MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 chromosome

Total Repeats: 1055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017031	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	383313192
2	NC_017031	CACGC	2	10	5734	5743	20 %	0 %	20 %	60 %	383313197
3	NC_017031	CAGTG	2	10	15502	15511	20 %	20 %	40 %	20 %	383313207
4	NC_017031	AAAAT	2	10	16761	16770	80 %	20 %	0 %	0 %	383313209
5	NC_017031	CTTTT	2	10	19236	19245	0 %	80 %	0 %	20 %	383313212
6	NC_017031	GCTCT	2	10	19273	19282	0 %	40 %	20 %	40 %	383313212
7	NC_017031	TGGAT	2	10	23214	23223	20 %	40 %	40 %	0 %	383313220
8	NC_017031	TGCGT	2	10	24497	24506	0 %	40 %	40 %	20 %	383313221
9	NC_017031	CTGAT	2	10	28527	28536	20 %	40 %	20 %	20 %	383313225
10	NC_017031	GGAGC	2	10	29480	29489	20 %	0 %	60 %	20 %	383313226
11	NC_017031	TTGCT	2	10	30568	30577	0 %	60 %	20 %	20 %	383313227
12	NC_017031	TGAGG	2	10	37401	37410	20 %	20 %	60 %	0 %	383313231
13	NC_017031	TGCGG	2	10	40517	40526	0 %	20 %	60 %	20 %	383313235
14	NC_017031	GCCTC	2	10	47294	47303	0 %	20 %	20 %	60 %	383313241
15	NC_017031	GAAGG	2	10	47308	47317	40 %	0 %	60 %	0 %	383313241
16	NC_017031	CAGTG	2	10	49239	49248	20 %	20 %	40 %	20 %	383313243
17	NC_017031	TGAGA	2	10	49581	49590	40 %	20 %	40 %	0 %	383313243
18	NC_017031	AGTGA	2	10	49631	49640	40 %	20 %	40 %	0 %	383313243
19	NC_017031	GCGGT	2	10	51780	51789	0 %	20 %	60 %	20 %	383313246
20	NC_017031	CTGGC	2	10	53054	53063	0 %	20 %	40 %	40 %	383313248
21	NC_017031	GCAGC	2	10	53553	53562	20 %	0 %	40 %	40 %	383313248
22	NC_017031	GACTG	2	10	53569	53578	20 %	20 %	40 %	20 %	383313248
23	NC_017031	AAGGC	2	10	55809	55818	40 %	0 %	40 %	20 %	383313250
24	NC_017031	ATGGC	2	10	58668	58677	20 %	20 %	40 %	20 %	383313254
25	NC_017031	ATGTG	2	10	62837	62846	20 %	40 %	40 %	0 %	383313258
26	NC_017031	GCTGG	2	10	64998	65007	0 %	20 %	60 %	20 %	383313260
27	NC_017031	AGGGA	2	10	67606	67615	40 %	0 %	60 %	0 %	383313262
28	NC_017031	AAGAT	2	10	69413	69422	60 %	20 %	20 %	0 %	383313264
29	NC_017031	GGAGC	2	10	69520	69529	20 %	0 %	60 %	20 %	383313264
30	NC_017031	GGTCT	2	10	71234	71243	0 %	40 %	40 %	20 %	383313266
31	NC_017031	CATGT	2	10	71810	71819	20 %	40 %	20 %	20 %	383313267
32	NC_017031	CAGCG	2	10	72687	72696	20 %	0 %	40 %	40 %	383313268
33	NC_017031	CAGGC	2	10	73093	73102	20 %	0 %	40 %	40 %	383313268
34	NC_017031	ATGGC	2	10	73938	73947	20 %	20 %	40 %	20 %	383313269
35	NC_017031	AGGCA	2	10	75258	75267	40 %	0 %	40 %	20 %	383313270
36	NC_017031	GCTTT	2	10	81099	81108	0 %	60 %	20 %	20 %	383313277
37	NC_017031	TGACC	2	10	81355	81364	20 %	20 %	20 %	40 %	383313277
38	NC_017031	CGTTA	2	10	82097	82106	20 %	40 %	20 %	20 %	383313278
39	NC_017031	TGCTG	2	10	82731	82740	0 %	40 %	40 %	20 %	383313278
40	NC_017031	TGGCC	2	10	84722	84731	0 %	20 %	40 %	40 %	383313279
41	NC_017031	GCGAC	2	10	85526	85535	20 %	0 %	40 %	40 %	383313279
42	NC_017031	TGGGA	2	10	88941	88950	20 %	20 %	60 %	0 %	383313285
43	NC_017031	GATCG	2	10	90040	90049	20 %	20 %	40 %	20 %	383313287
44	NC_017031	CAAAA	2	10	90772	90781	80 %	0 %	0 %	20 %	383313288
