MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. GT-I

Total Repeats: 1932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017038	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	383320911
2	NC_017038	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	383320913
3	NC_017038	TGGTC	2	10	10864	10873	0 %	40 %	40 %	20 %	383320919
4	NC_017038	TGGCT	2	10	11014	11023	0 %	40 %	40 %	20 %	383320919
5	NC_017038	AGCCT	2	10	15982	15991	20 %	20 %	20 %	40 %	383320923
6	NC_017038	CTTGG	2	10	21017	21026	0 %	40 %	40 %	20 %	383320926
7	NC_017038	ATGCC	2	10	21918	21927	20 %	20 %	20 %	40 %	383320927
8	NC_017038	TGTCA	2	10	22615	22624	20 %	40 %	20 %	20 %	383320927
9	NC_017038	TGCTT	2	10	24570	24579	0 %	60 %	20 %	20 %	383320929
10	NC_017038	TCCAA	2	10	30962	30971	40 %	20 %	0 %	40 %	383320933
11	NC_017038	GCATG	2	10	31146	31155	20 %	20 %	40 %	20 %	383320933
12	NC_017038	TCGAT	2	10	31249	31258	20 %	40 %	20 %	20 %	383320933
13	NC_017038	TAAGC	2	10	32017	32026	40 %	20 %	20 %	20 %	383320933
14	NC_017038	TTTGG	2	10	32347	32356	0 %	60 %	40 %	0 %	383320933
15	NC_017038	GGAAC	2	10	33023	33032	40 %	0 %	40 %	20 %	383320935
16	NC_017038	TCCCA	2	10	34076	34085	20 %	20 %	0 %	60 %	383320936
17	NC_017038	TTCAC	2	10	35101	35110	20 %	40 %	0 %	40 %	383320936
18	NC_017038	GCAGA	2	10	35185	35194	40 %	0 %	40 %	20 %	383320936
19	NC_017038	CCCAG	2	10	35308	35317	20 %	0 %	20 %	60 %	383320936
20	NC_017038	ACAAT	2	10	36267	36276	60 %	20 %	0 %	20 %	383320937
21	NC_017038	AAAGT	2	10	39212	39221	60 %	20 %	20 %	0 %	383320939
22	NC_017038	CTGGA	2	10	40061	40070	20 %	20 %	40 %	20 %	383320940
23	NC_017038	ATTAC	2	10	40757	40766	40 %	40 %	0 %	20 %	383320940
24	NC_017038	TTTCA	2	10	40950	40959	20 %	60 %	0 %	20 %	383320940
25	NC_017038	TTAGA	2	10	41237	41246	40 %	40 %	20 %	0 %	383320940
26	NC_017038	TCCAT	2	10	41905	41914	20 %	40 %	0 %	40 %	383320940
27	NC_017038	AAAAC	2	10	43396	43405	80 %	0 %	0 %	20 %	383320941
28	NC_017038	ATTGG	2	10	44430	44439	20 %	40 %	40 %	0 %	383320942
29	NC_017038	ACGGG	2	10	46160	46169	20 %	0 %	60 %	20 %	383320944
30	NC_017038	CTGGG	2	10	49828	49837	0 %	20 %	60 %	20 %	383320948
31	NC_017038	TTTGG	2	10	54038	54047	0 %	60 %	40 %	0 %	383320952
32	NC_017038	AGTTT	2	10	55651	55660	20 %	60 %	20 %	0 %	383320953
33	NC_017038	AAAAC	2	10	57512	57521	80 %	0 %	0 %	20 %	383320956
34	NC_017038	CCATG	2	10	58347	58356	20 %	20 %	20 %	40 %	383320956
35	NC_017038	GGTCA	2	10	59261	59270	20 %	20 %	40 %	20 %	383320957
36	NC_017038	TCCGT	2	10	64282	64291	0 %	40 %	20 %	40 %	383320961
37	NC_017038	TTGCT	2	10	64328	64337	0 %	60 %	20 %	20 %	383320961
38	NC_017038	GCTGG	2	10	66665	66674	0 %	20 %	60 %	20 %	383320964
39	NC_017038	GCTTT	2	10	79538	79547	0 %	60 %	20 %	20 %	383320977
40	NC_017038	TCCCG	2	10	80136	80145	0 %	20 %	20 %	60 %	383320977
41	NC_017038	CCAAA	2	10	81602	81611	60 %	0 %	0 %	40 %	383320978
42	NC_017038	GTTGG	2	10	82298	82307	0 %	40 %	60 %	0 %	383320980
43	NC_017038	CCTCA	2	10	83584	83593	20 %	20 %	0 %	60 %	383320980
44	NC_017038	CAAAC	2	10	89081	89090	60 %	0 %	0 %	40 %	383320986
45	NC_017038	GCCAG	2	10	89923	89932	20 %	0 %	40 %	40 %	383320986
46	NC_017038	ATAGG	2	10	90744	90753	40 %	20 %	40 %	0 %	383320987
47	NC_017038	AGGCC	2	10	94218	94227	20 %	0 %	40 %	40 %	383320989
48	NC_017038	AAGGC	2	10	99904	99913	40 %	0 %	40 %	20 %	383320994
