MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pasteurella multocida subsp. multocida str. HN06 plasmid unnamed

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017035	TAT	2	6	47	52	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017035	TAC	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017035	TAT	2	6	111	116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017035	TCA	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311885
5	NC_017035	TCA	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311885
6	NC_017035	GTG	2	6	438	443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311886
7	NC_017035	CGC	2	6	479	484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311886
8	NC_017035	AGG	2	6	564	569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311886
9	NC_017035	AGG	2	6	573	578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311886
10	NC_017035	CGG	2	6	615	620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311886
11	NC_017035	GCA	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311886
12	NC_017035	CTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311886
13	NC_017035	CGC	2	6	810	815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311886
14	NC_017035	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311886
15	NC_017035	TGG	2	6	921	926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311886
16	NC_017035	GGC	2	6	966	971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311886
17	NC_017035	CAG	2	6	978	983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311886
18	NC_017035	GCC	2	6	1161	1166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017035	ATT	4	12	1398	1409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017035	TCA	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311887
21	NC_017035	CGC	2	6	1586	1591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311887
22	NC_017035	GTG	2	6	1714	1719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311887
23	NC_017035	ATC	2	6	1781	1786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311887
24	NC_017035	TCG	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311887
25	NC_017035	CAT	2	6	1856	1861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311887
26	NC_017035	GCG	2	6	1872	1877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311887
27	NC_017035	GCT	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311887
28	NC_017035	GCC	3	9	2130	2138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311887
29	NC_017035	GGC	2	6	2204	2209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311887
30	NC_017035	CAG	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017035	CAA	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311888
32	NC_017035	ATT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311888
33	NC_017035	ACT	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017035	AGT	2	6	2660	2665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017035	AAC	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017035	TAA	2	6	2967	2972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017035	CTA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311889
38	NC_017035	ACG	2	6	3169	3174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311889
39	NC_017035	GAA	2	6	3226	3231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311889
40	NC_017035	ACG	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017035	TTG	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017035	TAA	3	9	3639	3647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017035	TAA	2	6	3693	3698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017035	AGA	2	6	3872	3877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017035	TAG	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311891
46	NC_017035	GAC	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311891
47	NC_017035	TAA	2	6	4344	4349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311891
48	NC_017035	GAA	2	6	4378	4383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311891
49	NC_017035	ACA	2	6	4482	4487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311891
50	NC_017035	TAC	2	6	4564	4569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311891
51	NC_017035	AAC	2	6	4642	4647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311891
52	NC_017035	CAG	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311891
53	NC_017035	CAG	2	6	4994	4999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311891
54	NC_017035	TAA	2	6	5150	5155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311891
55	NC_017035	GTT	2	6	5156	5161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311891
56	NC_017035	TCT	2	6	5196	5201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311891
57	NC_017035	TAT	2	6	5219	5224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311891
58	NC_017035	ATA	2	6	5338	5343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.