45	NC_017031	TGCAA	2	10	96620	96629	40 %	20 %	20 %	20 %	383313293
46	NC_017031	TGCAG	2	10	96840	96849	20 %	20 %	40 %	20 %	383313293
47	NC_017031	AGGTC	2	10	99276	99285	20 %	20 %	40 %	20 %	383313296
48	NC_017031	ACCAA	2	10	101135	101144	60 %	0 %	0 %	40 %	383313296
49	NC_017031	TCATC	2	10	102398	102407	20 %	40 %	0 %	40 %	383313297
50	NC_017031	ACCTG	2	10	104428	104437	20 %	20 %	20 %	40 %	383313298
51	NC_017031	CGGTG	2	10	104637	104646	0 %	20 %	60 %	20 %	383313298
52	NC_017031	CGGCG	2	10	107256	107265	0 %	0 %	60 %	40 %	383313301
53	NC_017031	CGCGG	2	10	107316	107325	0 %	0 %	60 %	40 %	383313302
54	NC_017031	CAGCG	2	10	107852	107861	20 %	0 %	40 %	40 %	383313303
55	NC_017031	GGATC	2	10	118415	118424	20 %	20 %	40 %	20 %	383313313
56	NC_017031	GACTG	2	10	127792	127801	20 %	20 %	40 %	20 %	383313319
57	NC_017031	TTGGT	2	10	129101	129110	0 %	60 %	40 %	0 %	383313319
58	NC_017031	GTGGC	2	10	133160	133169	0 %	20 %	60 %	20 %	383313321
59	NC_017031	CGCGT	2	10	133477	133486	0 %	20 %	40 %	40 %	383313322
60	NC_017031	GGGGC	2	10	133605	133614	0 %	0 %	80 %	20 %	383313322
61	NC_017031	AGACG	2	10	135410	135419	40 %	0 %	40 %	20 %	383313324
62	NC_017031	GGGGC	2	10	135628	135637	0 %	0 %	80 %	20 %	383313325
63	NC_017031	ACGGT	2	10	136782	136791	20 %	20 %	40 %	20 %	383313326
64	NC_017031	CGATC	2	10	137055	137064	20 %	20 %	20 %	40 %	383313326
65	NC_017031	TGGCC	2	10	137262	137271	0 %	20 %	40 %	40 %	383313326
66	NC_017031	TGGTG	2	10	137640	137649	0 %	40 %	60 %	0 %	383313326
67	NC_017031	GGAGT	2	10	138112	138121	20 %	20 %	60 %	0 %	383313326
68	NC_017031	ATTGC	2	10	142046	142055	20 %	40 %	20 %	20 %	383313329
69	NC_017031	TCACT	2	10	145917	145926	20 %	40 %	0 %	40 %	383313334
70	NC_017031	ATTTC	2	10	146534	146543	20 %	60 %	0 %	20 %	383313334
71	NC_017031	AATGG	2	10	150234	150243	40 %	20 %	40 %	0 %	383313337
72	NC_017031	GTGAG	2	10	151217	151226	20 %	20 %	60 %	0 %	383313339
73	NC_017031	CTGAA	2	10	152015	152024	40 %	20 %	20 %	20 %	383313339
74	NC_017031	CCAGC	2	10	153307	153316	20 %	0 %	20 %	60 %	383313340
75	NC_017031	TACGC	2	10	156333	156342	20 %	20 %	20 %	40 %	383313342
76	NC_017031	GCGAC	2	10	159827	159836	20 %	0 %	40 %	40 %	383313347
77	NC_017031	CCTTG	2	10	161479	161488	0 %	40 %	20 %	40 %	383313348
78	NC_017031	CGGTG	2	10	165448	165457	0 %	20 %	60 %	20 %	383313351
79	NC_017031	CATGG	2	10	167580	167589	20 %	20 %	40 %	20 %	383313353
80	NC_017031	CAGAT	2	10	167936	167945	40 %	20 %	20 %	20 %	383313353
81	NC_017031	GGATG	2	10	168834	168843	20 %	20 %	60 %	0 %	383313353
82	NC_017031	AAACT	2	10	172518	172527	60 %	20 %	0 %	20 %	383313355
83	NC_017031	ACCGG	2	10	172913	172922	20 %	0 %	40 %	40 %	383313355
84	NC_017031	ATTGA	2	10	178722	178731	40 %	40 %	20 %	0 %	383313359
85	NC_017031	GTGGA	2	10	181131	181140	20 %	20 %	60 %	0 %	383313360
86	NC_017031	TGACC	2	10	185381	185390	20 %	20 %	20 %	40 %	383313363
87	NC_017031	GTTTG	2	10	188606	188615	0 %	60 %	40 %	0 %	383313368
88	NC_017031	CGGAT	2	10	189546	189555	20 %	20 %	40 %	20 %	383313369
89	NC_017031	AGCGC	2	10	190704	190713	20 %	0 %	40 %	40 %	383313370
