MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Frateuria aurantia DSM 6220 chromosome

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017033	AGTCGG	2	12	68088	68099	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017033	GAGGCC	2	12	69033	69044	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017033	CTGTTC	2	12	70251	70262	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017033	ATGCCG	2	12	76871	76882	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017033	CCAGAT	2	12	141307	141318	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017033	GCAGCT	2	12	141388	141399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017033	CGGTGA	2	12	144143	144154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017033	CTCAGT	2	12	184234	184245	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017033	CCGGTA	2	12	218608	218619	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017033	CGGGAG	2	12	235137	235148	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017033	GCTGCC	2	12	282722	282733	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017033	CTGGCT	2	12	287052	287063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017033	CCCGGC	2	12	318846	318857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017033	GACTCT	2	12	332383	332394	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017033	GACTCT	2	12	332779	332790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017033	GCATCG	2	12	336408	336419	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017033	ATGCCG	2	12	352825	352836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017033	GCCACG	2	12	380211	380222	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017033	CGGCCA	2	12	380288	380299	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017033	GCCGGA	2	12	400332	400343	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017033	GCGGTC	2	12	434009	434020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017033	GCGGTC	2	12	435420	435431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017033	GCCGGA	2	12	439014	439025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017033	TGCCGT	2	12	456622	456633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017033	CCGTCT	2	12	459934	459945	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017033	CGCGGC	2	12	480261	480272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017033	CATGAC	2	12	484446	484457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017033	TGACGA	2	12	493332	493343	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017033	TCGGCA	2	12	501716	501727	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017033	ATCATT	2	12	514493	514504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017033	CCCGGT	2	12	514801	514812	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017033	GCCAGG	3	18	579876	579893	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017033	GCCGGG	2	12	579894	579905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017033	CCGGCT	2	12	633263	633274	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017033	CGGTCG	3	18	698190	698207	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017033	TGCAGG	2	12	704885	704896	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017033	TATCAT	2	12	732396	732407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017033	GGCTTT	2	12	780558	780569	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017033	GCCGGG	2	12	842848	842859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017033	CACGGG	2	12	849277	849288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017033	ATGAAG	2	12	851731	851742	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017033	CGAGAT	2	12	874421	874432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017033	TGCGAT	2	12	963450	963461	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017033	GGCCCT	2	12	963831	963842	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017033	GCCAGG	2	12	982129	982140	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017033	ATGGCA	2	12	991760	991771	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017033	GGCCAT	2	12	1062107	1062118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017033	TGCAGC	2	12	1073811	1073822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017033	CGGCCG	2	12	1074132	1074143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017033	TGTCCG	2	12	1074686	1074697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017033	TGGATT	2	12	1095171	1095182	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017033	CTCAGG	2	12	1095679	1095690	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017033	GAAGAT	2	12	1100511	1100522	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017033	GCATAG	2	12	1105498	1105509	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017033	ATCCAT	2	12	1108918	1108929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017033	GATGGT	2	12	1128036	1128047	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017033	CAAATT	2	12	1153881	1153892	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017033	GCGACT	2	12	1162933	1162944	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017033	CCATGC	2	12	1171504	1171515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017033	GAGATC	2	12	1190054	1190065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017033	TCCGGC	2	12	1236068	1236079	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017033	GCAAAA	2	12	1252158	1252169	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017033	GCAAAA	2	12	1253693	1253704	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017033	CAACCA	2	12	1319232	1319243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017033	CGGCTG	2	12	1338102	1338113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017033	GCAGGC	2	12	1352675	1352686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017033	GCCGGT	2	12	1365502	1365513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017033	TCGGTC	2	12	1413972	1413983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017033	GGCAGG	2	12	1414339	1414350	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017033	CGAGCA	2	12	1431518	1431529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017033	GGCAGG	2	12	1433059	1433070	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017033	GCGACG	2	12	1466095	1466106	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017033	GCGCAT	2	12	1466171	1466182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017033	GACTTC	2	12	1581070	1581081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017033	CTGCCG	2	12	1606539	1606550	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017033	AGGATG	2	12	1607448	1607459	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017033	GGCGCA	2	12	1648662	1648673	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017033	TAAAAA	2	12	1685893	1685904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017033	TGGCCG	2	12	1694983	1694994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017033	