49	NC_017038	CAGTG	2	10	100745	100754	20 %	20 %	40 %	20 %	383320994
50	NC_017038	CTTCC	2	10	101592	101601	0 %	40 %	0 %	60 %	383320995
51	NC_017038	ATAAA	2	10	103167	103176	80 %	20 %	0 %	0 %	383320997
52	NC_017038	AATAA	2	10	103396	103405	80 %	20 %	0 %	0 %	383320997
53	NC_017038	AATAT	2	10	106514	106523	60 %	40 %	0 %	0 %	383320998
54	NC_017038	CAATC	2	10	107776	107785	40 %	20 %	0 %	40 %	383320999
55	NC_017038	AATTC	2	10	111739	111748	40 %	40 %	0 %	20 %	383321004
56	NC_017038	AAAAG	2	10	111848	111857	80 %	0 %	20 %	0 %	383321004
57	NC_017038	AGATA	2	10	111932	111941	60 %	20 %	20 %	0 %	383321004
58	NC_017038	GAAAA	2	10	112266	112275	80 %	0 %	20 %	0 %	383321004
59	NC_017038	TTTTA	2	10	115159	115168	20 %	80 %	0 %	0 %	383321007
60	NC_017038	TTGTT	2	10	116293	116302	0 %	80 %	20 %	0 %	383321008
61	NC_017038	CTGGG	2	10	116676	116685	0 %	20 %	60 %	20 %	383321009
62	NC_017038	CGATA	2	10	118596	118605	40 %	20 %	20 %	20 %	383321011
63	NC_017038	AAGTT	2	10	118971	118980	40 %	40 %	20 %	0 %	383321011
64	NC_017038	GGTTA	2	10	125856	125865	20 %	40 %	40 %	0 %	383321019
65	NC_017038	TTGGA	2	10	126419	126428	20 %	40 %	40 %	0 %	383321019
66	NC_017038	TCACT	2	10	127206	127215	20 %	40 %	0 %	40 %	383321021
67	NC_017038	GAACT	2	10	127855	127864	40 %	20 %	20 %	20 %	383321021
68	NC_017038	GCCCA	2	10	130669	130678	20 %	0 %	20 %	60 %	383321024
69	NC_017038	ACTCC	2	10	130742	130751	20 %	20 %	0 %	60 %	383321024
70	NC_017038	AAAAT	2	10	130856	130865	80 %	20 %	0 %	0 %	383321024
71	NC_017038	CCAGG	2	10	133664	133673	20 %	0 %	40 %	40 %	383321027
72	NC_017038	CCGGC	2	10	134728	134737	0 %	0 %	40 %	60 %	383321029
73	NC_017038	CCAAA	2	10	136191	136200	60 %	0 %	0 %	40 %	383321029
74	NC_017038	AGCCC	2	10	140262	140271	20 %	0 %	20 %	60 %	383321031
75	NC_017038	CTTTT	2	10	140610	140619	0 %	80 %	0 %	20 %	383321032
76	NC_017038	GGCCA	2	10	142643	142652	20 %	0 %	40 %	40 %	383321035
77	NC_017038	GCCCC	2	10	144695	144704	0 %	0 %	20 %	80 %	383321038
78	NC_017038	CGGTG	2	10	144724	144733	0 %	20 %	60 %	20 %	383321038
79	NC_017038	AAATA	2	10	146790	146799	80 %	20 %	0 %	0 %	383321041
80	NC_017038	GCCAT	2	10	152509	152518	20 %	20 %	20 %	40 %	383321047
81	NC_017038	GCCCC	2	10	154609	154618	0 %	0 %	20 %	80 %	383321049
82	NC_017038	AGGGC	2	10	158480	158489	20 %	0 %	60 %	20 %	383321054
83	NC_017038	AATCA	2	10	158511	158520	60 %	20 %	0 %	20 %	383321054
84	NC_017038	TTGGA	2	10	158830	158839	20 %	40 %	40 %	0 %	383321055
85	NC_017038	AGGAG	2	10	159600	159609	40 %	0 %	60 %	0 %	383321055
86	NC_017038	AGGGG	2	10	162612	162621	20 %	0 %	80 %	0 %	383321060
87	NC_017038	TGTGG	2	10	168066	168075	0 %	40 %	60 %	0 %	383321063
88	NC_017038	TTTGG	2	10	173404	173413	0 %	60 %	40 %	0 %	383321068
89	NC_017038	GGAAA	2	10	173488	173497	60 %	0 %	40 %	0 %	383321068
90	NC_017038	CGGAG	2	10	174939	174948	20 %	0 %	60 %	20 %	383321069
91	NC_017038	TTAGG	2	10	179679	179688	20 %	40 %	40 %	0 %	383321075
92	NC_017038	GGGCC	2	10	181175	181184	0 %	0 %	60 %	40 %	383321077
93	NC_017038	GGCAA	2	10	181593	181602	40 %	0 %	40 %	20 %	383321077
94	NC_017038	CCAGG	2	10	182044	182053	20 %	0 %	40 %	40 %	383321077
95	NC_017038	AGCCA	2	10	183496	183505	40 %	0 %	20 %	40 %	383321079
96	NC_017038	TGATG	2	10	192336	192345	20 %	40 %	40 %	0 %	383321087
97	NC_017038	CTGAC	2	10	193183	193192	20 %	20 %	20 %	40 %	383321088
