MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-P

Total Repeats: 163

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017039	TCAAAA	2	12	42381	42392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017039	TTGAAA	2	12	53268	53279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017039	GGGTGG	2	12	54320	54331	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017039	TTAAAT	2	12	74876	74887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017039	CGTTTA	2	12	120210	120221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017039	TTATAG	2	12	141088	141099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017039	AAGGGT	2	12	153372	153383	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017039	TAGCCC	2	12	172973	172984	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017039	TTAAGT	2	12	182226	182237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017039	GGGAAA	2	12	208451	208462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017039	ACCATT	2	12	260416	260427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017039	TAGGCT	2	12	299439	299450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017039	ATCCCC	2	12	327008	327019	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017039	GTTTTA	2	12	334544	334555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017039	ATGCTA	2	12	335712	335723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017039	GGCAAA	2	12	345299	345310	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017039	TCGAAA	2	12	359509	359520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017039	TCAACG	2	12	382935	382946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017039	TGACCA	2	12	450388	450399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017039	TTTGAC	2	12	454562	454573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017039	CCATTG	2	12	454783	454794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017039	GTAACT	2	12	468792	468803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017039	CGGCCC	2	12	484851	484862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017039	GGTTAT	2	12	491574	491585	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017039	AAAATC	2	12	539186	539197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017039	TTCTCT	2	12	550554	550565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017039	GGTTAG	2	12	566110	566121	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017039	AATGAT	2	12	583697	583708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017039	ATTTTC	2	12	606204	606215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017039	CGGACG	2	12	633401	633412	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017039	CTTGAA	2	12	663869	663880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017039	TCCGCC	2	12	668759	668770	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017039	TCTTAA	2	12	692767	692778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017039	TTTCCC	2	12	728684	728695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017039	TCCCCC	2	12	755975	755986	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
36	NC_017039	CCTTAC	2	12	763397	763408	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017039	AAAATC	2	12	797937	797948	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017039	AAGTTA	2	12	800277	800288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017039	CTAGGA	2	12	826631	826642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017039	GCTTTA	2	12	843831	843842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017039	CCCCAG	2	12	846174	846185	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017039	CTCTTA	2	12	853555	853566	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017039	GGCAAT	2	12	883454	883465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017039	AGCAAC	2	12	891496	891507	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017039	GGGAAT	2	12	903909	903920	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017039	TCAGTT	2	12	914840	914851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017039	ATTTTA	2	12	920299	920310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017039	ACACCA	2	12	930280	930291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017039	AGAAAA	2	12	961385	961396	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017039	TTGAGT	2	12	988259	988270	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017039	TACTCC	2	12	1025656	1025667	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017039	TATTAA	2	12	1031422	1031433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017039	TTAATT	2	12	1039314	1039325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017039	TTAACT	2	12	1040093	1040104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017039	AGTCCA	2	12	1076115	1076126	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017039	TTGGCC	2	12	1116992	1117003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017039	AGAAGC	2	12	1117092	1117103	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017039	TTAGGT	2	12	1166345	1166356	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017039	ACCTCC	2	12	1170744	1170755	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017039	GCTTAG	2	12	1190764	1190775	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017039	TTTCCC	2	12	1197043	1197054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017039	GTTAAG	2	12	1291797	1291808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017039	CTTTGC	2	12	1321620	1321631	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017039	ATCATT	2	12	1324631	1324642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017039	AATTCA	2	12	1333423	1333434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017039	CCATCC	2	12	1346284	1346295	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017039	TTACCA	2	12	1374314	1374325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017039	TAAGAG	2	12	1383821	1383832	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017039	AAGGAG	2	12	1421658	1421669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017039	GTATTT	2	12	1523560	1523571	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017039	GGCAAA	2	12	1557409	1557420	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017039	TAGCGA	2	12	1567232	1567243	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017039	TTTAAC	2	12	1583551	1583562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017039	GCTCCC	2	12	1586199	1586210	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017039	GCCAAA	2	12	1605828	1605839	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017039	AATTTA	2	12	1606368	1606379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017039	