90	NC_017031	GCAGT	2	10	192191	192200	20 %	20 %	40 %	20 %	383313371
91	NC_017031	TAACG	2	10	193438	193447	40 %	20 %	20 %	20 %	383313372
92	NC_017031	AAGCC	2	10	194765	194774	40 %	0 %	20 %	40 %	383313373
93	NC_017031	GGCCC	2	10	196837	196846	0 %	0 %	40 %	60 %	383313376
94	NC_017031	GAATT	2	10	200402	200411	40 %	40 %	20 %	0 %	383313381
95	NC_017031	CAAGG	2	10	201291	201300	40 %	0 %	40 %	20 %	383313381
96	NC_017031	GATGG	2	10	203740	203749	20 %	20 %	60 %	0 %	383313382
97	NC_017031	TGGCG	2	10	204474	204483	0 %	20 %	60 %	20 %	383313383
98	NC_017031	TGCCA	2	10	206497	206506	20 %	20 %	20 %	40 %	383313384
99	NC_017031	AAATA	2	10	206599	206608	80 %	20 %	0 %	0 %	383313384
100	NC_017031	CAGGC	2	10	212012	212021	20 %	0 %	40 %	40 %	383313387
101	NC_017031	TTGTA	2	10	212421	212430	20 %	60 %	20 %	0 %	383313388
102	NC_017031	GCGAC	2	10	216937	216946	20 %	0 %	40 %	40 %	383313393
103	NC_017031	AGATC	2	10	216962	216971	40 %	20 %	20 %	20 %	383313393
104	NC_017031	CAAGG	2	10	217876	217885	40 %	0 %	40 %	20 %	383313394
105	NC_017031	AGAAA	2	10	218605	218614	80 %	0 %	20 %	0 %	383313395
106	NC_017031	CGGGG	2	10	224639	224648	0 %	0 %	80 %	20 %	383313402
107	NC_017031	TGCGC	2	10	227077	227086	0 %	20 %	40 %	40 %	383313405
108	NC_017031	CACTG	2	10	228237	228246	20 %	20 %	20 %	40 %	383313406
109	NC_017031	CATTG	2	10	228926	228935	20 %	40 %	20 %	20 %	383313407
110	NC_017031	CGCAA	2	10	229740	229749	40 %	0 %	20 %	40 %	383313410
111	NC_017031	GATCG	2	10	230058	230067	20 %	20 %	40 %	20 %	383313411
112	NC_017031	CAAGA	2	10	231970	231979	60 %	0 %	20 %	20 %	383313411
113	NC_017031	TGGCT	2	10	232166	232175	0 %	40 %	40 %	20 %	383313411
114	NC_017031	CTGTG	2	10	233485	233494	0 %	40 %	40 %	20 %	383313413
115	NC_017031	GCCGT	2	10	234886	234895	0 %	20 %	40 %	40 %	383313413
116	NC_017031	AGAAA	2	10	235792	235801	80 %	0 %	20 %	0 %	383313413
117	NC_017031	AGAGT	2	10	239219	239228	40 %	20 %	40 %	0 %	383313415
118	NC_017031	TTTTG	2	10	241518	241527	0 %	80 %	20 %	0 %	383313417
119	NC_017031	GCCAT	2	10	244875	244884	20 %	20 %	20 %	40 %	383313420
120	NC_017031	CGCAG	2	10	247931	247940	20 %	0 %	40 %	40 %	383313423
121	NC_017031	CATGC	2	10	249702	249711	20 %	20 %	20 %	40 %	383313424
122	NC_017031	CCATG	2	10	249933	249942	20 %	20 %	20 %	40 %	383313424
123	NC_017031	AATTG	2	10	250106	250115	40 %	40 %	20 %	0 %	383313424
124	NC_017031	CCCCG	2	10	254758	254767	0 %	0 %	20 %	80 %	383313428
125	NC_017031	GAAGT	2	10	255299	255308	40 %	20 %	40 %	0 %	383313428
126	NC_017031	CCGTG	2	10	255485	255494	0 %	20 %	40 %	40 %	383313428
127	NC_017031	TGCTC	2	10	260425	260434	0 %	40 %	20 %	40 %	383313432
128	NC_017031	TTGGA	2	10	262343	262352	20 %	40 %	40 %	0 %	383313434
129	NC_017031	GGCTC	2	10	262665	262674	0 %	20 %	40 %	40 %	383313435
130	NC_017031	TCCTT	2	10	263395	263404	0 %	60 %	0 %	40 %	383313436
131	NC_017031	GGAAG	2	10	264081	264090	40 %	0 %	60 %	0 %	383313437
132	NC_017031	CCATG	2	10	265468	265477	20 %	20 %	20 %	40 %	383313439
133	NC_017031	TTGCC	2	10	265555	265564	0 %	40 %	20 %	40 %	383313439
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