MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-P

Total Repeats: 2340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017039	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	383324081
2	NC_017039	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	383324083
3	NC_017039	TGGTC	2	10	10864	10873	0 %	40 %	40 %	20 %	383324089
4	NC_017039	TGGCT	2	10	11014	11023	0 %	40 %	40 %	20 %	383324089
5	NC_017039	TAAAG	2	10	13447	13456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017039	AGCCT	2	10	15982	15991	20 %	20 %	20 %	40 %	383324093
7	NC_017039	CTTGG	2	10	21017	21026	0 %	40 %	40 %	20 %	383324096
8	NC_017039	ATGCC	2	10	21918	21927	20 %	20 %	20 %	40 %	383324097
9	NC_017039	TGTCA	2	10	22615	22624	20 %	40 %	20 %	20 %	383324097
10	NC_017039	TGCTT	2	10	24570	24579	0 %	60 %	20 %	20 %	383324099
11	NC_017039	TCCAA	2	10	30962	30971	40 %	20 %	0 %	40 %	383324103
12	NC_017039	GCATG	2	10	31146	31155	20 %	20 %	40 %	20 %	383324103
13	NC_017039	TCGAT	2	10	31249	31258	20 %	40 %	20 %	20 %	383324103
14	NC_017039	TAAGC	2	10	32017	32026	40 %	20 %	20 %	20 %	383324103
15	NC_017039	TTTGG	2	10	32347	32356	0 %	60 %	40 %	0 %	383324103
16	NC_017039	GGAAC	2	10	33023	33032	40 %	0 %	40 %	20 %	383324105
17	NC_017039	TAAAT	2	10	33654	33663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017039	CTAGG	2	10	33847	33856	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017039	TCCCA	2	10	34076	34085	20 %	20 %	0 %	60 %	383324106
20	NC_017039	TTCAC	2	10	35101	35110	20 %	40 %	0 %	40 %	383324106
21	NC_017039	GCAGA	2	10	35185	35194	40 %	0 %	40 %	20 %	383324106
22	NC_017039	CCCAG	2	10	35308	35317	20 %	0 %	20 %	60 %	383324106
23	NC_017039	ACAAT	2	10	36267	36276	60 %	20 %	0 %	20 %	383324107
24	NC_017039	AAAGT	2	10	39212	39221	60 %	20 %	20 %	0 %	383324109
25	NC_017039	CTGGA	2	10	40061	40070	20 %	20 %	40 %	20 %	383324110
26	NC_017039	ATTAC	2	10	40757	40766	40 %	40 %	0 %	20 %	383324110
27	NC_017039	TTTCA	2	10	40950	40959	20 %	60 %	0 %	20 %	383324110
28	NC_017039	TTAGA	2	10	41237	41246	40 %	40 %	20 %	0 %	383324110
29	NC_017039	TCCAT	2	10	41905	41914	20 %	40 %	0 %	40 %	383324110
30	NC_017039	AAAAC	2	10	43396	43405	80 %	0 %	0 %	20 %	383324111
31	NC_017039	ATTGG	2	10	44430	44439	20 %	40 %	40 %	0 %	383324112
32	NC_017039	ACGGG	2	10	46160	46169	20 %	0 %	60 %	20 %	383324114
33	NC_017039	CTGGG	2	10	49828	49837	0 %	20 %	60 %	20 %	383324118
34	NC_017039	AAAGA	2	10	51912	51921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017039	TTTGG	2	10	54038	54047	0 %	60 %	40 %	0 %	383324122
36	NC_017039	AGTTT	2	10	55651	55660	20 %	60 %	20 %	0 %	383324123
37	NC_017039	AAAAC	2	10	57512	57521	80 %	0 %	0 %	20 %	383324126
38	NC_017039	CCATG	2	10	58347	58356	20 %	20 %	20 %	40 %	383324126
39	NC_017039	GGTCA	2	10	59261	59270	20 %	20 %	40 %	20 %	383324127
40	NC_017039	TCCGT	2	10	64282	64291	0 %	40 %	20 %	40 %	383324131
