MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanocella conradii HZ254 chromosome

Total Repeats: 29950

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017034	CCT	2	6	101	106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318454
2	NC_017034	GTA	2	6	134	139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318454
3	NC_017034	GGC	2	6	335	340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318454
4	NC_017034	GCC	2	6	387	392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318454
5	NC_017034	CGC	2	6	529	534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318454
6	NC_017034	AGG	2	6	607	612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318454
7	NC_017034	AGG	2	6	652	657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318454
8	NC_017034	CTC	2	6	767	772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318454
9	NC_017034	AGG	3	9	1034	1042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318455
10	NC_017034	TGG	2	6	1145	1150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318455
11	NC_017034	AGG	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318455
12	NC_017034	TGC	2	6	1297	1302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318455
13	NC_017034	GAG	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318455
14	NC_017034	CAT	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318455
15	NC_017034	TAT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383318455
16	NC_017034	GGC	2	6	1501	1506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318455
17	NC_017034	ACG	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318456
18	NC_017034	GAG	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318456
19	NC_017034	GTG	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318456
20	NC_017034	TGG	2	6	1894	1899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318456
21	NC_017034	CCT	2	6	2135	2140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318456
22	NC_017034	GCC	2	6	2181	2186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318456
23	NC_017034	GAG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318456
24	NC_017034	CAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318456
25	NC_017034	CCT	2	6	2369	2374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318456
26	NC_017034	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318456
27	NC_017034	TTC	2	6	2409	2414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383318456
28	NC_017034	CGG	2	6	2417	2422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318456
29	NC_017034	AGG	2	6	2431	2436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318456
30	NC_017034	TAG	2	6	2440	2445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318456
31	NC_017034	ATA	2	6	2463	2468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383318456
32	NC_017034	GCG	2	6	2628	2633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318456
33	NC_017034	GAC	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318456
34	NC_017034	CAT	2	6	2723	2728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318456
35	NC_017034	CGG	2	6	2751	2756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318456
36	NC_017034	GCC	2	6	2853	2858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318456
37	NC_017034	CCT	2	6	2870	2875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318456
38	NC_017034	GAG	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318456
39	NC_017034	TCA	2	6	2944	2949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318456
40	NC_017034	CGT	2	6	3098	3103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318456
41	NC_017034	CTG	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318456
42	NC_017034	ACG	2	6	3285	3290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318456
43	NC_017034	CCA	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383318456
44	NC_017034	TAA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383318456
45	NC_017034	TCA	2	6	3391	3396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318456
46	NC_017034	GTA	3	9	3464	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318457
47	NC_017034	TTG	2	6	3516	3521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383318457
48	NC_017034	GCC	2	6	3529	3534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318457
49	NC_017034	TAA	2	6	3653	3658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383318457
50	NC_017034	ATT	2	6	3719	3724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383318457
51	NC_017034	TGG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318457
52	NC_017034	GCT	2	6	3763	3768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318457
53	NC_017034	GCT	2	6	3923	3928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318457
54	NC_017034	TAG	2	6	3930	3935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318457
55	NC_017034	CTT	2	6	3947	3952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383318457
56	NC_017034	AAG	2	6	4201	4206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383318457
57	NC_017034	CCT	2	6	4219	4224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318457
58	NC_017034	CAC	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383318457
59	NC_017034	CCA	3	9	4426	4434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383318457
60	NC_017034	TCG	2	6	4515	4520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318457
61	NC_017034	AAG	2	6	4521	4526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383318457
62	NC_017034	TCA	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318457
63	NC_017034	GGT	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318457
64	NC_017034	CCG	2	6	4876	4881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318457
65	NC_017034	ATG	2	6	5022	5027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318457
66	NC_017034	CTT	2	6	5042	5047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383318457
67	NC_017034	CTC	2	6	5075	5080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318457
68	NC_017034	TCC	2	6	5100	5105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318457
69	NC_017034	TCG	2	6	5121	5126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318457
70	NC_017034	ATT	2	6	5199	5204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383318457
71	NC_017034	ATG	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318458
72	NC_017034	TCG	2	6	5565	5570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318458
73	NC_017034	GAG	2	6	5842	5847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318459
74	NC_017034	TCG	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318459
75	NC_017034	GCG	2	6	5938	5943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318459
76	NC_017034	GTC	2	6	5956	5961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318459
77	NC_017034	TCG	2	6	6032	6037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318459
78	NC_017034	CGA	2	6	6192	6197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318459
79	NC_017034	CGA	2	6	6228	6233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318459
80	NC_017034	AAG	2	6	6244	6249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383318459
81	NC_017034	CGG	2	6	6297	6302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318459
82	NC_017034	GGA	2	6	6309	6314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318459
83	NC_017034	CAG	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318460
84	NC_017034	GTG	2	6	6666	6671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318460
