MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	ACATT	2	10	16523	16532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017040	TCGTG	2	10	18143	18152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017040	GTTAA	2	10	19038	19047	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017040	GGGAG	2	10	19557	19566	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017040	AGGGA	2	10	21768	21777	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017040	GCTTA	2	10	22134	22143	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017040	TTCTT	2	10	23965	23974	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017040	CTTTT	4	20	24071	24090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017040	TATAA	2	10	26507	26516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017040	ATTTT	2	10	55015	55024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017040	AAATA	2	10	56282	56291	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017040	TATAT	2	10	56367	56376	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017040	AAGGA	2	10	64225	64234	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017040	GTTTC	2	10	71494	71503	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017040	TCGTG	2	10	74755	74764	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017040	GTTAA	2	10	75649	75658	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017040	GGGAG	2	10	76168	76177	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017040	AGGGA	2	10	78379	78388	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017040	GCTTA	2	10	78745	78754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017040	ATTAT	2	10	79035	79044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017040	TATAT	2	10	79118	79127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017040	TAGTT	2	10	104620	104629	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017040	TTAAG	2	10	109371	109380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017040	TAGGT	2	10	109994	110003	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017040	TAAAT	2	10	110127	110136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017040	GAGAG	2	10	111164	111173	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017040	TTGGC	2	10	133592	133601	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017040	AAGCT	2	10	153041	153050	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017040	CATAA	2	10	153096	153105	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017040	CTTTT	2	10	154290	154299	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017040	CTTGT	2	10	156611	156620	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017040	CGTCA	2	10	159423	159432	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017040	AACAA	2	10	161162	161171	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017040	AAAAG	2	10	175650	175659	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017040	TCTAA	2	10	189892	189901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017040	TTAAA	2	10	194675	194684	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017040	TGTCT	2	10	203792	203801	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017040	TAAGA	2	10	205310	205319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017040	GTAAA	2	10	208452	208461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017040	CCTTT	2	10	217570	217579	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017040	GTTCA	2	10	225669	225678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017040	TCATT	2	10	255396	255405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017040	TTGTA	2	10	262019	262028	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017040	TCGTG	2	10	264023	264032	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017040	GTTAA	2	10	264918	264927	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017040	GGGAG	2	10	265437	265446	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017040	AGGGA	2	10	267648	267657	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017040	AAAAG	2	10	268313	268322	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017040	CAAAA	2	10	269092	269101	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017040	TTATC	2	10	269112	269121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017040	GTTAT	2	10	277488	277497	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017040	ATTAT	2	10	282208	282217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017040	TGTGT	2	10	295460	295469	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017040	AAAAG	2	10	303856	303865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017040	TGCTA	2	10	315092	315101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017040	CAGGG	2	10	315112	315121	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017040	TAAAA	2	10	320757	320766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017040	ACAAG	2	10	338479	338488	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017040	TTGAT	2	10	345211	345220	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017040	TGAAA	2	10	354184	354193	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017040	TTATA	2	10	356384	356393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017040	AGAAA	2	10	356525	356534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017040	TGAAA	2	10	356758	356767	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017040	AGAAA	2	10	357490	357499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017040	TGAAA	2	10	357728	357737	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017040	TGAAA	2	10	360314	360323	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017040	TTAAA	2	10	361191	361200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017040	TAAAA	2	10	361795	361804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017040	TATCA	2	10	364259	364268	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017040	TATAG	2	10	366518	366527	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017040	TGAGA	2	10	369080	369089	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017040	TTGAT	2	10	369103	369112	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017040	TTTAT	2	10	378665	378674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017040	AAATC	2	10	382420	382429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017040	AGAAA	2	10	384206	384215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017040	AAGGA	2	10	392886	392895	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017040	ACTCT	2	10	395133	395142	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017040	AAGTA	2	10	395837	395846	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017040	AGAGT	2	10	395953	395962	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017040	AATGT	2	10	396180	396189	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017040	TAGAG	2	10	398407	398416	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017040	AAAGC	2	10	402209	402218	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017040	TGGCT	2	10	406619	406628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017040	AGCTT	2	10	426873	426882	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017040	TTTTC	2	10	426917	426926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017040	TTATT	2	10	459983	459992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017040	TCCTT	2	10	479123	479132	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017040	GTTAT	2	10	482370	482379	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017040	TTTCC	2	10	483937	483946	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017040	AGAAA	2	10	484075	484084	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017040	TTAGT	2	10	488490	488499	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017040	TATAA	2	10	489520	489529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017040	TAAAA	2	10	491916	491925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017040	CTTTT	2	10	498811	498820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017040	ATGGG	2	10	502217	502226	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017040	TTTAG	2	10	502260	502269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017040	TAGAA	2	10	503959	503968	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017040	TAAAA	2	10	504566	504575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017040	TTTCC	2	10	510333	510342	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017040	AAAAG	2	10	510343	510352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017040	TGATC	2	10	517850	517859	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017040	AGCTG	2	10	519063	519072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017040	GAATT	2	10	519148	519157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017040	ATAAA	2	10	520442	520451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017040	TTTTG	2	10	523311	523320	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017040	AAGCC	2	10	524298	524307	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017040	TGATA	2	10	533929	533938	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017040	ACGTA	2	10	543601	543610	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017040	TAAAT	2	10	544268	544277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017040	TATAT	2	10	563345	563354	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017040	AAAAG	2	10	572316	572325	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017040	ATAAA	2	10	576152	576161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017040	GAATA	2	10	579507	579516	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017040	ATAGA	2	10	588628	588637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017040	AGCAC	2	10	595261	595270	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017040	TATAA	2	10	596346	596355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017040	AGCAT	2	10	605025	605034	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017040	GAAAG	2	10	608278	608287	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017040	ATTTA	2	10	641959	641968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017040	AAAGA	2	10	645044	645053	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017040	TCTTT	2	10	645098	645107	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017040	AAATA	2	10	645125	645134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017040	TTCGG	2	10	656228	656237	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017040	AAAAG	2	10	658125	658134	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017040	TGAAA	2	10	658749	658758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017040	AGATT	2	10	658759	658768	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017040	TTTTA	2	10	677195	677204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017040	ATGTT	2	10	682089	682098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017040	AAAGG	2	10	705874	705883	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017040	ATTGA	2	10	705901	705910	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017040	ATGTT	2	10	711047	711056	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017040	TCTTA	2	10	712735	712744	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017040	CTAAT	2	10	724402	724411	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017040	ATAAA	2	10	728789	728798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017040	GGAAA	2	10	744713	744722	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017040	TAAGG	2	10	758002	758011	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017040	CACCT	2	10	760225	760234	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_017040	ATGAT	2	10	770410	770419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017040	TAGAA	2	10	777875	777884	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017040	ATTTA	2	10	778237	778246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017040	AACAA	10	50	787170	787219	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017040	ATAAA	2	10	790310	790319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017040	TAAAA	2	10	800173	800182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017040	AATGT	2	10	800843	800852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017040	AATAA	2	10	806548	806557	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017040	AGTGT	2	10	807825	807834	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017040	TCAAA	2	10	826003	826012	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017040	CAAAA	2	10	856991	857000	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017040	TAAGA	2	10	862951	862960	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017040	CTTGT	2	10	870104	870113	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017040	AGTTG	2	10	875630	875639	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017040	ATAAA	2	10	882578	882587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017040	AATTG	2	10	897086	897095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_017040	TCATA	2	10	910798	910807	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017040	CTTTG	2	10	926545	926554	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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291	NC_017040	TACTT	2	10	1734407	1734416	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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298	NC_017040	CTTTT	2	10	1748666	1748675	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.