41	NC_017039	TTGCT	2	10	64328	64337	0 %	60 %	20 %	20 %	383324131
42	NC_017039	ATTAA	2	10	64957	64966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017039	GCTGG	2	10	66665	66674	0 %	20 %	60 %	20 %	383324134
44	NC_017039	GCTTT	2	10	79538	79547	0 %	60 %	20 %	20 %	383324147
45	NC_017039	TCCCG	2	10	80136	80145	0 %	20 %	20 %	60 %	383324147
46	NC_017039	CCAAA	2	10	81602	81611	60 %	0 %	0 %	40 %	383324148
47	NC_017039	GTTGG	2	10	82298	82307	0 %	40 %	60 %	0 %	383324150
48	NC_017039	CCTCA	2	10	83584	83593	20 %	20 %	0 %	60 %	383324150
49	NC_017039	CAAAC	2	10	89081	89090	60 %	0 %	0 %	40 %	383324156
50	NC_017039	GCCAG	2	10	89923	89932	20 %	0 %	40 %	40 %	383324156
51	NC_017039	ATAGG	2	10	90744	90753	40 %	20 %	40 %	0 %	383324157
52	NC_017039	GGGCT	2	10	92496	92505	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017039	AGGCC	2	10	94218	94227	20 %	0 %	40 %	40 %	383324159
54	NC_017039	AAGGC	2	10	99904	99913	40 %	0 %	40 %	20 %	383324164
55	NC_017039	CAGTG	2	10	100745	100754	20 %	20 %	40 %	20 %	383324164
56	NC_017039	CTTCC	2	10	101592	101601	0 %	40 %	0 %	60 %	383324165
57	NC_017039	ATAAA	2	10	103167	103176	80 %	20 %	0 %	0 %	383324167
58	NC_017039	AATAA	2	10	103396	103405	80 %	20 %	0 %	0 %	383324167
59	NC_017039	GAAAA	2	10	105135	105144	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017039	AATAT	2	10	106514	106523	60 %	40 %	0 %	0 %	383324168
61	NC_017039	TTGGT	2	10	107097	107106	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017039	CAATC	2	10	107776	107785	40 %	20 %	0 %	40 %	383324169
63	NC_017039	GACAA	2	10	110333	110342	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017039	AATTC	2	10	111739	111748	40 %	40 %	0 %	20 %	383324174
65	NC_017039	AAAAG	2	10	111848	111857	80 %	0 %	20 %	0 %	383324174
66	NC_017039	AGATA	2	10	111932	111941	60 %	20 %	20 %	0 %	383324174
67	NC_017039	GAAAA	2	10	112266	112275	80 %	0 %	20 %	0 %	383324174
68	NC_017039	TTTTA	2	10	115159	115168	20 %	80 %	0 %	0 %	383324177
69	NC_017039	TTGTT	2	10	116293	116302	0 %	80 %	20 %	0 %	383324178
70	NC_017039	CTGGG	2	10	116676	116685	0 %	20 %	60 %	20 %	383324179
71	NC_017039	CGATA	2	10	118596	118605	40 %	20 %	20 %	20 %	383324181
72	NC_017039	AAGTT	2	10	118971	118980	40 %	40 %	20 %	0 %	383324181
73	NC_017039	GGTTA	2	10	125856	125865	20 %	40 %	40 %	0 %	383324189
74	NC_017039	TTGGA	2	10	126419	126428	20 %	40 %	40 %	0 %	383324189
75	NC_017039	TCACT	2	10	127206	127215	20 %	40 %	0 %	40 %	383324191
76	NC_017039	GAACT	2	10	127855	127864	40 %	20 %	20 %	20 %	383324191
77	NC_017039	GCCCA	2	10	130669	130678	20 %	0 %	20 %	60 %	383324194
78	NC_017039	ACTCC	2	10	130742	130751	20 %	20 %	0 %	60 %	383324194
79	NC_017039	AAAAT	2	10	130856	130865	80 %	20 %	0 %	0 %	383324194
80	NC_017039	CCAGG	2	10	133664	133673	20 %	0 %	40 %	40 %	383324197
81	NC_017039	CCGGC	2	10	134728	134737	0 %	0 %	40 %	60 %	383324199
