MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 chromosome

Total Repeats: 31693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017031	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313192
2	NC_017031	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313192
3	NC_017031	TTA	2	6	330	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313192
4	NC_017031	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313192
5	NC_017031	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313192
6	NC_017031	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313192
7	NC_017031	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313192
8	NC_017031	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313192
9	NC_017031	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313192
10	NC_017031	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313192
11	NC_017031	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313192
12	NC_017031	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313192
13	NC_017031	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313192
14	NC_017031	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313192
15	NC_017031	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313192
16	NC_017031	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313192
17	NC_017031	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313192
18	NC_017031	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313192
19	NC_017031	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313192
20	NC_017031	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313192
21	NC_017031	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313192
22	NC_017031	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313192
23	NC_017031	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313192
24	NC_017031	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017031	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313193
26	NC_017031	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017031	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017031	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017031	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313194
30	NC_017031	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313194
31	NC_017031	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313194
32	NC_017031	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313194
33	NC_017031	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313194
34	NC_017031	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313194
35	NC_017031	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313194
36	NC_017031	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313194
37	NC_017031	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313194
38	NC_017031	GAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017031	CTG	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017031	TTG	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313195
41	NC_017031	CTG	2	6	3867	3872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313195
42	NC_017031	GTG	2	6	4026	4031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313195
43	NC_017031	TTG	2	6	4065	4070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313195
44	NC_017031	GAT	2	6	4184	4189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313195
45	NC_017031	GAG	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313195
46	NC_017031	CGT	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313195
47	NC_017031	GAC	2	6	4508	4513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313195
48	NC_017031	CGA	2	6	4648	4653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313195
49	NC_017031	CTG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313196
50	NC_017031	AGA	2	6	4883	4888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313196
51	NC_017031	TGC	2	6	4907	4912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313196
52	NC_017031	GCG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313196
53	NC_017031	ACG	2	6	5074	5079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313196
54	NC_017031	CGG	2	6	5144	5149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313196
55	NC_017031	TGG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313196
56	NC_017031	AGC	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313196
57	NC_017031	ATG	2	6	5277	5282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313196
58	NC_017031	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017031	CGG	2	6	5769	5774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313197
60	NC_017031	TGG	2	6	5868	5873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313197
61	NC_017031	GGT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313197
62	NC_017031	ACC	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313197
63	NC_017031	ACC	3	9	6097	6105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313197
64	NC_017031	CAT	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313197
65	NC_017031	TCG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313197
66	NC_017031	GAA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
67	NC_017031	TGA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
68	NC_017031	CTG	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313197
69	NC_017031	GAA	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
70	NC_017031	GAA	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
71	NC_017031	TTA	2	6	6336	6341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313197
72	NC_017031	TGA	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
73	NC_017031	GAA	2	6	6532	6537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
74	NC_017031	TGA	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
75	NC_017031	TCT	2	6	6817	6822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313197
76	NC_017031	GGC	2	6	6837	6842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313197
77	NC_017031	TGG	2	6	6888	6893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313197
78	NC_017031	GGT	2	6	6973	6978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313197
79	NC_017031	ATT	2	6	7096	7101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313197
80	NC_017031	ATG	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
81	NC_017031	CAA	2	6	7140	7145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313197
82	NC_017031	GCT	3	9	7209	7217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313197
83	NC_017031	TTG	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313197
84	NC_017031	CCG	2	6	7279	7284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313197
85	NC_017031	GAA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313197
86	NC_017031	CAA	2	6	7386	7391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313197
87	NC_017031	GAT	2	6	7393	7398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
88	NC_017031	ATG	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
89	NC_017031	TGA	2	6	7515	7520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313197
90	NC_017031	TCG	2	6	7557	7562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313197
91	NC_017031	TAG	3	9	7672	7680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017031	TTC	2	6	7897	7902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313198
93	NC_017031	GAG	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313198
94	NC_017031	AGC	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313198
95	NC_017031	TGC	2	6	7993	7998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313198
96	NC_017031	GAG	2	6	8104	8109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313198
97	NC_017031	ATG	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017031	GTT	2	6	8207	8212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017031	CAA	2	6	8237	8242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017031	TTC	2	6	8264	8269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017031	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313199
102	NC_017031	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017031	CTG	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313200
104	NC_017031	GGA	2	6	8570	8575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313200
105	NC_017031	TGT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313200
106	NC_017031	CTG	2	6	8599	8604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313200
107	NC_017031	TGC	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313200
108	NC_017031	GTC	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313200
109	NC_017031	GCG	2	6	8722	8727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313201
110	NC_017031	TGA	2	6	8808	8813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313201
111	NC_017031	GCT	2	6	8825	8830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313201
112	NC_017031	CGA	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313202
113	NC_017031	GCG	2	6	9100	9105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313202
114	NC_017031	GAG	2	6	9141	9146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383313202
115	NC_017031	CCG	2	6	9233	9238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313202
116	NC_017031	ACG	2	6	9439	9444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313202
