MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rhipicephali str. 3-7-female6-CWPP chromosome

Total Repeats: 2838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017042	TATT	2	8	47	54	25 %	75 %	0 %	0 %	383480871
2	NC_017042	ACAT	2	8	903	910	50 %	25 %	0 %	25 %	383480872
3	NC_017042	TAAA	2	8	962	969	75 %	25 %	0 %	0 %	383480872
4	NC_017042	TAAA	2	8	1902	1909	75 %	25 %	0 %	0 %	383480874
5	NC_017042	TTAG	2	8	2012	2019	25 %	50 %	25 %	0 %	383480874
6	NC_017042	ATAC	3	12	2120	2131	50 %	25 %	0 %	25 %	383480874
7	NC_017042	GATT	2	8	2377	2384	25 %	50 %	25 %	0 %	383480874
8	NC_017042	TAAT	2	8	2427	2434	50 %	50 %	0 %	0 %	383480874
9	NC_017042	ATAA	2	8	2448	2455	75 %	25 %	0 %	0 %	383480874
10	NC_017042	ATGC	2	8	3134	3141	25 %	25 %	25 %	25 %	383480875
11	NC_017042	ATAG	2	8	3548	3555	50 %	25 %	25 %	0 %	383480876
12	NC_017042	ATAA	2	8	3898	3905	75 %	25 %	0 %	0 %	383480877
13	NC_017042	ATTT	2	8	4382	4389	25 %	75 %	0 %	0 %	383480877
14	NC_017042	ATTT	2	8	6025	6032	25 %	75 %	0 %	0 %	383480878
15	NC_017042	TAAT	2	8	7246	7253	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
16	NC_017042	GATT	2	8	7608	7615	25 %	50 %	25 %	0 %	383480881
17	NC_017042	TACC	2	8	7908	7915	25 %	25 %	0 %	50 %	383480881
18	NC_017042	TTCC	2	8	7954	7961	0 %	50 %	0 %	50 %	383480881
19	NC_017042	AATA	2	8	8315	8322	75 %	25 %	0 %	0 %	383480881
20	NC_017042	TTTA	2	8	8330	8337	25 %	75 %	0 %	0 %	383480881
21	NC_017042	TTAA	2	8	8505	8512	50 %	50 %	0 %	0 %	383480881
22	NC_017042	ACCC	2	8	9362	9369	25 %	0 %	0 %	75 %	383480881
23	NC_017042	TAAA	2	8	9837	9844	75 %	25 %	0 %	0 %	383480882
24	NC_017042	CGAA	2	8	9961	9968	50 %	0 %	25 %	25 %	383480882
25	NC_017042	GAAC	2	8	9971	9978	50 %	0 %	25 %	25 %	383480882
26	NC_017042	TTTC	2	8	10330	10337	0 %	75 %	0 %	25 %	383480883
27	NC_017042	TAGC	2	8	10361	10368	25 %	25 %	25 %	25 %	383480883
28	NC_017042	ACCT	2	8	10475	10482	25 %	25 %	0 %	50 %	383480883
29	NC_017042	GGAT	2	8	10518	10525	25 %	25 %	50 %	0 %	383480883
30	NC_017042	GAAA	2	8	11393	11400	75 %	0 %	25 %	0 %	383480884
31	NC_017042	CATC	2	8	11642	11649	25 %	25 %	0 %	50 %	383480885
32	NC_017042	TTCC	2	8	12166	12173	0 %	50 %	0 %	50 %	383480886
33	NC_017042	TTAT	2	8	13404	13411	25 %	75 %	0 %	0 %	383480888
34	NC_017042	TTGA	2	8	14902	14909	25 %	50 %	25 %	0 %	383480888
35	NC_017042	GAAG	2	8	15362	15369	50 %	0 %	50 %	0 %	383480889
36	NC_017042	AGCA	2	8	15615	15622	50 %	0 %	25 %	25 %	383480889
37	NC_017042	CGGT	2	8	15960	15967	0 %	25 %	50 %	25 %	383480889
38	NC_017042	GAAA	2	8	18101	18108	75 %	0 %	25 %	0 %	383480891
39	NC_017042	AAAG	2	8	18356	18363	75 %	0 %	25 %	0 %	383480891
40	NC_017042	GTAG	2	8	19441	19448	25 %	25 %	50 %	0 %	383480892
41	NC_017042	TTAT	2	8	19487	19494	25 %	75 %	0 %	0 %	383480892
42	NC_017042	TTTC	2	8	20573	20580	0 %	75 %	0 %	25 %	383480893
43	NC_017042	ATAA	2	8	21213	21220	75 %	25 %	0 %	0 %	383480893
44	NC_017042	GGTA	2	8	21261	21268	25 %	25 %	50 %	0 %	383480893
45	NC_017042	AAAT	2	8	21405	21412	75 %	25 %	0 %	0 %	383480893
