MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p1

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017032	ATGA	2	8	1	8	50 %	25 %	25 %	0 %	383315283
2	NC_017032	TAAA	2	8	308	315	75 %	25 %	0 %	0 %	383315283
3	NC_017032	TATT	2	8	3001	3008	25 %	75 %	0 %	0 %	383315285
4	NC_017032	TTTC	2	8	3166	3173	0 %	75 %	0 %	25 %	383315286
5	NC_017032	AATG	2	8	3327	3334	50 %	25 %	25 %	0 %	383315286
6	NC_017032	AAGG	2	8	3618	3625	50 %	0 %	50 %	0 %	383315287
7	NC_017032	AAAG	2	8	3701	3708	75 %	0 %	25 %	0 %	383315287
8	NC_017032	GAAA	2	8	3786	3793	75 %	0 %	25 %	0 %	383315287
9	NC_017032	GAAA	2	8	3916	3923	75 %	0 %	25 %	0 %	383315288
10	NC_017032	TTGT	2	8	4024	4031	0 %	75 %	25 %	0 %	383315288
11	NC_017032	TAGA	2	8	4237	4244	50 %	25 %	25 %	0 %	383315289
12	NC_017032	TTTA	2	8	4264	4271	25 %	75 %	0 %	0 %	383315289
13	NC_017032	AATA	2	8	4925	4932	75 %	25 %	0 %	0 %	383315289
14	NC_017032	TGTT	2	8	5107	5114	0 %	75 %	25 %	0 %	383315290
15	NC_017032	CTTT	2	8	5813	5820	0 %	75 %	0 %	25 %	383315290
16	NC_017032	GATT	2	8	5885	5892	25 %	50 %	25 %	0 %	383315290
17	NC_017032	GATG	2	8	6182	6189	25 %	25 %	50 %	0 %	383315291
18	NC_017032	AACG	2	8	6357	6364	50 %	0 %	25 %	25 %	383315291
19	NC_017032	TTAG	2	8	6652	6659	25 %	50 %	25 %	0 %	383315291
20	NC_017032	AAAG	2	8	6765	6772	75 %	0 %	25 %	0 %	383315291
21	NC_017032	AAAG	2	8	6823	6830	75 %	0 %	25 %	0 %	383315291
22	NC_017032	GACA	2	8	7477	7484	50 %	0 %	25 %	25 %	383315292
23	NC_017032	CAAA	2	8	7591	7598	75 %	0 %	0 %	25 %	383315292
24	NC_017032	AAGT	2	8	8232	8239	50 %	25 %	25 %	0 %	383315292
25	NC_017032	CTTG	2	8	8826	8833	0 %	50 %	25 %	25 %	383315292
26	NC_017032	AGCG	2	8	9001	9008	25 %	0 %	50 %	25 %	383315293
27	NC_017032	ATCG	2	8	9044	9051	25 %	25 %	25 %	25 %	383315293
28	NC_017032	GGAA	2	8	9208	9215	50 %	0 %	50 %	0 %	383315293
29	NC_017032	ATCG	2	8	9365	9372	25 %	25 %	25 %	25 %	383315293
30	NC_017032	ACTT	2	8	9416	9423	25 %	50 %	0 %	25 %	383315293
31	NC_017032	TTTC	2	8	9599	9606	0 %	75 %	0 %	25 %	383315293
32	NC_017032	TTTG	2	8	9689	9696	0 %	75 %	25 %	0 %	383315294
33	NC_017032	AACA	2	8	9774	9781	75 %	0 %	0 %	25 %	383315294
34	NC_017032	GATG	2	8	10021	10028	25 %	25 %	50 %	0 %	383315294
35	NC_017032	AAAC	2	8	11027	11034	75 %	0 %	0 %	25 %	383315295
36	NC_017032	TCTA	2	8	11130	11137	25 %	50 %	0 %	25 %	383315295
37	NC_017032	AATG	2	8	11316	11323	50 %	25 %	25 %	0 %	383315295
38	NC_017032	CGAT	2	8	11877	11884	25 %	25 %	25 %	25 %	383315295
39	NC_017032	ACAA	2	8	12353	12360	75 %	0 %	0 %	25 %	383315295
40	NC_017032	CAAG	2	8	13219	13226	50 %	0 %	25 %	25 %	383315296
41	NC_017032	ACCA	2	8	14393	14400	50 %	0 %	0 %	50 %	383315296
42	NC_017032	GGAA	2	8	14491	14498	50 %	0 %	50 %	0 %	383315296
43	NC_017032	TTTA	2	8	15872	15879	25 %	75 %	0 %	0 %	383315299
44	NC_017032	AGTG	2	8	16910	16917	25 %	25 %	50 %	0 %	383315301
45	NC_017032	GAAA	2	8	17291	17298	75 %	0 %	25 %	0 %	383315301
46	NC_017032	TCAA	2	8	17429	17436	50 %	25 %	0 %	25 %	383315301
47	NC_017032	AAAT	2	8	17509	17516	75 %	25 %	0 %	0 %	383315301
