	383480874
4	NC_017042	TAAAT	2	10	6077	6086	60 %	40 %	0 %	0 %	383480878
5	NC_017042	GCATC	2	10	7288	7297	20 %	20 %	20 %	40 %	383480881
6	NC_017042	TATTT	2	10	7341	7350	20 %	80 %	0 %	0 %	383480881
7	NC_017042	AAATA	2	10	8639	8648	80 %	20 %	0 %	0 %	383480881
8	NC_017042	AAAAG	2	10	8876	8885	80 %	0 %	20 %	0 %	383480881
9	NC_017042	TAAAG	2	10	12859	12868	60 %	20 %	20 %	0 %	383480887
10	NC_017042	AAAAT	2	10	14960	14969	80 %	20 %	0 %	0 %	383480888
11	NC_017042	ATGAA	2	10	17516	17525	60 %	20 %	20 %	0 %	383480890
12	NC_017042	GGATT	2	10	17927	17936	20 %	40 %	40 %	0 %	383480891
13	NC_017042	TAAAT	2	10	18442	18451	60 %	40 %	0 %	0 %	383480891
14	NC_017042	TTTAA	2	10	19228	19237	40 %	60 %	0 %	0 %	383480891
15	NC_017042	TATTT	2	10	19417	19426	20 %	80 %	0 %	0 %	383480892
16	NC_017042	ATTTT	2	10	19553	19562	20 %	80 %	0 %	0 %	383480892
17	NC_017042	GTCCG	2	10	20266	20275	0 %	20 %	40 %	40 %	383480892
18	NC_017042	ATATC	2	10	21550	21559	40 %	40 %	0 %	20 %	383480893
19	NC_017042	ATATT	2	10	23410	23419	40 %	60 %	0 %	0 %	383480896
20	NC_017042	ATATA	2	10	23476	23485	60 %	40 %	0 %	0 %	383480896
21	NC_017042	TAAAT	2	10	26048	26057	60 %	40 %	0 %	0 %	383480899
22	NC_017042	TATTT	2	10	27233	27242	20 %	80 %	0 %	0 %	383480899
23	NC_017042	TAAAA	2	10	27973	27982	80 %	20 %	0 %	0 %	383480900
24	NC_017042	ATTTT	2	10	29999	30008	20 %	80 %	0 %	0 %	383480901
25	NC_017042	ACTTA	2	10	31947	31956	40 %	40 %	0 %	20 %	383480904
26	NC_017042	AGGTT	2	10	36750	36759	20 %	40 %	40 %	0 %	383480908
27	NC_017042	ATAGT	2	10	37146	37155	40 %	40 %	20 %	0 %	383480908
28	NC_017042	ATGAA	2	10	37542	37551	60 %	20 %	20 %	0 %	383480908
29	NC_017042	GCATG	2	10	39048	39057	20 %	20 %	40 %	20 %	383480911
30	NC_017042	GATAT	2	10	39229	39238	40 %	40 %	20 %	0 %	383480911
31	NC_017042	TGCTT	2	10	40371	40380	0 %	60 %	20 %	20 %	383480913
32	NC_017042	AATAA	2	10	40492	40501	80 %	20 %	0 %	0 %	383480913
33	NC_017042	AATCC	2	10	40886	40895	40 %	20 %	0 %	40 %	383480914
34	NC_017042	AAAGC	2	10	44926	44935	60 %	0 %	20 %	20 %	383480915
35	NC_017042	TAAAT	2	10	45069	45078	60 %	40 %	0 %	0 %	383480915
36	NC_017042	ATAAA	2	10	45428	45437	80 %	20 %	0 %	0 %	383480915
37	NC_017042	ATAAA	2	10	45572	45581	80 %	20 %	0 %	0 %	383480915
38	NC_017042	AAAAT	2	10	46353	46362	80 %	20 %	0 %	0 %	383480917
39	NC_017042	ATACT	2	10	47284	47293	40 %	40 %	0 %	20 %	383480917
40	NC_017042	AAAAC	2	10	48648	48657	80 %	0 %	0 %	20 %	383480920
41	NC_017042	GCAAG	2	10	49057	49066	40 %	0 %	40 %	20 %	383480921
42	NC_017042	AAATC	2	10	49370	49379	60 %	20 %	0 %	20 %	383480921
43	NC_017042	GCATC	2	10	50219	50228	20 %	20 %	20 %	40 %	383480922
44	NC_017042	TAAAA	2	10	52229	52238	80 %	20 %	0 %	0 %	383480926
45	NC_017042	AAAAT	2	10	55445	55454	80 %	20 %	0 %	0 %	383480929
46	NC_017042	ATATT	2	10	56090	56099	40 %	60 %	0 %	0 %	383480930
47	NC_017042	GATAT	2	10	56645	56654	40 %	40 %	20 %	0 %	383480930
48	NC_017042	AGGGG	2	10	59464	59473	20 %	0 %	80 %	0 %	383480934