85	NC_017034	ATG	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318460
86	NC_017034	AGG	2	6	6810	6815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318460
87	NC_017034	GGT	2	6	6869	6874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318460
88	NC_017034	GAT	2	6	6911	6916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318460
89	NC_017034	ACT	2	6	6936	6941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318460
90	NC_017034	GCC	2	6	7004	7009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318460
91	NC_017034	GAT	2	6	7043	7048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318460
92	NC_017034	TCA	2	6	7063	7068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318460
93	NC_017034	CGT	2	6	7078	7083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318460
94	NC_017034	ATA	2	6	7113	7118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383318460
95	NC_017034	AAG	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383318460
96	NC_017034	GAC	2	6	8544	8549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318461
97	NC_017034	CAT	2	6	8574	8579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318461
98	NC_017034	ACA	2	6	8666	8671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383318461
99	NC_017034	CCG	2	6	8749	8754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318461
100	NC_017034	ATG	2	6	8837	8842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318461
101	NC_017034	AAC	2	6	8869	8874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383318461
102	NC_017034	GAG	2	6	8992	8997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318461
103	NC_017034	ATA	2	6	9148	9153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383318461
104	NC_017034	TAT	2	6	9235	9240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383318461
105	NC_017034	GAC	2	6	9256	9261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318461
106	NC_017034	GAC	2	6	9304	9309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318461
107	NC_017034	GGT	2	6	9320	9325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318461
108	NC_017034	GCG	2	6	9547	9552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318462
109	NC_017034	CTT	2	6	9662	9667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383318462
110	NC_017034	ATG	2	6	9741	9746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318462
111	NC_017034	CCT	2	6	9796	9801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318462
112	NC_017034	AGG	2	6	9975	9980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383318462
113	NC_017034	CGG	2	6	10090	10095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318462
114	NC_017034	GTG	2	6	10098	10103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318462
115	NC_017034	GGT	2	6	10109	10114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318462
116	NC_017034	CGG	2	6	10171	10176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318462
117	NC_017034	CGA	2	6	10297	10302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318462
118	NC_017034	TTC	2	6	10368	10373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383318462
119	NC_017034	CGC	2	6	10454	10459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318462
120	NC_017034	TCC	2	6	10500	10505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318462
121	NC_017034	ATA	2	6	10671	10676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383318463
122	NC_017034	ATG	2	6	10711	10716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318463
123	NC_017034	TAT	2	6	10731	10736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383318463
124	NC_017034	CCA	2	6	10805	10810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383318463
125	NC_017034	CCA	2	6	10868	10873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383318463
126	NC_017034	TGA	2	6	10889	10894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318463
127	NC_017034	GCA	2	6	11040	11045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318463
128	NC_017034	GCC	2	6	11137	11142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318463
129	NC_017034	ATC	2	6	11146	11151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318463
130	NC_017034	CGC	2	6	11240	11245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318463
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253	NC_017034	TCC	2	6	20824	20829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318472
254	NC_017034	TCG	2	6	20995	21000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318472
255	NC_017034	CGG	2	6	21002	21007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318472
256	NC_017034	ACG	2	6	21208	21213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318472
257	NC_017034	GCC	2	6	21292	21297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318472
258	NC_017034	GTC	2	6	21520	21525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383318472
259	NC_017034	GAT	2	6	21591	21596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318472
260	NC_017034	CAT	2	6	22025	22030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318473
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262	NC_017034	ACG	2	6	22101	22106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318473
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272	NC_017034	CGA	2	6	23039	23044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383318475
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274	NC_017034	GAT	2	6	23165	23170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318475
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282	NC_017034	GTG	2	6	23475	23480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383318475
283	NC_017034	AGA	2	6	23522	23527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383318475
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291	NC_017034	CGG	2	6	24073	24078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383318475
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361	NC_017034	CCT	2	6	29097	29102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318480
362	NC_017034	TCA	2	6	29136	29141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318480
363	NC_017034	TCC	2	6	29258	29263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383318480
364	NC_017034	GAT	2	6	29356	29361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383318480
365	NC_017034	TAC	2	6	29370	29375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318480
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367	NC_017034	ACA	2	6	29779	29784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383318481
368	NC_017034	ACA	2	6	29897	29902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383318481
369	NC_017034	CAA	2	6	29963	29968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383318481
370	NC_017034	CAT	2	6	29969	29974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318481
371	NC_017034	TTC	2	6	30127	30132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383318481
372	NC_017034	TGT	2	6	30306	30311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383318481
373	NC_017034	AAG	2	6	30357	30362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383318481
374	NC_017034	ACT	2	6	30371	30376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383318481
375	NC_017034	ACC	2	6	30436	30441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383318481
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377	NC_017034	CCG	2	6	30723	30728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383318482
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