48	NC_017032	TAAA	2	8	17566	17573	75 %	25 %	0 %	0 %	383315301
49	NC_017032	GAAA	2	8	17705	17712	75 %	0 %	25 %	0 %	383315301
50	NC_017032	GGAT	2	8	18222	18229	25 %	25 %	50 %	0 %	383315301
51	NC_017032	GCTT	2	8	18253	18260	0 %	50 %	25 %	25 %	383315301
52	NC_017032	ATCA	2	8	18294	18301	50 %	25 %	0 %	25 %	383315301
53	NC_017032	TCAA	2	8	18336	18343	50 %	25 %	0 %	25 %	383315301
54	NC_017032	CAAG	2	8	18360	18367	50 %	0 %	25 %	25 %	383315301
55	NC_017032	CAAT	2	8	19310	19317	50 %	25 %	0 %	25 %	383315302
56	NC_017032	AATA	2	8	19436	19443	75 %	25 %	0 %	0 %	383315302
57	NC_017032	GAAT	2	8	19597	19604	50 %	25 %	25 %	0 %	383315302
58	NC_017032	GAAA	2	8	19887	19894	75 %	0 %	25 %	0 %	383315302
59	NC_017032	TCTT	2	8	20250	20257	0 %	75 %	0 %	25 %	383315302
60	NC_017032	GGAA	2	8	20374	20381	50 %	0 %	50 %	0 %	383315302
61	NC_017032	ACAT	2	8	20835	20842	50 %	25 %	0 %	25 %	383315302
62	NC_017032	ATTT	2	8	21469	21476	25 %	75 %	0 %	0 %	383315303
63	NC_017032	ATTT	2	8	21533	21540	25 %	75 %	0 %	0 %	383315303
64	NC_017032	TGAT	2	8	21683	21690	25 %	50 %	25 %	0 %	383315303
65	NC_017032	GAAA	2	8	21906	21913	75 %	0 %	25 %	0 %	383315303
66	NC_017032	TATT	3	12	22030	22041	25 %	75 %	0 %	0 %	383315303
67	NC_017032	CAAT	2	8	23393	23400	50 %	25 %	0 %	25 %	383315303
68	NC_017032	AAAT	2	8	23453	23460	75 %	25 %	0 %	0 %	383315303
69	NC_017032	GAAT	2	8	24748	24755	50 %	25 %	25 %	0 %	383315306
70	NC_017032	CGTA	2	8	24774	24781	25 %	25 %	25 %	25 %	383315306
71	NC_017032	AGTT	3	12	24796	24807	25 %	50 %	25 %	0 %	383315306
72	NC_017032	ATGA	2	8	25122	25129	50 %	25 %	25 %	0 %	383315306
73	NC_017032	TGAT	2	8	25207	25214	25 %	50 %	25 %	0 %	383315307
74	NC_017032	TGAT	2	8	25471	25478	25 %	50 %	25 %	0 %	383315307
75	NC_017032	GATC	2	8	25509	25516	25 %	25 %	25 %	25 %	383315307
76	NC_017032	GGAT	2	8	25705	25712	25 %	25 %	50 %	0 %	383315307
77	NC_017032	TTAA	2	8	26733	26740	50 %	50 %	0 %	0 %	383315307
78	NC_017032	AAAT	2	8	27841	27848	75 %	25 %	0 %	0 %	383315308
79	NC_017032	ATTA	2	8	28148	28155	50 %	50 %	0 %	0 %	383315308
80	NC_017032	CATT	2	8	28320	28327	25 %	50 %	0 %	25 %	383315308
81	NC_017032	GATC	2	8	28342	28349	25 %	25 %	25 %	25 %	383315308
82	NC_017032	AAAG	2	8	28677	28684	75 %	0 %	25 %	0 %	383315309
83	NC_017032	TGAA	2	8	29665	29672	50 %	25 %	25 %	0 %	383315310
84	NC_017032	GAAA	2	8	30099	30106	75 %	0 %	25 %	0 %	383315311
85	NC_017032	ATTG	2	8	30793	30800	25 %	50 %	25 %	0 %	383315313
86	NC_017032	AAGA	2	8	30833	30840	75 %	0 %	25 %	0 %	383315313
87	NC_017032	ACGA	2	8	30911	30918	50 %	0 %	25 %	25 %	383315313
88	NC_017032	AGGA	2	8	30954	30961	50 %	0 %	50 %	0 %	383315313
89	NC_017032	TATG	2	8	31088	31095	25 %	50 %	25 %	0 %	383315314
90	NC_017032	TCTT	2	8	31722	31729	0 %	75 %	0 %	25 %	383315315
91	NC_017032	AGAA	2	8	31760	31767	75 %	0 %	25 %	0 %	383315315
92	NC_017032	CAAA	2	8	31917	31924	75 %	0 %	0 %	25 %	383315315
93	NC_017032	TGAA	2	8	32099	32106	50 %	25 %	25 %	0 %	383315315
94	NC_017032	GAAT	2	8	32820	32827	50 %	25 %	25 %	0 %	383315315