82	NC_017039	CCAAA	2	10	136191	136200	60 %	0 %	0 %	40 %	383324199
83	NC_017039	AGCCC	2	10	140262	140271	20 %	0 %	20 %	60 %	383324201
84	NC_017039	CTTTT	2	10	140610	140619	0 %	80 %	0 %	20 %	383324202
85	NC_017039	GGCCA	2	10	142643	142652	20 %	0 %	40 %	40 %	383324205
86	NC_017039	GCCCC	2	10	144695	144704	0 %	0 %	20 %	80 %	383324208
87	NC_017039	CGGTG	2	10	144724	144733	0 %	20 %	60 %	20 %	383324208
88	NC_017039	CTGTT	2	10	146694	146703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017039	AAATA	2	10	146790	146799	80 %	20 %	0 %	0 %	383324211
90	NC_017039	AATCT	2	10	149686	149695	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017039	GCCAT	2	10	152509	152518	20 %	20 %	20 %	40 %	383324217
92	NC_017039	GCCCC	2	10	154609	154618	0 %	0 %	20 %	80 %	383324219
93	NC_017039	AGGGC	2	10	158480	158489	20 %	0 %	60 %	20 %	383324224
94	NC_017039	AATCA	2	10	158511	158520	60 %	20 %	0 %	20 %	383324224
95	NC_017039	TTGGA	2	10	158830	158839	20 %	40 %	40 %	0 %	383324225
96	NC_017039	AGGAG	2	10	159600	159609	40 %	0 %	60 %	0 %	383324225
97	NC_017039	AGGGG	2	10	162612	162621	20 %	0 %	80 %	0 %	383324230
98	NC_017039	TGTGG	2	10	168066	168075	0 %	40 %	60 %	0 %	383324233
99	NC_017039	TTTGG	2	10	173404	173413	0 %	60 %	40 %	0 %	383324238
100	NC_017039	GGAAA	2	10	173488	173497	60 %	0 %	40 %	0 %	383324238
101	NC_017039	CGGAG	2	10	174939	174948	20 %	0 %	60 %	20 %	383324239
102	NC_017039	TTAGG	2	10	179679	179688	20 %	40 %	40 %	0 %	383324245
103	NC_017039	GGGCC	2	10	181175	181184	0 %	0 %	60 %	40 %	383324247
104	NC_017039	GGCAA	2	10	181593	181602	40 %	0 %	40 %	20 %	383324247
105	NC_017039	CCAGG	2	10	182044	182053	20 %	0 %	40 %	40 %	383324247
106	NC_017039	TCGGT	2	10	182251	182260	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017039	AGCCA	2	10	183496	183505	40 %	0 %	20 %	40 %	383324249
108	NC_017039	ATTAA	2	10	185733	185742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017039	GCCAA	2	10	189804	189813	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017039	TGATG	2	10	192336	192345	20 %	40 %	40 %	0 %	383324257
111	NC_017039	CTAAA	2	10	192844	192853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017039	CTGAC	2	10	193183	193192	20 %	20 %	20 %	40 %	383324258
113	NC_017039	CAAAA	2	10	193655	193664	80 %	0 %	0 %	20 %	383324258
114	NC_017039	CCCAC	2	10	194254	194263	20 %	0 %	0 %	80 %	383324258
115	NC_017039	GGGTA	2	10	194678	194687	20 %	20 %	60 %	0 %	383324259
116	NC_017039	CCCAG	2	10	194723	194732	20 %	0 %	20 %	60 %	383324259
117	NC_017039	AGGAA	2	10	196699	196708	60 %	0 %	40 %	0 %	383324262
118	NC_017039	GCCAT	2	10	197621	197630	20 %	20 %	20 %	40 %	383324264
119	NC_017039	CCCAT	2	10	200934	200943	20 %	20 %	0 %	60 %	383324265
120	NC_017039	ACCTA	2	10	201789	201798	40 %	20 %	0 %	40 %	383324265
121	NC_017039	ACGGT	2	10	205286	205295	20 %	20 %	40 %	20 %	383324267
122	NC_017039	TGAAC	2	10	206199	206208	40 %	20 %	20 %	20 %	383324267
