MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. GT-I

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017038	TCAAAA	2	12	42381	42392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017038	TTGAAA	2	12	53268	53279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017038	GGGTGG	2	12	54320	54331	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017038	TTAAAT	2	12	74876	74887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017038	CGTTTA	2	12	120210	120221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017038	TTATAG	2	12	141088	141099	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017038	AAGGGT	2	12	153372	153383	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017038	TAGCCC	2	12	172973	172984	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017038	TTAAGT	2	12	182226	182237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017038	GGGAAA	2	12	208451	208462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017038	ACCATT	2	12	260416	260427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017038	TAGGCT	2	12	299439	299450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017038	ATCCCC	2	12	327008	327019	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017038	GTTTTA	2	12	334544	334555	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017038	ATGCTA	2	12	335712	335723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017038	GGCAAA	2	12	345299	345310	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017038	TCGAAA	2	12	359509	359520	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017038	TCAACG	2	12	382935	382946	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017038	TGACCA	2	12	450388	450399	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017038	TTTGAC	2	12	454562	454573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017038	CCATTG	2	12	454783	454794	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017038	GTAACT	2	12	468792	468803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017038	CGGCCC	2	12	484851	484862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017038	GGTTAT	2	12	491574	491585	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017038	AAAATC	2	12	539186	539197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017038	TTCTCT	2	12	550554	550565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017038	GGTTAG	2	12	566110	566121	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017038	AATGAT	2	12	583697	583708	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017038	ATTTTC	2	12	606204	606215	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017038	CGGACG	2	12	633401	633412	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017038	CTTGAA	2	12	663869	663880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017038	TCCGCC	2	12	668759	668770	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017038	TCTTAA	2	12	692767	692778	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017038	TTTCCC	2	12	728684	728695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017038	TCCCCC	2	12	755976	755987	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
36	NC_017038	CCTTAC	2	12	763398	763409	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017038	AAAATC	2	12	797784	797795	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017038	AAGTTA	2	12	800124	800135	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017038	CTAGGA	2	12	826478	826489	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017038	GCTTTA	2	12	843678	843689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017038	CCCCAG	2	12	846021	846032	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017038	CTCTTA	2	12	853402	853413	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017038	GGCAAT	2	12	883301	883312	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017038	AGCAAC	2	12	891343	891354	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017038	GGGAAT	2	12	903756	903767	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017038	TCAGTT	2	12	914687	914698	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017038	ATTTTA	2	12	920146	920157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017038	ACACCA	2	12	930127	930138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017038	AGAAAA	2	12	961232	961243	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017038	TTGAGT	2	12	988106	988117	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017038	TACTCC	2	12	1025503	1025514	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017038	TATTAA	2	12	1031269	1031280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017038	TTAATT	2	12	1039161	1039172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017038	TTAACT	2	12	1039940	1039951	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017038	AGTCCA	2	12	1075962	1075973	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017038	TTGGCC	2	12	1116839	1116850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017038	AGAAGC	2	12	1116939	1116950	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017038	TTAGGT	2	12	1166192	1166203	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017038	ACCTCC	2	12	1170591	1170602	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017038	GCTTAG	2	12	1190611	1190622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017038	TTTCCC	2	12	1196890	1196901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017038	GTTAAG	2	12	1291644	1291655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017038	CTTTGC	2	12	1321512	1321523	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017038	ATCATT	2	12	1324523	1324534	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017038	AATTCA	2	12	1333315	1333326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017038	CCATCC	2	12	1346176	1346187	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017038	TTACCA	2	12	1374206	1374217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017038	TAAGAG	2	12	1383713	1383724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017038	GTATTT	2	12	1523451	1523462	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017038	GGCAAA	2	12	1557300	1557311	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017038	TAGCGA	2	12	1567123	1567134	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017038	TTTAAC	2	12	1583442	1583453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017038	GCTCCC	2	12	1586090	1586101	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017038	GCCAAA	2	12	1605719	1605730	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017038	AATTTA	2	12	1606259	1606270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017038	GAATCT	2	12	1647239	1647250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017038	TAAAAG	2	12	1654142	1654153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017038	CATTAA	2	12	1654765	1654776	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017038	CCCAGT	2	12	1667990	1668001	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017038	