49	NC_017042	ATTAT	2	10	59705	59714	40 %	60 %	0 %	0 %	383480934
50	NC_017042	GAAAA	2	10	59789	59798	80 %	0 %	20 %	0 %	383480934
51	NC_017042	GTATG	2	10	61111	61120	20 %	40 %	40 %	0 %	383480935
52	NC_017042	TTACG	2	10	65168	65177	20 %	40 %	20 %	20 %	383480939
53	NC_017042	GTTTG	2	10	65339	65348	0 %	60 %	40 %	0 %	383480939
54	NC_017042	CCTCT	2	10	65390	65399	0 %	40 %	0 %	60 %	383480939
55	NC_017042	ACAAA	2	10	82363	82372	80 %	0 %	0 %	20 %	383480958
56	NC_017042	AGGTA	2	10	88330	88339	40 %	20 %	40 %	0 %	383480962
57	NC_017042	TCTGC	2	10	89501	89510	0 %	40 %	20 %	40 %	383480962
58	NC_017042	CTTTG	2	10	89828	89837	0 %	60 %	20 %	20 %	383480962
59	NC_017042	ATGGT	2	10	90861	90870	20 %	40 %	40 %	0 %	383480962
60	NC_017042	GCTTT	2	10	90873	90882	0 %	60 %	20 %	20 %	383480962
61	NC_017042	TTTCT	2	10	91117	91126	0 %	80 %	0 %	20 %	383480962
62	NC_017042	TTTAT	2	10	91403	91412	20 %	80 %	0 %	0 %	383480962
63	NC_017042	TAAAA	2	10	94824	94833	80 %	20 %	0 %	0 %	383480965
64	NC_017042	TTTAA	2	10	95431	95440	40 %	60 %	0 %	0 %	383480965
65	NC_017042	TAAAT	2	10	95592	95601	60 %	40 %	0 %	0 %	383480965
66	NC_017042	AATTT	2	10	97031	97040	40 %	60 %	0 %	0 %	383480967
67	NC_017042	AGTTA	2	10	97252	97261	40 %	40 %	20 %	0 %	383480967
68	NC_017042	TAGAA	2	10	101759	101768	60 %	20 %	20 %	0 %	383480972
69	NC_017042	TGGAT	2	10	102505	102514	20 %	40 %	40 %	0 %	383480973
70	NC_017042	TAAAG	2	10	103542	103551	60 %	20 %	20 %	0 %	383480974
71	NC_017042	ATTTA	2	10	105424	105433	40 %	60 %	0 %	0 %	383480975
72	NC_017042	TGACC	2	10	106133	106142	20 %	20 %	20 %	40 %	383480975
73	NC_017042	TCGCT	2	10	106580	106589	0 %	40 %	20 %	40 %	383480975
74	NC_017042	TAAAT	2	10	107380	107389	60 %	40 %	0 %	0 %	383480976
75	NC_017042	ATAAA	2	10	108868	108877	80 %	20 %	0 %	0 %	383480977
76	NC_017042	AAAAT	2	10	111222	111231	80 %	20 %	0 %	0 %	383480980
77	NC_017042	AAAGA	2	10	111611	111620	80 %	0 %	20 %	0 %	383480980
78	NC_017042	GAAAG	2	10	111643	111652	60 %	0 %	40 %	0 %	383480980
79	NC_017042	TCTAT	2	10	111818	111827	20 %	60 %	0 %	20 %	383480981
80	NC_017042	AGTAG	2	10	112422	112431	40 %	20 %	40 %	0 %	383480981
81	NC_017042	AAATT	2	10	114954	114963	60 %	40 %	0 %	0 %	383480985
82	NC_017042	CATTA	2	10	116178	116187	40 %	40 %	0 %	20 %	383480986
83	NC_017042	TTTTA	2	10	119152	119161	20 %	80 %	0 %	0 %	383480989
84	NC_017042	GCTAG	2	10	119887	119896	20 %	20 %	40 %	20 %	383480990
85	NC_017042	TTTTG	2	10	119992	120001	0 %	80 %	20 %	0 %	383480990
86	NC_017042	TATTT	2	10	120534	120543	20 %	80 %	0 %	0 %	383480990
87	NC_017042	CTTGG	2	10	122590	122599	0 %	40 %	40 %	20 %	383480991
88	NC_017042	AATTA	2	10	123407	123416	60 %	40 %	0 %	0 %	383480991
89	NC_017042	TAACT	2	10	124354	124363	40 %	40 %	0 %	20 %	383480993
90	NC_017042	AGAAA	2	10	124969	124978	80 %	0 %	20 %	0 %	383480994
91	NC_017042	GTTTC	2	10	125409	125418	0 %	60 %	20 %	20 %	383480994
92	NC_017042	ATTTT	2	10	125958	125967	20 %	80 %	0 %	0 %	383480994
93	NC_017042	AGTAC	2	10	127871	127880	40 %	20 %	20 %	20 %	383480997
