MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017032	TCTAT	2	10	558	567	20 %	60 %	0 %	20 %	383315283
2	NC_017032	CTTTT	3	15	5182	5196	0 %	80 %	0 %	20 %	383315290
3	NC_017032	TGATC	2	10	5229	5238	20 %	40 %	20 %	20 %	383315290
4	NC_017032	ATCAA	2	10	6317	6326	60 %	20 %	0 %	20 %	383315291
5	NC_017032	GATCA	2	10	7758	7767	40 %	20 %	20 %	20 %	383315292
6	NC_017032	ATCCA	2	10	10826	10835	40 %	20 %	0 %	40 %	383315295
7	NC_017032	ACAAA	2	10	11987	11996	80 %	0 %	0 %	20 %	383315295
8	NC_017032	CGAAA	2	10	16845	16854	60 %	0 %	20 %	20 %	383315301
9	NC_017032	GCTTA	2	10	18693	18702	20 %	40 %	20 %	20 %	383315302
10	NC_017032	ATTTT	2	10	20328	20337	20 %	80 %	0 %	0 %	383315302
11	NC_017032	AGTAC	2	10	21844	21853	40 %	20 %	20 %	20 %	383315303
12	NC_017032	AAAAG	2	10	24011	24020	80 %	0 %	20 %	0 %	383315304
13	NC_017032	AAAAG	2	10	29843	29852	80 %	0 %	20 %	0 %	383315310
14	NC_017032	GGAAA	2	10	31156	31165	60 %	0 %	40 %	0 %	383315314
15	NC_017032	GGAAT	2	10	32472	32481	40 %	20 %	40 %	0 %	383315315
16	NC_017032	GAAAA	2	10	33836	33845	80 %	0 %	20 %	0 %	383315317
17	NC_017032	ACAAA	2	10	34417	34426	80 %	0 %	0 %	20 %	383315318
18	NC_017032	AATGG	2	10	35893	35902	40 %	20 %	40 %	0 %	383315319
19	NC_017032	AAAAG	2	10	38068	38077	80 %	0 %	20 %	0 %	383315320
20	NC_017032	ATCCA	2	10	39122	39131	40 %	20 %	0 %	40 %	383315320
21	NC_017032	GAAAA	2	10	39449	39458	80 %	0 %	20 %	0 %	383315320
22	NC_017032	AAGAA	2	10	39470	39479	80 %	0 %	20 %	0 %	383315320
23	NC_017032	TTAAA	2	10	40333	40342	60 %	40 %	0 %	0 %	383315322
24	NC_017032	AAAGC	2	10	41566	41575	60 %	0 %	20 %	20 %	383315324
25	NC_017032	CTTTA	2	10	42172	42181	20 %	60 %	0 %	20 %	383315325
26	NC_017032	CGAAA	2	10	43345	43354	60 %	0 %	20 %	20 %	383315326
27	NC_017032	GGAGC	2	10	43692	43701	20 %	0 %	60 %	20 %	383315327
28	NC_017032	CTCAA	2	10	45550	45559	40 %	20 %	0 %	40 %	383315331
29	NC_017032	ATATT	2	10	45797	45806	40 %	60 %	0 %	0 %	383315331
30	NC_017032	TAAGT	2	10	46103	46112	40 %	40 %	20 %	0 %	383315331
31	NC_017032	GATTA	2	10	48792	48801	40 %	40 %	20 %	0 %	383315334
32	NC_017032	TAAAT	2	10	48991	49000	60 %	40 %	0 %	0 %	383315334
33	NC_017032	AGCTC	2	10	49465	49474	20 %	20 %	20 %	40 %	383315335
34	NC_017032	CAAGA	2	10	49610	49619	60 %	0 %	20 %	20 %	383315335
35	NC_017032	TAAAC	2	10	49826	49835	60 %	20 %	0 %	20 %	383315336
36	NC_017032	TTTAT	2	10	50645	50654	20 %	80 %	0 %	0 %	383315337
37	NC_017032	TTCAT	2	10	51381	51390	20 %	60 %	0 %	20 %	383315338
38	NC_017032	GATTT	2	10	51691	51700	20 %	60 %	20 %	0 %	383315339
39	NC_017032	GGTAT	2	10	52617	52626	20 %	40 %	40 %	0 %	383315340
40	NC_017032	AAGCA	2	10	52965	52974	60 %	0 %	20 %	20 %	383315340
41	NC_017032	ATTAT	2	10	55426	55435	40 %	60 %	0 %	0 %	383315344
42	NC_017032	AAAAT	2	10	56159	56168	80 %	20 %	0 %	0 %	383315345

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.