MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corallococcus coralloides DSM 2259 chromosome

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017030	CCCATG	2	12	2897	2908	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017030	GGGTGC	2	12	21500	21511	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017030	CGGACG	2	12	23976	23987	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017030	TTGGGA	2	12	34014	34025	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017030	ACGCAA	2	12	39644	39655	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017030	TCGTAT	2	12	47783	47794	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017030	CGGCCC	2	12	59756	59767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017030	CACGGT	2	12	61042	61053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017030	GGCGGT	2	12	102585	102596	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017030	AGCCGA	2	12	132471	132482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017030	TGCGAA	2	12	165096	165107	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017030	TGCTGG	2	12	165114	165125	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017030	TCATCG	2	12	175132	175143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017030	CCAGGC	2	12	228413	228424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017030	AGCGGA	2	12	292117	292128	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017030	CCGGGC	2	12	402188	402199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017030	GGCATG	2	12	451705	451716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017030	GTTTCA	2	12	460255	460266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017030	GAAGGC	2	12	469923	469934	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017030	TGGACG	2	12	484041	484052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017030	ACGGGC	2	12	495919	495930	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017030	GGGTCG	2	12	539172	539183	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017030	CTGGAG	2	12	600208	600219	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017030	AGGGGG	2	12	606303	606314	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017030	CGCGAG	2	12	647441	647452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017030	GGGGCC	2	12	694094	694105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017030	CTTTTG	2	12	793492	793503	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017030	CGCATC	2	12	810856	810867	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017030	GGTGAG	2	12	896551	896562	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017030	ACGGCC	2	12	941594	941605	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017030	CGGGCG	2	12	1097036	1097047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017030	CCGATC	2	12	1133888	1133899	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017030	GGGCGC	2	12	1173841	1173852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017030	GCAGGG	2	12	1188950	1188961	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017030	CGCGAG	2	12	1208975	1208986	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017030	CGCGTG	2	12	1268869	1268880	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017030	CGGCCG	2	12	1308619	1308630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017030	AGGGGG	2	12	1354064	1354075	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017030	CGGGGC	2	12	1390293	1390304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017030	GGAGCA	2	12	1392706	1392717	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017030	CCACCC	2	12	1408455	1408466	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
42	NC_017030	TCGGGG	2	12	1515979	1515990	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017030	TCCGAC	2	12	1556198	1556209	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017030	TCAACT	2	12	1566117	1566128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017030	TGCGCG	2	12	1587556	1587567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017030	TCCAGC	2	12	1618656	1618667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017030	AGGTAC	2	12	1656434	1656445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017030	CGGTGC	2	12	1668733	1668744	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017030	CGGTGC	2	12	1668844	1668855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017030	AGGGGC	2	12	1680562	1680573	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017030	CTCACC	2	12	1759632	1759643	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017030	GGGTTC	2	12	1783550	1783561	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017030	GCTTGG	2	12	1869245	1869256	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017030	GCTGGC	2	12	1903274	1903285	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017030	GGCCCA	2	12	1961864	1961875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017030	GCCCGG	2	12	1980940	1980951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017030	CGAGTC	2	12	2000861	2000872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017030	GGACCG	2	12	2081140	2081151	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017030	CAGGCC	2	12	2146998	2147009	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017030	TAATCC	2	12	2203691	2203702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017030	GTGAAG	2	12	2236768	2236779	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017030	GCGCCC	2	12	2253185	2253196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017030	TGGAGA	2	12	2293060	2293071	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017030	AAGGCG	2	12	2309607	2309618	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017030	CGGGCC	2	12	2319925	2319936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017030	GAGGGG	2	12	2327582	2327593	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017030	CCAACA	2	12	2359056	2359067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017030	CCGGGC	2	12	2389491	2389502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017030	CCGCGC	2	12	2397018	2397029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017030	