MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	AGTGTA	2	12	21881	21892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017040	ACTAAT	2	12	21909	21920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017040	TATTTT	2	12	58525	58536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017040	AGTGTA	2	12	78492	78503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017040	ACTAAT	2	12	78520	78531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017040	TTCGGG	2	12	79462	79473	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017040	ATAAAA	2	12	106608	106619	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017040	CAGCAA	2	12	109516	109527	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017040	GTAAAA	2	12	114182	114193	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017040	AGATAA	2	12	121142	121153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017040	AGATAA	2	12	133966	133977	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017040	CTTTAT	2	12	159660	159671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017040	CTCTTT	2	12	161524	161535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017040	TGACAC	2	12	188388	188399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017040	CAGTTC	2	12	193029	193040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017040	TTTAAA	2	12	194877	194888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017040	AGTGTA	2	12	267761	267772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017040	ACTAAT	2	12	267789	267800	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017040	TTAAAA	2	12	288169	288180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017040	TTTAAT	2	12	305248	305259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017040	TTTTAG	2	12	316603	316614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017040	GGTTGA	2	12	320677	320688	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017040	GAAGTC	2	12	356239	356250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017040	ATTTAA	2	12	374271	374282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017040	AGAAAT	2	12	408289	408300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017040	ATTTTA	2	12	439567	439578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017040	GAGTAA	2	12	445356	445367	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017040	TAAAAA	2	12	461218	461229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017040	AGGACT	2	12	466340	466351	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017040	TAAAAA	2	12	485762	485773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017040	AAAAGA	2	12	485945	485956	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017040	CCTTGT	2	12	563504	563515	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017040	TAAATA	2	12	677494	677505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017040	AGGTAA	2	12	688295	688306	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017040	TTCGGG	2	12	724359	724370	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017040	GAAAAA	2	12	778158	778169	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017040	GAAAAG	2	12	809241	809252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017040	TTAAAA	2	12	840675	840686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017040	TAACAA	2	12	893061	893072	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017040	TTTAAA	2	12	954928	954939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017040	GACTTC	2	12	973789	973800	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017040	GAAATC	2	12	974212	974223	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017040	TTGTTT	2	12	992556	992567	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017040	ATATGA	2	12	1019072	1019083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017040	AGTCTT	2	12	1035116	1035127	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017040	TCTTTT	2	12	1062389	1062400	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017040	CCTTGG	2	12	1094394	1094405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017040	TGACTT	2	12	1117545	1117556	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017040	ATGATA	2	12	1124052	1124063	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017040	CTTAAG	2	12	1141751	1141762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017040	TCCTTC	2	12	1203056	1203067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017040	TATTAG	2	12	1208532	1208543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017040	TACACT	2	12	1208561	1208572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017040	GAAAAA	2	12	1214027	1214038	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017040	CAATTC	2	12	1233115	1233126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017040	TATTTT	2	12	1234186	1234197	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017040	AATACC	2	12	1243203	1243214	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017040	CTTTTC	2	12	1293591	1293602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017040	CTAGTC	2	12	1395872	1395883	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017040	TTGCTT	2	12	1399627	1399638	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017040	AATATT	2	12	1414481	1414492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017040	TATCAC	2	12	1424977	1424988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017040	TTAAAT	2	12	1426210	1426221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017040	TTGCTT	2	12	1433974	1433985	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017040	TAACAA	2	12	1447918	1447929	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017040	TTTTTC	2	12	1450305	1450316	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017040	AGAAAA	2	12	1453001	1453012	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017040	TATTAG	2	12	1459321	1459332	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017040	TACACT	2	12	1459350	1459361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017040	AATGAT	2	12	1473081	1473092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017040	AAATCA	2	12	1474367	1474378	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017040	GTTAAA	2	12	1474473	1474484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017040	ATGTTT	2	12	1486870	1486881	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017040	CCTTTA	2	12	1600897	1600908	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017040	TTATCA	2	12	1652330	1652341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017040	ATTTTA	2	12	1654086	1654097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017040	TTTTCA	2	12	1674767	1674778	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017040	TAAAAA	2	12	1686747	1686758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017040	AATTTA	3	18	1698180	1698197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017040	GAAAAA	2	12	1746376	1746387	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.