MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack plasmid pMC5_1

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017041	A	6	6	235	240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017041	T	6	6	732	737	0 %	100 %	0 %	0 %	383479186
3	NC_017041	T	6	6	742	747	0 %	100 %	0 %	0 %	383479186
4	NC_017041	T	6	6	971	976	0 %	100 %	0 %	0 %	383479186
5	NC_017041	T	8	8	1192	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	383479187
6	NC_017041	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017041	A	6	6	1763	1768	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
8	NC_017041	T	6	6	1809	1814	0 %	100 %	0 %	0 %	383479188
9	NC_017041	A	6	6	1904	1909	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
10	NC_017041	A	7	7	2207	2213	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
11	NC_017041	A	6	6	2316	2321	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
12	NC_017041	A	6	6	2343	2348	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
13	NC_017041	A	6	6	2742	2747	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
14	NC_017041	A	6	6	3114	3119	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
15	NC_017041	A	7	7	4302	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
16	NC_017041	A	8	8	4403	4410	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
17	NC_017041	A	7	7	4671	4677	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
18	NC_017041	A	6	6	4960	4965	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
19	NC_017041	A	7	7	5406	5412	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
20	NC_017041	A	7	7	5904	5910	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
21	NC_017041	A	7	7	5999	6005	100 %	0 %	0 %	0 %	383479188
22	NC_017041	T	7	7	6223	6229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017041	T	7	7	6329	6335	0 %	100 %	0 %	0 %	383479189
24	NC_017041	T	6	6	6412	6417	0 %	100 %	0 %	0 %	383479189
25	NC_017041	T	7	7	7059	7065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017041	A	6	6	7124	7129	100 %	0 %	0 %	0 %	383479191
27	NC_017041	T	6	6	7233	7238	0 %	100 %	0 %	0 %	383479191
28	NC_017041	T	6	6	7582	7587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017041	T	6	6	7876	7881	0 %	100 %	0 %	0 %	383479192
30	NC_017041	A	6	6	8340	8345	100 %	0 %	0 %	0 %	383479193
31	NC_017041	T	7	7	8362	8368	0 %	100 %	0 %	0 %	383479193
32	NC_017041	T	6	6	8386	8391	0 %	100 %	0 %	0 %	383479193
33	NC_017041	T	8	8	8416	8423	0 %	100 %	0 %	0 %	383479193
34	NC_017041	T	7	7	8426	8432	0 %	100 %	0 %	0 %	383479193
35	NC_017041	T	7	7	8526	8532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017041	T	6	6	9057	9062	0 %	100 %	0 %	0 %	383479195
37	NC_017041	A	6	6	9530	9535	100 %	0 %	0 %	0 %	383479195
38	NC_017041	T	6	6	9820	9825	0 %	100 %	0 %	0 %	383479195
39	NC_017041	A	6	6	10225	10230	100 %	0 %	0 %	0 %	383479195
40	NC_017041	A	7	7	11433	11439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017041	A	6	6	11685	11690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017041	A	6	6	12961	12966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017041	T	7	7	12992	12998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017041	T	7	7	13036	13042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017041	A	6	6	13732	13737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017041	A	7	7	14658	14664	100 %	0 %	0 %	0 %	383479196
47	NC_017041	T	6	6	14965	14970	0 %	100 %	0 %	0 %	383479196
48	NC_017041	T	6	6	15522	15527	0 %	100 %	0 %	0 %	383479197
49	NC_017041	T	6	6	16051	16056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017041	T	6	6	17153	17158	0 %	100 %	0 %	0 %	383479199
51	NC_017041	A	6	6	18641	18646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017041	T	6	6	19006	19011	0 %	100 %	0 %	0 %	383479203
53	NC_017041	A	6	6	19166	19171	100 %	0 %	0 %	0 %	383479204
54	NC_017041	T	6	6	19345	19350	0 %	100 %	0 %	0 %	383479204
55	NC_017041	A	7	7	19700	19706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017041	A	6	6	20030	20035	100 %	0 %	0 %	0 %	383479205
57	NC_017041	A	7	7	20069	20075	100 %	0 %	0 %	0 %	383479205
58	NC_017041	A	6	6	23786	23791	100 %	0 %	0 %	0 %	383479205

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.