MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 1049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017040	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	383479209
2	NC_017040	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	383479210
3	NC_017040	TGGTA	2	10	3603	3612	20 %	40 %	40 %	0 %	383479211
4	NC_017040	TCAAT	2	10	5115	5124	40 %	40 %	0 %	20 %	383479212
5	NC_017040	GATTT	2	10	6169	6178	20 %	60 %	20 %	0 %	383479213
6	NC_017040	TCAAT	2	10	11677	11686	40 %	40 %	0 %	20 %	383479218
7	NC_017040	ATTAA	2	10	11998	12007	60 %	40 %	0 %	0 %	383479218
8	NC_017040	TACAC	2	10	15946	15955	40 %	20 %	0 %	40 %	383479221
9	NC_017040	TAAAT	2	10	15956	15965	60 %	40 %	0 %	0 %	383479221
10	NC_017040	AGTGA	2	10	27254	27263	40 %	20 %	40 %	0 %	383479225
11	NC_017040	ATTTT	2	10	27953	27962	20 %	80 %	0 %	0 %	383479226
12	NC_017040	TTGAT	2	10	28142	28151	20 %	60 %	20 %	0 %	383479226
13	NC_017040	TGGTG	2	10	30227	30236	0 %	40 %	60 %	0 %	383479229
14	NC_017040	AGCAG	2	10	37475	37484	40 %	0 %	40 %	20 %	383479233
15	NC_017040	GGTCA	2	10	37839	37848	20 %	20 %	40 %	20 %	383479233
16	NC_017040	TTGGG	2	10	38235	38244	0 %	40 %	60 %	0 %	383479234
17	NC_017040	GCAGG	2	10	42315	42324	20 %	0 %	60 %	20 %	383479236
18	NC_017040	CTGCC	2	10	43279	43288	0 %	20 %	20 %	60 %	383479238
19	NC_017040	CTCAG	2	10	43672	43681	20 %	20 %	20 %	40 %	383479238
20	NC_017040	GCTTT	2	10	51029	51038	0 %	60 %	20 %	20 %	383479245
21	NC_017040	TTTTC	2	10	51227	51236	0 %	80 %	0 %	20 %	383479245
22	NC_017040	AAACC	2	10	51292	51301	60 %	0 %	0 %	40 %	383479245
23	NC_017040	ATGGT	2	10	53066	53075	20 %	40 %	40 %	0 %	383479246
24	NC_017040	ATTCA	2	10	53750	53759	40 %	40 %	0 %	20 %	383479246
25	NC_017040	TTTTA	2	10	57521	57530	20 %	80 %	0 %	0 %	383479248
26	NC_017040	AAAGC	2	10	57714	57723	60 %	0 %	20 %	20 %	383479248
27	NC_017040	TTTGG	2	10	61708	61717	0 %	60 %	40 %	0 %	383479255
28	NC_017040	TTCAC	2	10	62064	62073	20 %	40 %	0 %	40 %	383479256
29	NC_017040	GAAAT	2	10	63145	63154	60 %	20 %	20 %	0 %	383479258
30	NC_017040	TCCAA	2	10	68845	68854	40 %	20 %	0 %	40 %	383479270
31	NC_017040	CTTGG	2	10	83054	83063	0 %	40 %	40 %	20 %	383479282
32	NC_017040	TCTTA	2	10	83472	83481	20 %	60 %	0 %	20 %	383479282
33	NC_017040	CACTC	2	10	85017	85026	20 %	20 %	0 %	60 %	383479284
34	NC_017040	GATTG	2	10	87278	87287	20 %	40 %	40 %	0 %	383479285
35	NC_017040	TTGAT	2	10	97424	97433	20 %	60 %	20 %	0 %	383479290
36	NC_017040	AAATC	2	10	97592	97601	60 %	20 %	0 %	20 %	383479290
37	NC_017040	TGAAG	2	10	102908	102917	40 %	20 %	40 %	0 %	383479299
38	NC_017040	TTTAG	2	10	104767	104776	20 %	60 %	20 %	0 %	383479302
39	NC_017040	GTGTT	2	10	109171	109180	0 %	60 %	40 %	0 %	383479308
40	NC_017040	AAATC	2	10	111002	111011	60 %	20 %	0 %	20 %	383479309
41	NC_017040	GAAAA	2	10	117421	117430	80 %	0 %	20 %	0 %	383479314
42	NC_017040	GGGAA	2	10	121572	121581	40 %	0 %	60 %	0 %	383479318
43	NC_017040	GACCT	2	10	123027	123036	20 %	20 %	20 %	40 %	383479318
44	NC_017040	TCAGG	2	10	124332	124341	20 %	20 %	40 %	20 %	383479318