117	NC_017031	CGC	2	6	9449	9454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313202
118	NC_017031	TTC	2	6	9571	9576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313202
119	NC_017031	TGA	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313202
120	NC_017031	TCT	2	6	9679	9684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313202
121	NC_017031	GAA	2	6	9858	9863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
122	NC_017031	TGC	2	6	10156	10161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313202
123	NC_017031	TTA	2	6	10163	10168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313202
124	NC_017031	TCG	2	6	10196	10201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313202
125	NC_017031	GAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
126	NC_017031	CGA	2	6	10277	10282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313202
127	NC_017031	AGA	2	6	10420	10425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
128	NC_017031	CGT	2	6	10554	10559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313202
129	NC_017031	ATT	2	6	10566	10571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313202
130	NC_017031	GAA	2	6	10593	10598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313202
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256	NC_017031	CGC	2	6	18257	18262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313210
257	NC_017031	TGC	2	6	18269	18274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313210
258	NC_017031	ATG	2	6	18359	18364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313211
259	NC_017031	ACT	2	6	18521	18526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313211
260	NC_017031	CAT	2	6	18562	18567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313211
261	NC_017031	GGT	2	6	18587	18592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313211
262	NC_017031	GGC	2	6	18614	18619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313211
263	NC_017031	TCC	2	6	18675	18680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313211
264	NC_017031	GTG	2	6	18734	18739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313211
265	NC_017031	CAA	2	6	18754	18759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313211
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269	NC_017031	TCC	2	6	18994	18999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313212
270	NC_017031	TCA	2	6	19051	19056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313212
271	NC_017031	TTA	2	6	19063	19068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313212
272	NC_017031	TTA	2	6	19300	19305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383313212
273	NC_017031	CTG	2	6	19357	19362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313212
274	NC_017031	TTG	2	6	19519	19524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313212
275	NC_017031	TGG	2	6	19589	19594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313212
276	NC_017031	ATC	2	6	19621	19626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313212
277	NC_017031	GTA	2	6	19662	19667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313212
278	NC_017031	TTG	2	6	19675	19680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313212
279	NC_017031	GTT	2	6	19718	19723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313212
280	NC_017031	GCA	2	6	19773	19778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313213
281	NC_017031	AAT	2	6	19938	19943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383313214
282	NC_017031	GTT	2	6	20010	20015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313214
283	NC_017031	GAA	2	6	20100	20105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017031	TGG	2	6	20281	20286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017031	GCT	2	6	20367	20372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_017031	CGA	2	6	20406	20411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_017031	CAG	2	6	20559	20564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017031	GAA	2	6	20828	20833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313215
289	NC_017031	CAT	2	6	20865	20870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313215
290	NC_017031	GAA	2	6	20936	20941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313215
291	NC_017031	GAA	2	6	21016	21021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313215
292	NC_017031	AGT	2	6	21033	21038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017031	CCT	2	6	21094	21099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383313216
294	NC_017031	GCC	2	6	21120	21125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383313216
295	NC_017031	GTC	2	6	21126	21131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313216
296	NC_017031	GAG	2	6	21203	21208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
297	NC_017031	GAT	2	6	21319	21324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_017031	GCA	2	6	21365	21370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_017031	CGA	2	6	21591	21596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313217
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301	NC_017031	GCT	2	6	21859	21864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_017031	ATG	2	6	21891	21896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017031	AGT	2	6	21961	21966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017031	AGT	2	6	21970	21975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NC_017031	AGC	3	9	21988	21996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_017031	GTT	2	6	22054	22059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_017031	CAA	2	6	22857	22862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383313220
314	NC_017031	AGA	2	6	22884	22889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313220
315	NC_017031	TTC	2	6	22891	22896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383313220
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322	NC_017031	AAT	2	6	23702	23707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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324	NC_017031	TTG	2	6	24076	24081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_017031	CTA	2	6	24355	24360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313221
331	NC_017031	ACT	2	6	24460	24465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313221
332	NC_017031	CGG	2	6	24572	24577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313221
333	NC_017031	TAC	2	6	24717	24722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313221
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335	NC_017031	CAT	2	6	25096	25101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313222
336	NC_017031	GTC	2	6	25147	25152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313222
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339	NC_017031	TGT	2	6	25286	25291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383313222
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341	NC_017031	TGG	2	6	25367	25372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313222
342	NC_017031	GGT	2	6	25387	25392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313222
343	NC_017031	GGC	2	6	25510	25515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313222
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359	NC_017031	AGC	2	6	26421	26426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313223
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361	NC_017031	GAT	2	6	26511	26516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313223
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363	NC_017031	GAA	2	6	26639	26644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313223
364	NC_017031	ATC	2	6	26814	26819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313223
365	NC_017031	GTG	2	6	26847	26852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
366	NC_017031	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
367	NC_017031	CAG	3	9	26897	26905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
368	NC_017031	TCA	2	6	26944	26949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313224
369	NC_017031	CGG	2	6	27018	27023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383313224
370	NC_017031	AAG	2	6	27085	27090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313224
371	NC_017031	TGA	2	6	27099	27104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383313224
372	NC_017031	TAC	2	6	27211	27216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383313224
373	NC_017031	CTG	2	6	27510	27515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313224
374	NC_017031	ACC	2	6	27545	27550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313224
375	NC_017031	GCT	2	6	27551	27556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383313224
376	NC_017031	CAC	2	6	27558	27563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383313224
377	NC_017031	GAA	2	6	27602	27607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383313224
378	NC_017031	AGC	2	6	27643	27648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383313224
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380	NC_017031	TGG	2	6	27786	27791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383313224
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