46	NC_017042	AATG	2	8	21433	21440	50 %	25 %	25 %	0 %	383480893
47	NC_017042	GTAA	2	8	21642	21649	50 %	25 %	25 %	0 %	383480893
48	NC_017042	GATA	2	8	22565	22572	50 %	25 %	25 %	0 %	383480895
49	NC_017042	TCAT	2	8	23066	23073	25 %	50 %	0 %	25 %	383480895
50	NC_017042	AGTT	2	8	23122	23129	25 %	50 %	25 %	0 %	383480895
51	NC_017042	TCAT	2	8	23213	23220	25 %	50 %	0 %	25 %	383480895
52	NC_017042	AATT	2	8	24052	24059	50 %	50 %	0 %	0 %	383480896
53	NC_017042	TTAT	2	8	25674	25681	25 %	75 %	0 %	0 %	383480898
54	NC_017042	TAAA	2	8	26113	26120	75 %	25 %	0 %	0 %	383480899
55	NC_017042	CAAT	2	8	26653	26660	50 %	25 %	0 %	25 %	383480899
56	NC_017042	ATTT	2	8	26974	26981	25 %	75 %	0 %	0 %	383480899
57	NC_017042	TAAA	2	8	27418	27425	75 %	25 %	0 %	0 %	383480899
58	NC_017042	TGCT	2	8	28267	28274	0 %	50 %	25 %	25 %	383480900
59	NC_017042	CTAT	2	8	28627	28634	25 %	50 %	0 %	25 %	383480901
60	NC_017042	TTGC	2	8	28770	28777	0 %	50 %	25 %	25 %	383480901
61	NC_017042	ATTA	2	8	28854	28861	50 %	50 %	0 %	0 %	383480901
62	NC_017042	ATTA	2	8	28971	28978	50 %	50 %	0 %	0 %	383480901
63	NC_017042	ATTT	2	8	29000	29007	25 %	75 %	0 %	0 %	383480901
64	NC_017042	TTCT	2	8	29813	29820	0 %	75 %	0 %	25 %	383480901
65	NC_017042	TATT	2	8	30043	30050	25 %	75 %	0 %	0 %	383480901
66	NC_017042	TCTT	2	8	30093	30100	0 %	75 %	0 %	25 %	383480901
67	NC_017042	TAAT	2	8	30137	30144	50 %	50 %	0 %	0 %	383480901
68	NC_017042	CATT	2	8	30570	30577	25 %	50 %	0 %	25 %	383480902
69	NC_017042	AAGC	2	8	30796	30803	50 %	0 %	25 %	25 %	383480902
70	NC_017042	ATGC	2	8	31091	31098	25 %	25 %	25 %	25 %	383480902
71	NC_017042	TCTT	2	8	31583	31590	0 %	75 %	0 %	25 %	383480903
72	NC_017042	TATC	2	8	31793	31800	25 %	50 %	0 %	25 %	383480904
73	NC_017042	AATA	2	8	31813	31820	75 %	25 %	0 %	0 %	383480904
74	NC_017042	TTTA	2	8	35752	35759	25 %	75 %	0 %	0 %	383480907
75	NC_017042	GATA	2	8	35762	35769	50 %	25 %	25 %	0 %	383480907
76	NC_017042	ATTT	2	8	36267	36274	25 %	75 %	0 %	0 %	383480908
77	NC_017042	TATT	2	8	36591	36598	25 %	75 %	0 %	0 %	383480908
78	NC_017042	AACA	2	8	36890	36897	75 %	0 %	0 %	25 %	383480908
79	NC_017042	AGTA	2	8	36904	36911	50 %	25 %	25 %	0 %	383480908
80	NC_017042	AGTA	2	8	37919	37926	50 %	25 %	25 %	0 %	383480909
81	NC_017042	CTTT	2	8	37986	37993	0 %	75 %	0 %	25 %	383480909
82	NC_017042	TGCT	2	8	38195	38202	0 %	50 %	25 %	25 %	383480910
83	NC_017042	TTAT	2	8	39837	39844	25 %	75 %	0 %	0 %	383480912
84	NC_017042	TAAG	2	8	40086	40093	50 %	25 %	25 %	0 %	383480912
85	NC_017042	AGGC	2	8	40382	40389	25 %	0 %	50 %	25 %	383480913
86	NC_017042	ATTC	2	8	40624	40631	25 %	50 %	0 %	25 %	383480913
87	NC_017042	CTAT	2	8	40640	40647	25 %	50 %	0 %	25 %	383480913
88	NC_017042	CAAA	2	8	40671	40678	75 %	0 %	0 %	25 %	383480913
89	NC_017042	TAAA	2	8	40869	40876	75 %	25 %	0 %	0 %	383480914
90	NC_017042	ATTG	2	8	41377	41384	25 %	50 %	25 %	0 %	383480914
91	NC_017042	TAAA	2	8	41789	41796	75 %	25 %	0 %	0 %	383480914
92	NC_017042	TAAT	2	8	41892	41899	50 %	50 %	0 %	0 %	383480914
93	NC_017042	TTAT	2	8	41912	41919	25 %	75 %	0 %	0 %	383480914