GAATCT	2	12	1647348	1647359	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017039	TAAAAG	2	12	1654251	1654262	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017039	CATTAA	2	12	1654874	1654885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017039	CCCAGT	2	12	1668099	1668110	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017039	CATTGA	2	12	1671024	1671035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017039	TCAAAC	2	12	1687220	1687231	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017039	ACTGGG	2	12	1721131	1721142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017039	ACTCAA	2	12	1784815	1784826	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017039	GGTAAA	2	12	1814351	1814362	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017039	GTTGTA	2	12	1830571	1830582	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017039	CTGTTA	2	12	1832626	1832637	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017039	TAATGG	2	12	1849644	1849655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017039	AAACGA	2	12	1886015	1886026	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017039	TGGCAA	2	12	1921038	1921049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017039	TTATCT	2	12	1923074	1923085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017039	ACAGAA	2	12	1971595	1971606	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017039	GATTTC	2	12	1979360	1979371	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017039	AGTCAA	2	12	2003623	2003634	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017039	CCCCAT	2	12	2011659	2011670	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017039	GATTTT	2	12	2078064	2078075	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017039	ATGGGG	2	12	2131891	2131902	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017039	TGATCG	2	12	2136400	2136411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017039	CTAAAC	2	12	2155240	2155251	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017039	TTTCAT	2	12	2191350	2191361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017039	CCCCTT	2	12	2228281	2228292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017039	ATCGTA	2	12	2260429	2260440	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017039	GCAAAA	2	12	2262727	2262738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017039	TAGAAA	2	12	2288315	2288326	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017039	TTTGCA	2	12	2288419	2288430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017039	AATCCC	2	12	2334872	2334883	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017039	TGGCTC	2	12	2386865	2386876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017039	TTTCTT	2	12	2402380	2402391	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017039	GACCAT	2	12	2420642	2420653	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017039	AGCTCA	2	12	2434222	2434233	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017039	AAAAAC	2	12	2445961	2445972	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017039	ATCGCC	2	12	2459127	2459138	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017039	CCATTG	2	12	2554476	2554487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017039	CCATAT	2	12	2559214	2559225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017039	CCCATT	2	12	2597126	2597137	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017039	CTTTCC	2	12	2602412	2602423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017039	TAAATC	2	12	2629925	2629936	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017039	TGGGCT	2	12	2644351	2644362	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017039	TCTACC	2	12	2653873	2653884	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017039	GACAGT	2	12	2705924	2705935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017039	CTAGTC	2	12	2768472	2768483	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017039	CCTGAC	2	12	2775238	2775249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017039	AGTAAG	2	12	2790967	2790978	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017039	GAATAA	2	12	2829475	2829486	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017039	GGAACT	2	12	2829631	2829642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017039	TAGGGA	2	12	2835538	2835549	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017039	AAAGGC	2	12	2849612	2849623	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017039	GGCAAA	2	12	2851321	2851332	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017039	TCTAAG	2	12	2855285	2855296	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017039	GATTGA	2	12	2860236	2860247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017039	ATTTCC	2	12	2882685	2882696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017039	TAGAGC	2	12	2915335	2915346	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017039	AGACAG	2	12	2939523	2939534	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017039	TAATTA	2	12	2945994	2946005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017039	TATTCT	2	12	2948521	2948532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017039	TATAAT	2	12	2952105	2952116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017039	TAGCCC	2	12	2964458	2964469	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017039	TCTGTT	2	12	2995940	2995951	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017039	TATCAT	2	12	3030111	3030122	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017039	CATAGT	2	12	3041897	3041908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017039	TTGACA	2	12	3056179	3056190	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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145	NC_017039	ATTTCT	2	12	3101582	3101593	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017039	TGATAC	2	12	3116186	3116197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_017039	TGGGAT	2	12	3266800	3266811	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017039	GCCCTG	2	12	3282830	3282841	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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154	NC_017039	AGGGGA	2	12	3417000	3417011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_017039	TGGTTG	2	12	3458391	3458402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017039	GGCAAC	2	12	3479030	3479041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017039	ATTTTT	2	12	3520088	3520099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017039	TGCCAT	2	12	3521444	3521455	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017039	GGACTT	2	12	3523523	3523534	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.