94	NC_017042	TTGAT	2	10	131937	131946	20 %	60 %	20 %	0 %	383480999
95	NC_017042	TAAAG	2	10	132964	132973	60 %	20 %	20 %	0 %	383480999
96	NC_017042	ATTAT	2	10	133037	133046	40 %	60 %	0 %	0 %	383480999
97	NC_017042	TCGGT	2	10	138460	138469	0 %	40 %	40 %	20 %	383481007
98	NC_017042	GCTTT	2	10	139880	139889	0 %	60 %	20 %	20 %	383481008
99	NC_017042	TAAAA	2	10	144455	144464	80 %	20 %	0 %	0 %	383481010
100	NC_017042	CTTTA	2	10	147273	147282	20 %	60 %	0 %	20 %	383481014
101	NC_017042	GCTTA	2	10	147461	147470	20 %	40 %	20 %	20 %	383481014
102	NC_017042	CATTT	2	10	148164	148173	20 %	60 %	0 %	20 %	383481014
103	NC_017042	TTAAA	2	10	148189	148198	60 %	40 %	0 %	0 %	383481014
104	NC_017042	AATAT	2	10	149384	149393	60 %	40 %	0 %	0 %	383481015
105	NC_017042	TTTCT	2	10	154198	154207	0 %	80 %	0 %	20 %	383481019
106	NC_017042	ATTTA	2	10	154610	154619	40 %	60 %	0 %	0 %	383481020
107	NC_017042	AAAAG	2	10	155386	155395	80 %	0 %	20 %	0 %	383481020
108	NC_017042	GGGTT	2	10	155596	155605	0 %	40 %	60 %	0 %	383481020
109	NC_017042	TTTAT	2	10	155972	155981	20 %	80 %	0 %	0 %	383481020
110	NC_017042	GCTTA	2	10	157158	157167	20 %	40 %	20 %	20 %	383481021
111	NC_017042	ACAAT	2	10	157522	157531	60 %	20 %	0 %	20 %	383481022
112	NC_017042	GTTAT	2	10	158147	158156	20 %	60 %	20 %	0 %	383481023
113	NC_017042	GTAGA	2	10	158453	158462	40 %	20 %	40 %	0 %	383481023
114	NC_017042	CAATG	2	10	160806	160815	40 %	20 %	20 %	20 %	383481024
115	NC_017042	ATAAA	2	10	161269	161278	80 %	20 %	0 %	0 %	383481025
116	NC_017042	ATTAA	2	10	161978	161987	60 %	40 %	0 %	0 %	383481025
117	NC_017042	GAAAA	2	10	162526	162535	80 %	0 %	20 %	0 %	383481026
118	NC_017042	CGCAT	3	15	170532	170546	20 %	20 %	20 %	40 %	383481035
119	NC_017042	TTGAT	2	10	175964	175973	20 %	60 %	20 %	0 %	383481039
120	NC_017042	ATTTA	2	10	177663	177672	40 %	60 %	0 %	0 %	383481041
121	NC_017042	TCAAA	2	10	179320	179329	60 %	20 %	0 %	20 %	383481043
122	NC_017042	TTAAT	2	10	180110	180119	40 %	60 %	0 %	0 %	383481044
123	NC_017042	AAACT	2	10	182681	182690	60 %	20 %	0 %	20 %	383481046
124	NC_017042	TTAGT	2	10	183032	183041	20 %	60 %	20 %	0 %	383481047
125	NC_017042	TTATT	2	10	183526	183535	20 %	80 %	0 %	0 %	383481047
126	NC_017042	CCAAA	2	10	185472	185481	60 %	0 %	0 %	40 %	383481050
127	NC_017042	CGGAT	2	10	186022	186031	20 %	20 %	40 %	20 %	383481051
128	NC_017042	ATTAT	2	10	187716	187725	40 %	60 %	0 %	0 %	383481053
129	NC_017042	TAGTT	2	10	188996	189005	20 %	60 %	20 %	0 %	383481053
130	NC_017042	GCAAA	2	10	193614	193623	60 %	0 %	20 %	20 %	383481054
131	NC_017042	TTATA	2	10	199223	199232	40 %	60 %	0 %	0 %	383481059
132	NC_017042	ATAAA	2	10	199525	199534	80 %	20 %	0 %	0 %	383481059
133	NC_017042	AAGTA	2	10	200131	200140	60 %	20 %	20 %	0 %	383481060
134	NC_017042	ATTCG	2	10	201964	201973	20 %	40 %	20 %	20 %	383481063
135	NC_017042	TAAAA	2	10	202304	202313	80 %	20 %	0 %	0 %	383481064
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