MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack plasmid pMC5_1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017041	TTGTT	2	10	1128	1137	0 %	80 %	20 %	0 %	383479187
2	NC_017041	TATGA	2	10	1692	1701	40 %	40 %	20 %	0 %	383479188
3	NC_017041	GTATG	2	10	1935	1944	20 %	40 %	40 %	0 %	383479188
4	NC_017041	AAGAA	2	10	2920	2929	80 %	0 %	20 %	0 %	383479188
5	NC_017041	ATAAA	2	10	3763	3772	80 %	20 %	0 %	0 %	383479188
6	NC_017041	TAAAT	2	10	4160	4169	60 %	40 %	0 %	0 %	383479188
7	NC_017041	TCTTT	2	10	4331	4340	0 %	80 %	0 %	20 %	383479188
8	NC_017041	CAAAA	2	10	5629	5638	80 %	0 %	0 %	20 %	383479188
9	NC_017041	TGCGT	2	10	7832	7841	0 %	40 %	40 %	20 %	383479192
10	NC_017041	AAAAT	2	10	8115	8124	80 %	20 %	0 %	0 %	383479193
11	NC_017041	TATAT	2	10	8315	8324	40 %	60 %	0 %	0 %	383479193
12	NC_017041	CTTTT	2	10	8676	8685	0 %	80 %	0 %	20 %	383479194
13	NC_017041	GATTT	2	10	9416	9425	20 %	60 %	20 %	0 %	383479195
14	NC_017041	AAGAA	2	10	9735	9744	80 %	0 %	20 %	0 %	383479195
15	NC_017041	ATGAG	2	10	15743	15752	40 %	20 %	40 %	0 %	383479197
16	NC_017041	TAAAA	2	10	16610	16619	80 %	20 %	0 %	0 %	383479198
17	NC_017041	CTTTG	2	10	18863	18872	0 %	60 %	20 %	20 %	383479203
18	NC_017041	GTGAG	2	10	20054	20063	20 %	20 %	60 %	0 %	383479205
19	NC_017041	AGCTA	2	10	21552	21561	40 %	20 %	20 %	20 %	383479205
20	NC_017041	TAAAG	2	10	22530	22539	60 %	20 %	20 %	0 %	383479205

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.