98	NC_017038	CAAAA	2	10	193655	193664	80 %	0 %	0 %	20 %	383321088
99	NC_017038	CCCAC	2	10	194254	194263	20 %	0 %	0 %	80 %	383321088
100	NC_017038	GGGTA	2	10	194678	194687	20 %	20 %	60 %	0 %	383321089
101	NC_017038	CCCAG	2	10	194723	194732	20 %	0 %	20 %	60 %	383321089
102	NC_017038	AGGAA	2	10	196699	196708	60 %	0 %	40 %	0 %	383321092
103	NC_017038	GCCAT	2	10	197621	197630	20 %	20 %	20 %	40 %	383321094
104	NC_017038	CCCAT	2	10	200934	200943	20 %	20 %	0 %	60 %	383321095
105	NC_017038	ACCTA	2	10	201789	201798	40 %	20 %	0 %	40 %	383321095
106	NC_017038	ACGGT	2	10	205286	205295	20 %	20 %	40 %	20 %	383321097
107	NC_017038	TGAAC	2	10	206199	206208	40 %	20 %	20 %	20 %	383321097
108	NC_017038	CTGTG	2	10	212780	212789	0 %	40 %	40 %	20 %	383321103
109	NC_017038	GGACA	2	10	212874	212883	40 %	0 %	40 %	20 %	383321103
110	NC_017038	GAACT	2	10	218623	218632	40 %	20 %	20 %	20 %	383321107
111	NC_017038	CCCAG	2	10	223191	223200	20 %	0 %	20 %	60 %	383321112
112	NC_017038	AACCG	2	10	227370	227379	40 %	0 %	20 %	40 %	383321116
113	NC_017038	ATTGT	2	10	229021	229030	20 %	60 %	20 %	0 %	383321118
114	NC_017038	CTTTG	2	10	230039	230048	0 %	60 %	20 %	20 %	383321118
115	NC_017038	TGGAT	2	10	235678	235687	20 %	40 %	40 %	0 %	383321122
116	NC_017038	TTAAT	2	10	235795	235804	40 %	60 %	0 %	0 %	383321122
117	NC_017038	GAAAT	2	10	238290	238299	60 %	20 %	20 %	0 %	383321124
118	NC_017038	GTACA	2	10	243738	243747	40 %	20 %	20 %	20 %	383321130
119	NC_017038	AGACA	2	10	244010	244019	60 %	0 %	20 %	20 %	383321130
120	NC_017038	AGGAA	2	10	244536	244545	60 %	0 %	40 %	0 %	383321131
121	NC_017038	GCAAA	2	10	244818	244827	60 %	0 %	20 %	20 %	383321132
122	NC_017038	CTTCT	2	10	247656	247665	0 %	60 %	0 %	40 %	383321135
123	NC_017038	CCTTT	2	10	249892	249901	0 %	60 %	0 %	40 %	383321136
124	NC_017038	CCGAA	2	10	250414	250423	40 %	0 %	20 %	40 %	383321137
125	NC_017038	TGACC	2	10	253532	253541	20 %	20 %	20 %	40 %	383321139
126	NC_017038	GAGAG	2	10	254490	254499	40 %	0 %	60 %	0 %	383321139
127	NC_017038	TGGGG	2	10	262870	262879	0 %	20 %	80 %	0 %	383321147
128	NC_017038	TTTTC	2	10	263640	263649	0 %	80 %	0 %	20 %	383321148
129	NC_017038	TAAAA	2	10	269030	269039	80 %	20 %	0 %	0 %	383321154
130	NC_017038	ATTGT	2	10	269374	269383	20 %	60 %	20 %	0 %	383321154
131	NC_017038	ACTTT	2	10	272266	272275	20 %	60 %	0 %	20 %	383321157
132	NC_017038	GGTTT	2	10	272451	272460	0 %	60 %	40 %	0 %	383321157
133	NC_017038	AAGAA	2	10	272705	272714	80 %	0 %	20 %	0 %	383321157
134	NC_017038	TTTTC	2	10	273330	273339	0 %	80 %	0 %	20 %	383321157
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252	NC_017038	ATGCC	2	10	537005	537014	20 %	20 %	20 %	40 %	383321389
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254	NC_017038	AGGCA	2	10	539595	539604	40 %	0 %	40 %	20 %	383321392
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256	NC_017038	ATTTG	2	10	542468	542477	20 %	60 %	20 %	0 %	383321395
257	NC_017038	TAAAC	2	10	544123	544132	60 %	20 %	0 %	20 %	383321397
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259	NC_017038	AACCC	2	10	549233	549242	40 %	0 %	0 %	60 %	383321403
260	NC_017038	GGGAT	2	10	550675	550684	20 %	20 %	60 %	0 %	383321406
261	NC_017038	CCCAA	2	10	552227	552236	40 %	0 %	0 %	60 %	383321406
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