94	NC_017042	GGCA	2	8	44730	44737	25 %	0 %	50 %	25 %	383480915
95	NC_017042	CTTA	2	8	44901	44908	25 %	50 %	0 %	25 %	383480915
96	NC_017042	ATAA	2	8	46197	46204	75 %	25 %	0 %	0 %	383480916
97	NC_017042	AAAT	2	8	46301	46308	75 %	25 %	0 %	0 %	383480917
98	NC_017042	AATT	2	8	46553	46560	50 %	50 %	0 %	0 %	383480917
99	NC_017042	GCAG	2	8	47061	47068	25 %	0 %	50 %	25 %	383480917
100	NC_017042	TAAT	2	8	47107	47114	50 %	50 %	0 %	0 %	383480917
101	NC_017042	AATA	2	8	47180	47187	75 %	25 %	0 %	0 %	383480917
102	NC_017042	AAAT	2	8	47249	47256	75 %	25 %	0 %	0 %	383480917
103	NC_017042	AAGT	2	8	47936	47943	50 %	25 %	25 %	0 %	383480919
104	NC_017042	TCTT	2	8	48146	48153	0 %	75 %	0 %	25 %	383480920
105	NC_017042	TATT	2	8	48407	48414	25 %	75 %	0 %	0 %	383480920
106	NC_017042	AACT	2	8	48525	48532	50 %	25 %	0 %	25 %	383480920
107	NC_017042	ATTT	2	8	48551	48558	25 %	75 %	0 %	0 %	383480920
108	NC_017042	ATAA	2	8	48971	48978	75 %	25 %	0 %	0 %	383480921
109	NC_017042	TTGC	2	8	49898	49905	0 %	50 %	25 %	25 %	383480922
110	NC_017042	TTAT	2	8	51040	51047	25 %	75 %	0 %	0 %	383480924
111	NC_017042	CAAA	2	8	51504	51511	75 %	0 %	0 %	25 %	383480925
112	NC_017042	TTTG	2	8	52027	52034	0 %	75 %	25 %	0 %	383480926
113	NC_017042	TTAA	2	8	53163	53170	50 %	50 %	0 %	0 %	383480927
114	NC_017042	ATTG	2	8	53337	53344	25 %	50 %	25 %	0 %	383480927
115	NC_017042	GCTT	2	8	53346	53353	0 %	50 %	25 %	25 %	383480927
116	NC_017042	ATTG	2	8	53749	53756	25 %	50 %	25 %	0 %	383480928
117	NC_017042	TAAC	2	8	53825	53832	50 %	25 %	0 %	25 %	383480928
118	NC_017042	TTTA	2	8	54075	54082	25 %	75 %	0 %	0 %	383480928
119	NC_017042	ATTA	2	8	54171	54178	50 %	50 %	0 %	0 %	383480928
120	NC_017042	GATA	2	8	55398	55405	50 %	25 %	25 %	0 %	383480929
121	NC_017042	TTTC	2	8	55421	55428	0 %	75 %	0 %	25 %	383480929
122	NC_017042	CGTA	2	8	55699	55706	25 %	25 %	25 %	25 %	383480929
123	NC_017042	ATAA	2	8	55777	55784	75 %	25 %	0 %	0 %	383480929
124	NC_017042	AAGC	2	8	56333	56340	50 %	0 %	25 %	25 %	383480930
125	NC_017042	GTTT	2	8	56532	56539	0 %	75 %	25 %	0 %	383480930
126	NC_017042	ATGA	2	8	56935	56942	50 %	25 %	25 %	0 %	383480930
127	NC_017042	TGAG	2	8	56987	56994	25 %	25 %	50 %	0 %	383480930
128	NC_017042	CAAA	2	8	57108	57115	75 %	0 %	0 %	25 %	383480931
129	NC_017042	TTGC	2	8	57330	57337	0 %	50 %	25 %	25 %	383480931
130	NC_017042	TAAT	2	8	57402	57409	50 %	50 %	0 %	0 %	383480931
131	NC_017042	TTAT	3	12	58275	58286	25 %	75 %	0 %	0 %	383480933
132	NC_017042	AGAA	2	8	59127	59134	75 %	0 %	25 %	0 %	383480934
133	NC_017042	ATTT	2	8	59388	59395	25 %	75 %	0 %	0 %	383480934
134	NC_017042	TAAA	2	8	59844	59851	75 %	25 %	0 %	0 %	383480934
135	NC_017042	ATAG	2	8	60691	60698	50 %	25 %	25 %	0 %	383480935
136	NC_017042	AGGA	2	8	61046	61053	50 %	0 %	50 %	0 %	383480935
137	NC_017042	TAAT	2	8	61508	61515	50 %	50 %	0 %	0 %	383480935
138	NC_017042	GAAA	2	8	61611	61618	75 %	0 %	25 %	0 %	383480935
139	NC_017042	TATC	2	8	61832	61839	25 %	50 %	0 %	25 %	383480935
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