CATTGA	2	12	1670915	1670926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017038	TCAAAC	2	12	1687111	1687122	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017038	ACTGGG	2	12	1721022	1721033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017038	ACTCAA	2	12	1784706	1784717	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017038	GGTAAA	2	12	1814242	1814253	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017038	GTTGTA	2	12	1830462	1830473	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017038	CTGTTA	2	12	1832517	1832528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017038	TAATGG	2	12	1849535	1849546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017038	AAACGA	2	12	1885906	1885917	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017038	TGGCAA	2	12	1920929	1920940	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017038	TTATCT	2	12	1922965	1922976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017038	ACAGAA	2	12	1971486	1971497	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017038	GATTTC	2	12	1979251	1979262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017038	AGTCAA	2	12	2003514	2003525	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017038	CCCCAT	2	12	2011550	2011561	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017038	GATTTT	2	12	2077955	2077966	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017038	ATGGGG	2	12	2131782	2131793	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017038	TGATCG	2	12	2136291	2136302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017038	CTAAAC	2	12	2155131	2155142	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017038	TTTCAT	2	12	2191241	2191252	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017038	CCCCTT	2	12	2228172	2228183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017038	ATCGTA	2	12	2260320	2260331	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017038	GCAAAA	2	12	2262618	2262629	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017038	TAGAAA	2	12	2288206	2288217	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017038	TTTGCA	2	12	2288310	2288321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017038	AATCCC	2	12	2334763	2334774	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017038	TGGCTC	2	12	2386756	2386767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017038	TTTCTT	2	12	2402271	2402282	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017038	GACCAT	2	12	2420533	2420544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017038	AGCTCA	2	12	2434113	2434124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017038	AAAAAC	2	12	2445852	2445863	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017038	ATCGCC	2	12	2459018	2459029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017038	CCATTG	2	12	2554367	2554378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017038	CCATAT	2	12	2559105	2559116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017038	CCCATT	2	12	2597017	2597028	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017038	CTTTCC	2	12	2602303	2602314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017038	TAAATC	2	12	2629816	2629827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017038	TGGGCT	2	12	2644242	2644253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017038	TCTACC	2	12	2653764	2653775	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017038	GACAGT	2	12	2705815	2705826	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017038	CTAGTC	2	12	2768362	2768373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017038	CCTGAC	2	12	2775128	2775139	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017038	AGTAAG	2	12	2790857	2790868	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017038	GAATAA	2	12	2829365	2829376	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017038	GGAACT	2	12	2829521	2829532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017038	TAGGGA	2	12	2835428	2835439	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017038	AAAGGC	2	12	2849502	2849513	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017038	GGCAAA	2	12	2851211	2851222	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017038	TCTAAG	2	12	2855175	2855186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017038	GATTGA	2	12	2860126	2860137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017038	ATTTCC	2	12	2882575	2882586	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017038	TAGAGC	2	12	2915225	2915236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017038	AGACAG	2	12	2939413	2939424	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017038	TAATTA	2	12	2945884	2945895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017038	TATTCT	2	12	2948411	2948422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017038	TATAAT	2	12	2951995	2952006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017038	TAGCCC	2	12	2964348	2964359	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017038	TCTGTT	2	12	2995830	2995841	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017038	TATCAT	2	12	3030001	3030012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017038	CATAGT	2	12	3041787	3041798	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017038	TTGACA	2	12	3056069	3056080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017038	TAAGAG	2	12	3064055	3064066	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_017038	GAAAAT	2	12	3094915	3094926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017038	ATTTCT	2	12	3101472	3101483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017038	TGATAC	2	12	3116076	3116087	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017038	AATCAA	2	12	3185922	3185933	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017038	CCCAGG	2	12	3212275	3212286	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017038	TGGGAT	2	12	3266690	3266701	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017038	GCCCTG	2	12	3282720	3282731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017038	TTGAAC	2	12	3339825	3339836	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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153	NC_017038	AGGGGA	2	12	3416890	3416901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017038	TTTAAT	2	12	3419540	3419551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017038	TTATTT	2	12	3424888	3424899	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017038	TGGTTG	2	12	3458281	3458292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017038	GGCAAC	2	12	3478920	3478931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017038	ATTTTT	2	12	3519978	3519989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017038	TGCCAT	2	12	3521334	3521345	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017038	GGACTT	2	12	3523413	3523424	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.