45	NC_017040	TTTTA	2	10	126214	126223	20 %	80 %	0 %	0 %	383479321
46	NC_017040	GCTTT	3	15	126790	126804	0 %	60 %	20 %	20 %	383479321
47	NC_017040	GTCAT	2	10	127109	127118	20 %	40 %	20 %	20 %	383479321
48	NC_017040	TAGTG	2	10	128052	128061	20 %	40 %	40 %	0 %	383479322
49	NC_017040	GTTAA	2	10	128455	128464	40 %	40 %	20 %	0 %	383479322
50	NC_017040	AATAA	2	10	128484	128493	80 %	20 %	0 %	0 %	383479322
51	NC_017040	TTGAT	2	10	129571	129580	20 %	60 %	20 %	0 %	383479323
52	NC_017040	TACCT	2	10	130974	130983	20 %	40 %	0 %	40 %	383479325
53	NC_017040	AATCA	2	10	131754	131763	60 %	20 %	0 %	20 %	383479326
54	NC_017040	TCATG	2	10	132361	132370	20 %	40 %	20 %	20 %	383479327
55	NC_017040	AACAA	2	10	133507	133516	80 %	0 %	0 %	20 %	383479328
56	NC_017040	CAAAA	2	10	134725	134734	80 %	0 %	0 %	20 %	383479330
57	NC_017040	GTCTT	2	10	134936	134945	0 %	60 %	20 %	20 %	383479330
58	NC_017040	TTTTA	2	10	135798	135807	20 %	80 %	0 %	0 %	383479330
59	NC_017040	AAAGC	2	10	136987	136996	60 %	0 %	20 %	20 %	383479332
60	NC_017040	AGTTC	2	10	137237	137246	20 %	40 %	20 %	20 %	383479332
61	NC_017040	GCTGA	2	10	137257	137266	20 %	20 %	40 %	20 %	383479332
62	NC_017040	ATCGC	2	10	140632	140641	20 %	20 %	20 %	40 %	383479335
63	NC_017040	TTGGG	2	10	142035	142044	0 %	40 %	60 %	0 %	383479336
64	NC_017040	GAAAA	2	10	147345	147354	80 %	0 %	20 %	0 %	383479341
65	NC_017040	GGATT	2	10	147462	147471	20 %	40 %	40 %	0 %	383479341
66	NC_017040	TTTTG	2	10	147982	147991	0 %	80 %	20 %	0 %	383479341
67	NC_017040	TCATG	2	10	149488	149497	20 %	40 %	20 %	20 %	383479343
68	NC_017040	GTATC	2	10	150749	150758	20 %	40 %	20 %	20 %	383479344
69	NC_017040	GTCGC	2	10	151188	151197	0 %	20 %	40 %	40 %	383479345
70	NC_017040	GCCTA	2	10	157327	157336	20 %	20 %	20 %	40 %	383479350
71	NC_017040	GCAAC	2	10	157544	157553	40 %	0 %	20 %	40 %	383479350
72	NC_017040	AAGGT	2	10	159226	159235	40 %	20 %	40 %	0 %	383479350
73	NC_017040	ATTTG	2	10	165510	165519	20 %	60 %	20 %	0 %	383479358
74	NC_017040	CAAGA	2	10	167432	167441	60 %	0 %	20 %	20 %	383479359
75	NC_017040	TTTGG	2	10	168601	168610	0 %	60 %	40 %	0 %	383479360
76	NC_017040	TGGAT	2	10	169550	169559	20 %	40 %	40 %	0 %	383479361
77	NC_017040	ACCTA	2	10	170622	170631	40 %	20 %	0 %	40 %	383479361
78	NC_017040	ATTTT	2	10	175486	175495	20 %	80 %	0 %	0 %	383479365
79	NC_017040	TCTAT	2	10	176474	176483	20 %	60 %	0 %	20 %	383479366
80	NC_017040	GTTTG	2	10	177014	177023	0 %	60 %	40 %	0 %	383479366
81	NC_017040	TGAAA	2	10	177189	177198	60 %	20 %	20 %	0 %	383479367
82	NC_017040	TTGAT	2	10	177437	177446	20 %	60 %	20 %	0 %	383479367
83	NC_017040	CCAAA	2	10	179785	179794	60 %	0 %	0 %	40 %	383479369
84	NC_017040	TCCCA	2	10	179987	179996	20 %	20 %	0 %	60 %	383479369
85	NC_017040	GCCAA	2	10	180834	180843	40 %	0 %	20 %	40 %	383479370
86	NC_017040	GGAAA	2	10	183784	183793	60 %	0 %	40 %	0 %	383479373
87	NC_017040	TAATC	2	10	186609	186618	40 %	40 %	0 %	20 %	383479377
88	NC_017040	TTTAC	2	10	190741	190750	20 %	60 %	0 %	20 %	383479381
89	NC_017040	CAAAC	2	10	193261	193270	60 %	0 %	0 %	40 %	383479383