95	NC_017032	AAGA	2	8	32993	33000	75 %	0 %	25 %	0 %	383315315
96	NC_017032	TTCA	2	8	33187	33194	25 %	50 %	0 %	25 %	383315316
97	NC_017032	GAAA	2	8	33816	33823	75 %	0 %	25 %	0 %	383315317
98	NC_017032	ATTT	2	8	33913	33920	25 %	75 %	0 %	0 %	383315318
99	NC_017032	TGAA	2	8	33953	33960	50 %	25 %	25 %	0 %	383315318
100	NC_017032	GAAA	2	8	34068	34075	75 %	0 %	25 %	0 %	383315318
101	NC_017032	GATC	2	8	34164	34171	25 %	25 %	25 %	25 %	383315318
102	NC_017032	GAAA	2	8	34404	34411	75 %	0 %	25 %	0 %	383315318
103	NC_017032	GCAG	2	8	35187	35194	25 %	0 %	50 %	25 %	383315318
104	NC_017032	ATGA	2	8	35326	35333	50 %	25 %	25 %	0 %	383315318
105	NC_017032	ATTC	2	8	35355	35362	25 %	50 %	0 %	25 %	383315318
106	NC_017032	ATCA	2	8	35380	35387	50 %	25 %	0 %	25 %	383315318
107	NC_017032	AAGA	2	8	35503	35510	75 %	0 %	25 %	0 %	383315318
108	NC_017032	AGGA	2	8	36192	36199	50 %	0 %	50 %	0 %	383315319
109	NC_017032	GAAG	2	8	36207	36214	50 %	0 %	50 %	0 %	383315319
110	NC_017032	TGAT	2	8	36236	36243	25 %	50 %	25 %	0 %	383315319
111	NC_017032	GAAA	2	8	36647	36654	75 %	0 %	25 %	0 %	383315319
112	NC_017032	GTAC	2	8	37049	37056	25 %	25 %	25 %	25 %	383315319
113	NC_017032	CAAT	2	8	37519	37526	50 %	25 %	0 %	25 %	383315320
114	NC_017032	GAAG	2	8	38662	38669	50 %	0 %	50 %	0 %	383315320
115	NC_017032	AGCC	2	8	39356	39363	25 %	0 %	25 %	50 %	383315320
116	NC_017032	GATC	2	8	40011	40018	25 %	25 %	25 %	25 %	383315322
117	NC_017032	AGAA	2	8	40164	40171	75 %	0 %	25 %	0 %	383315322
118	NC_017032	GAAA	2	8	40668	40675	75 %	0 %	25 %	0 %	383315323
119	NC_017032	TCAC	2	8	40793	40800	25 %	25 %	0 %	50 %	383315323
120	NC_017032	CGGA	2	8	41477	41484	25 %	0 %	50 %	25 %	383315324
121	NC_017032	CAAT	2	8	41703	41710	50 %	25 %	0 %	25 %	383315324
122	NC_017032	ATGT	2	8	42320	42327	25 %	50 %	25 %	0 %	383315325
123	NC_017032	CGAT	2	8	42350	42357	25 %	25 %	25 %	25 %	383315325
124	NC_017032	ATAA	2	8	42364	42371	75 %	25 %	0 %	0 %	383315325
125	NC_017032	AACA	2	8	43499	43506	75 %	0 %	0 %	25 %	383315327
126	NC_017032	TGAA	2	8	43516	43523	50 %	25 %	25 %	0 %	383315327
127	NC_017032	GAAA	2	8	44136	44143	75 %	0 %	25 %	0 %	383315327
128	NC_017032	TGTT	2	8	44352	44359	0 %	75 %	25 %	0 %	383315328
129	NC_017032	TTTG	2	8	44430	44437	0 %	75 %	25 %	0 %	383315328
130	NC_017032	ATTG	2	8	44665	44672	25 %	50 %	25 %	0 %	383315329
131	NC_017032	GAAA	2	8	45190	45197	75 %	0 %	25 %	0 %	383315330
132	NC_017032	GAAA	2	8	45518	45525	75 %	0 %	25 %	0 %	383315331
133	NC_017032	TTTC	2	8	45581	45588	0 %	75 %	0 %	25 %	383315331
134	NC_017032	TGAT	2	8	45679	45686	25 %	50 %	25 %	0 %	383315331
135	NC_017032	TTCT	2	8	45892	45899	0 %	75 %	0 %	25 %	383315331
136	NC_017032	AGAT	2	8	46276	46283	50 %	25 %	25 %	0 %	383315331
137	NC_017032	ATCG	2	8	47071	47078	25 %	25 %	25 %	25 %	383315333
138	NC_017032	ATTT	2	8	47196	47203	25 %	75 %	0 %	0 %	383315333
139	NC_017032	TTAG	2	8	47996	48003	25 %	50 %	25 %	0 %	383315334
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.