MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack plasmid pMC5_1

Total Repeats: 15

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017041	CAGTAA	2	12	7066	7077	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017041	ATTATA	2	12	7615	7626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017041	TGGCAT	2	12	7996	8007	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383479193
4	NC_017041	GATGTA	2	12	10984	10995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479195
5	NC_017041	ATTATA	2	12	11644	11655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017041	ATTATC	2	12	11908	11919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017041	AATTAA	2	12	14994	15005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479196
8	NC_017041	AAACGG	2	12	17204	17215	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383479199
9	NC_017041	CTGTAA	2	12	18017	18028	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383479200
10	NC_017041	TTAATA	2	12	18513	18524	50 %	50 %	0 %	0 %	383479202
11	NC_017041	TATAGC	2	12	20544	20555	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383479205
12	NC_017041	TAATGA	2	12	21765	21776	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383479205
13	NC_017041	ATAATT	2	12	23357	23368	50 %	50 %	0 %	0 %	383479205
14	NC_017041	GGTATT	2	12	23632	23643	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383479205
15	NC_017041	AAGAGC	2	12	23774	23785	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383479205

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.