MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017031	AGCTTC	2	12	21470	21481	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017031	TTTTCT	2	12	22072	22083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017031	CAGAAG	2	12	74750	74761	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017031	CTCACT	2	12	121037	121048	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017031	AGCCGA	2	12	131087	131098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017031	GCCGGA	2	12	143031	143042	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017031	TGGGGC	2	12	182601	182612	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017031	TTTGCC	2	12	320995	321006	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017031	ACGGTA	2	12	322064	322075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017031	AATTTT	2	12	325325	325336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017031	GCTATA	2	12	378634	378645	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017031	ACGTTG	2	12	379162	379173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017031	TGAGTA	2	12	390428	390439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017031	CTAAAA	2	12	397513	397524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017031	AGGGCT	2	12	429722	429733	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017031	AGCTTT	2	12	469881	469892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017031	GTGCCT	2	12	480540	480551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017031	TGGTTC	2	12	483951	483962	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017031	GCGCAA	2	12	524593	524604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017031	CTCGGT	2	12	580991	581002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017031	TGCTCG	2	12	584588	584599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017031	AAAAAG	2	12	613866	613877	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017031	GTGTGG	2	12	618512	618523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017031	GTTTTT	2	12	620553	620564	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017031	AGCGAA	2	12	621630	621641	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017031	CTGAGC	2	12	650896	650907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017031	GGCTGC	2	12	770253	770264	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017031	GTTTTT	2	12	796328	796339	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017031	AGGGGT	2	12	874288	874299	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017031	CCGTGC	2	12	939229	939240	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017031	GACGGT	2	12	948240	948251	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017031	GTGGTT	2	12	966158	966169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017031	GTGTGG	2	12	1029439	1029450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017031	GTTTTT	2	12	1031478	1031489	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017031	AGCGAA	2	12	1032554	1032565	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017031	TCAACT	2	12	1085178	1085189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017031	CAATGA	2	12	1128354	1128365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017031	TTTTAT	2	12	1136873	1136884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017031	GATCGC	2	12	1138375	1138386	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017031	AGAAAA	2	12	1150734	1150745	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017031	TCTTTT	2	12	1150755	1150766	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017031	CAAGAA	2	12	1289537	1289548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017031	AATCTA	2	12	1416981	1416992	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017031	TATTTC	2	12	1431127	1431138	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017031	GACGGT	2	12	1450009	1450020	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017031	AATTTC	2	12	1511169	1511180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017031	TCCATT	2	12	1544335	1544346	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017031	CTGTGC	2	12	1551553	1551564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017031	CGTCGA	2	12	1577733	1577744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017031	CGTCGA	2	12	1578072	1578083	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017031	CGTCGA	2	12	1578411	1578422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017031	AGCTGG	2	12	1600396	1600407	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017031	TTGTGT	2	12	1640248	1640259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017031	TTCATT	2	12	1712594	1712605	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017031	TTAGCG	2	12	1745848	1745859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017031	ATTTTT	2	12	1754003	1754014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017031	ACCCCT	2	12	1769035	1769046	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_017031	AAAAGA	2	12	1814945	1814956	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017031	AGCTTT	2	12	1816144	1816155	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017031	ACCTTT	2	12	1835543	1835554	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017031	AGTGGT	2	12	1840387	1840398	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017031	TTCGCT	2	12	1857650	1857661	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017031	AAAAAC	2	12	1858726	1858737	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017031	CACCCA	2	12	1860763	1860774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017031	CAACGC	2	12	1912634	1912645	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017031	CCAAGC	2	12	1923738	1923749	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017031	TAATTT	2	12	1935763	1935774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017031	CGCATA	2	12	1944737	1944748	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017031	AAACAA	2	12	1952129	1952140	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017031	CATTAT	2	12	1978505	1978516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017031	ACAGCC	2	12	1981979	1981990	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017031	TACCCC	2	12	2043760	2043771	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017031	CATATA	2	12	2058520	2058531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017031	ATGTTG	2	12	2065788	2065799	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017031	GATGAG	2	12	2066252	2066263	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017031	CAAGGA	2	12	2066341	2066352	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017031	TTCAAT	2	12	2071113	2071124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017031	GCACGC	2	12	2072331	2072342	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017031	TCCTTA	2	12	2087657	2087668	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017031	AGGTCA	2	12	2088828	2088839	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017031	GCTTGG	2	12	2089316	2089327	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017031	TTTAGT	2	12	2097462	2097473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017031	CCCCCG	2	12	2124341	2124352	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
84	NC_017031	CATAGA	2	12	2189193	2189204	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017031	AGAAAA	2	12	2197534	2197545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017031	CGATGC	2	12	2212531	2212542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017031	TTCGCT	2	12	2230820	2230831	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017031	AAAAAC	2	12	2231897	2231908	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017031	CACCCA	2	12	2233934	2233945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017031	GAATAG	2	12	2240503	2240514	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017031	TCTTTA	2	12	2279844	2279855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017031	TGCCCA	2	12	2309919	2309930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017031	TTTTCT	2	12	2327308	2327319	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.