90	NC_017040	AGATA	2	10	193375	193384	60 %	20 %	20 %	0 %	383479383
91	NC_017040	ATATA	2	10	194164	194173	60 %	40 %	0 %	0 %	383479383
92	NC_017040	TTTTG	2	10	198051	198060	0 %	80 %	20 %	0 %	383479387
93	NC_017040	ATCGC	2	10	199369	199378	20 %	20 %	20 %	40 %	383479389
94	NC_017040	TTTTA	2	10	200537	200546	20 %	80 %	0 %	0 %	383479390
95	NC_017040	CTAAT	2	10	200775	200784	40 %	40 %	0 %	20 %	383479390
96	NC_017040	GAATG	2	10	201298	201307	40 %	20 %	40 %	0 %	383479390
97	NC_017040	GACAG	2	10	203726	203735	40 %	0 %	40 %	20 %	383479392
98	NC_017040	CCTTC	2	10	205725	205734	0 %	40 %	0 %	60 %	383479394
99	NC_017040	TAAGA	2	10	205770	205779	60 %	20 %	20 %	0 %	383479394
100	NC_017040	TGGAT	2	10	207859	207868	20 %	40 %	40 %	0 %	383479396
101	NC_017040	CTTTT	2	10	208029	208038	0 %	80 %	0 %	20 %	383479396
102	NC_017040	GAGAA	2	10	209400	209409	60 %	0 %	40 %	0 %	383479397
103	NC_017040	GTTAT	2	10	210425	210434	20 %	60 %	20 %	0 %	383479398
104	NC_017040	AAGAT	2	10	210511	210520	60 %	20 %	20 %	0 %	383479398
105	NC_017040	AAATG	2	10	212059	212068	60 %	20 %	20 %	0 %	383479399
106	NC_017040	CAAAT	2	10	213204	213213	60 %	20 %	0 %	20 %	383479401
107	NC_017040	CTCAT	2	10	217649	217658	20 %	40 %	0 %	40 %	383479406
108	NC_017040	TTTTC	2	10	217869	217878	0 %	80 %	0 %	20 %	383479406
109	NC_017040	TTATT	2	10	218109	218118	20 %	80 %	0 %	0 %	383479406
110	NC_017040	TTGTC	2	10	219609	219618	0 %	60 %	20 %	20 %	383479408
111	NC_017040	GCAGC	2	10	223865	223874	20 %	0 %	40 %	40 %	383479412
112	NC_017040	ATTCC	2	10	225170	225179	20 %	40 %	0 %	40 %	383479414
113	NC_017040	GTCTC	2	10	225418	225427	0 %	40 %	20 %	40 %	383479414
114	NC_017040	AATCA	2	10	229713	229722	60 %	20 %	0 %	20 %	383479419
115	NC_017040	AGCTA	2	10	233385	233394	40 %	20 %	20 %	20 %	383479421
116	NC_017040	GAAAC	2	10	233833	233842	60 %	0 %	20 %	20 %	383479421
117	NC_017040	CCAAT	2	10	236205	236214	40 %	20 %	0 %	40 %	383479424
118	NC_017040	CAAGA	2	10	236979	236988	60 %	0 %	20 %	20 %	383479424
119	NC_017040	TTTGG	2	10	239967	239976	0 %	60 %	40 %	0 %	383479426
120	NC_017040	TTTTA	2	10	244471	244480	20 %	80 %	0 %	0 %	383479429
121	NC_017040	TGGTT	2	10	246409	246418	0 %	60 %	40 %	0 %	383479431
122	NC_017040	ATTAC	2	10	247804	247813	40 %	40 %	0 %	20 %	383479432
123	NC_017040	TGATT	2	10	248817	248826	20 %	60 %	20 %	0 %	383479433
124	NC_017040	CCAAT	2	10	249074	249083	40 %	20 %	0 %	40 %	383479433
125	NC_017040	GTGAT	2	10	250671	250680	20 %	40 %	40 %	0 %	383479435
126	NC_017040	GGTTC	2	10	254767	254776	0 %	40 %	40 %	20 %	383479438
127	NC_017040	ATAGT	2	10	254887	254896	40 %	40 %	20 %	0 %	383479438
128	NC_017040	GCTTG	2	10	269532	269541	0 %	40 %	40 %	20 %	383479446
129	NC_017040	TATCA	2	10	269881	269890	40 %	40 %	0 %	20 %	383479446
130	NC_017040	GCAGA	2	10	272106	272115	40 %	0 %	40 %	20 %	383479450
131	NC_017040	ATGGT	2	10	272323	272332	20 %	40 %	40 %	0 %	383479450
132	NC_017040	GATGA	2	10	275063	275072	40 %	20 %	40 %	0 %	383479453
133	NC_017040	AAGGC	2	10	277139	277148	40 %	0 %	40 %	20 %	383479456
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