GTGGCC	2	12	1711955	1711966	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017033	GGATGT	2	12	1734157	1734168	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017033	TGGGAA	2	12	1770305	1770316	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017033	CCTGAT	2	12	1796474	1796485	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017033	GCCGCA	2	12	1830232	1830243	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017033	CTGATC	2	12	1866993	1867004	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017033	CGCTGG	2	12	1882310	1882321	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017033	TGCAAG	2	12	1885354	1885365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017033	CGGCAA	2	12	1972520	1972531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017033	GCCATC	2	12	1979614	1979625	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017033	GACTCG	2	12	2008177	2008188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017033	GGCCAT	2	12	2020310	2020321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017033	ACCGTC	2	12	2058533	2058544	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017033	AGCGGA	2	12	2067637	2067648	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017033	GCCAGC	2	12	2067655	2067666	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017033	CAAAGA	2	12	2080036	2080047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017033	ACCGCC	2	12	2119488	2119499	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017033	CGGACC	2	12	2126462	2126473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017033	GTCCAG	2	12	2239633	2239644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017033	CCATGG	2	12	2247941	2247952	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017033	AAAGCC	2	12	2286547	2286558	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017033	GAAAGC	2	12	2289305	2289316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017033	CTGGAT	2	12	2292734	2292745	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017033	TGCCGA	2	12	2304988	2304999	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017033	CCCGGA	2	12	2322751	2322762	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017033	CGAGGC	2	12	2352263	2352274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017033	CCCCAC	2	12	2369918	2369929	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
107	NC_017033	CGCTGG	2	12	2402175	2402186	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017033	CAGCGC	2	12	2403999	2404010	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017033	CCACCC	2	12	2435192	2435203	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
110	NC_017033	TCCGTA	2	12	2484081	2484092	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017033	GACCTG	2	12	2486836	2486847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017033	CGCGGC	2	12	2556493	2556504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017033	GGCTTC	2	12	2585699	2585710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017033	ATTTGT	2	12	2637867	2637878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017033	CTGGGC	2	12	2667301	2667312	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017033	GCAGGC	2	12	2682021	2682032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017033	CCCGTC	2	12	2703391	2703402	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017033	AGAAAA	2	12	2733243	2733254	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017033	CCCGCT	2	12	2750493	2750504	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017033	GCCCCG	2	12	2799218	2799229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017033	GTTCCC	2	12	2808096	2808107	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017033	GGCATC	2	12	2826178	2826189	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017033	AGCGAA	2	12	2830114	2830125	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017033	AAATGG	2	12	2836085	2836096	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017033	GACGGC	2	12	2836125	2836136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017033	CTCGCC	2	12	2836266	2836277	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017033	CTCCCC	2	12	2872909	2872920	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
128	NC_017033	CGAAAG	2	12	2874194	2874205	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017033	CCCGTC	2	12	2923676	2923687	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017033	GCAGCG	2	12	2946739	2946750	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017033	CGCCCT	2	12	3015498	3015509	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017033	CCATGG	2	12	3019820	3019831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017033	GCAAGC	2	12	3121065	3121076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017033	CAGGCC	2	12	3156087	3156098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017033	GGAAAC	2	12	3178671	3178682	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017033	GCGTGG	2	12	3198681	3198692	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017033	CCGGGT	2	12	3198812	3198823	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017033	CCACCG	2	12	3211322	3211333	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017033	GTCCAC	2	12	3228342	3228353	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017033	ATATTT	2	12	3245017	3245028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017033	CAGCTG	2	12	3249363	3249374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017033	CGCCGT	2	12	3302563	3302574	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017033	TGTCCG	2	12	3322461	3322472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017033	ATCAGA	2	12	3332279	3332290	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_017033	CTTGCC	2	12	3364976	3364987	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017033	TGTTAC	2	12	3370445	3370456	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_017033	TGGCGA	2	12	3387842	3387853	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017033	ATCCTT	2	12	3408130	3408141	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017033	TGGTGC	2	12	3415633	3415644	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_017033	CAAAAC	2	12	3428915	3428926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017033	GTCCCG	2	12	3444757	3444768	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017033	CTCGTA	2	12	3479003	3479014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017033	AGCCAG	2	12	3487453	3487464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017033	CAGTCA	2	12	3504751	3504762	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_017033	AAACCC	2	12	3533371	3533382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_017033	GACGGC	2	12	3563960	3563971	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017033	TCGGCA	2	12	3575124	3575135	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017033	GGTCCC	2	12	3587594	3587605	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.