123	NC_017039	CAATT	2	10	206490	206499	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017039	AATTT	2	10	210573	210582	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017039	GGGAA	2	10	210708	210717	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017039	CTGTG	2	10	212780	212789	0 %	40 %	40 %	20 %	383324273
127	NC_017039	GGACA	2	10	212874	212883	40 %	0 %	40 %	20 %	383324273
128	NC_017039	GAACT	2	10	218623	218632	40 %	20 %	20 %	20 %	383324277
129	NC_017039	ATCAA	2	10	219102	219111	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017039	CCCAG	2	10	223191	223200	20 %	0 %	20 %	60 %	383324282
131	NC_017039	AACCG	2	10	227370	227379	40 %	0 %	20 %	40 %	383324286
132	NC_017039	ATTGT	2	10	229021	229030	20 %	60 %	20 %	0 %	383324288
133	NC_017039	CTTTG	2	10	230039	230048	0 %	60 %	20 %	20 %	383324288
134	NC_017039	ATTTT	2	10	230575	230584	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017039	TGGAT	2	10	235678	235687	20 %	40 %	40 %	0 %	383324292
136	NC_017039	TTAAT	2	10	235795	235804	40 %	60 %	0 %	0 %	383324292
137	NC_017039	GAAAT	2	10	238290	238299	60 %	20 %	20 %	0 %	383324294
138	NC_017039	GTACA	2	10	243738	243747	40 %	20 %	20 %	20 %	383324300
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150	NC_017039	TGAGC	2	10	268581	268590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017039	TAAAA	2	10	269030	269039	80 %	20 %	0 %	0 %	383324324
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247	NC_017039	TCATT	2	10	450466	450475	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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249	NC_017039	TTTTC	2	10	452197	452206	0 %	80 %	0 %	20 %	383324493
250	NC_017039	ACTAA	2	10	453047	453056	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
251	NC_017039	GATTG	2	10	453381	453390	20 %	40 %	40 %	0 %	383324494
252	NC_017039	TGATC	2	10	455896	455905	20 %	40 %	20 %	20 %	383324495
253	NC_017039	CCAGT	2	10	457664	457673	20 %	20 %	20 %	40 %	383324496
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255	NC_017039	AAAGC	2	10	460197	460206	60 %	0 %	20 %	20 %	383324498
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257	NC_017039	CCCTC	3	15	470870	470884	0 %	20 %	0 %	80 %	383324512
258	NC_017039	GGCCG	2	10	472526	472535	0 %	0 %	60 %	40 %	383324513
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261	NC_017039	AAGGA	2	10	475905	475914	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017039	TTTGA	2	10	479486	479495	20 %	60 %	20 %	0 %	383324521
263	NC_017039	TGGCT	2	10	483639	483648	0 %	40 %	40 %	20 %	383324524
264	NC_017039	TACAG	2	10	484343	484352	40 %	20 %	20 %	20 %	383324524
265	NC_017039	CCAAT	2	10	485696	485705	40 %	20 %	0 %	40 %	383324525
266	NC_017039	CCCCG	2	10	488214	488223	0 %	0 %	20 %	80 %	383324527
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