GGGCTG	2	12	2401815	2401826	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017030	GGGCCG	2	12	2425976	2425987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017030	CGGGGG	2	12	2447392	2447403	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017030	CTGGGC	2	12	2473904	2473915	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017030	CCTGGG	2	12	2504434	2504445	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017030	GCCCGG	2	12	2548584	2548595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017030	CGTGCC	2	12	2568052	2568063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017030	CCAGAC	2	12	2599137	2599148	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017030	CGCCGT	2	12	2786217	2786228	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017030	GTCCTG	2	12	2786251	2786262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017030	CGCCGT	2	12	2786316	2786327	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017030	GCCTGC	2	12	2816646	2816657	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017030	TCGCCG	2	12	2921684	2921695	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017030	CCCCAC	2	12	2921701	2921712	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
84	NC_017030	AGCAGG	2	12	2958230	2958241	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017030	GCCGCT	2	12	2963541	2963552	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017030	CAGCAC	2	12	3027960	3027971	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017030	CTCAGG	2	12	3035527	3035538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017030	TGAAGA	2	12	3053384	3053395	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017030	GGCCGT	2	12	3089461	3089472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017030	GCAGGT	2	12	3151225	3151236	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017030	ACTTGG	2	12	3244929	3244940	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017030	GCTCCA	2	12	3255331	3255342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017030	GTGGGC	2	12	3258981	3258992	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017030	GGGGAG	2	12	3262129	3262140	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017030	GCGATC	2	12	3292404	3292415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017030	GCGGTG	2	12	3334692	3334703	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017030	GAAGCA	2	12	3334823	3334834	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017030	AGCCGA	2	12	3339529	3339540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017030	CGCCGG	2	12	3341340	3341351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017030	GTGGCC	2	12	3362728	3362739	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017030	TCGATG	2	12	3389701	3389712	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017030	CCCGGG	2	12	3439891	3439902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017030	CCGGGC	2	12	3439945	3439956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017030	CCATCC	2	12	3447858	3447869	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017030	GGGGAC	2	12	3553685	3553696	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017030	GACGCC	2	12	3556173	3556184	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017030	CTGAGC	2	12	3557392	3557403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017030	CCGGGG	2	12	3577132	3577143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017030	CTGCGC	2	12	3613362	3613373	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017030	GCAGGG	2	12	3616655	3616666	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017030	GGTTGG	2	12	3690259	3690270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017030	GGGCGA	2	12	3710043	3710054	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017030	CTGGAC	2	12	3754701	3754712	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017030	GCGGCA	2	12	3808500	3808511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017030	ACCCCA	2	12	3863273	3863284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017030	CGTCCG	2	12	3872553	3872564	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017030	GGCCAT	2	12	3883884	3883895	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017030	CAGTCG	2	12	3893568	3893579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017030	CCCGCG	2	12	3906145	3906156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017030	CCCTCA	2	12	3908252	3908263	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017030	TCCGAG	2	12	4071656	4071667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017030	GGGTGA	2	12	4074444	4074455	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017030	CCGGGC	2	12	4076753	4076764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017030	GGAGCC	2	12	4136130	4136141	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017030	CGGGTC	2	12	4138845	4138856	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017030	GGCTCC	2	12	4152364	4152375	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017030	GTGCGA	2	12	4164838	4164849	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017030	TGGGGA	2	12	4204653	4204664	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017030	GCGCTT	2	12	4256340	4256351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017030	GGACGT	2	12	4304626	4304637	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017030	GATCTT	2	12	4311481	4311492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017030	AAGGGA	2	12	4331273	4331284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017030	TGGCGG	2	12	4355222	4355233	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017030	AGGGGG	2	12	4373351	4373362	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017030	TTGCTG	2	12	4374967	4374978	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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137	NC_017030	GGGGGA	2	12	4401956	4401967	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_017030	TGAACC	2	12	4601899	4601910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017030	AGCGTT	2	12	4615680	4615691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017030	AGGTGT	2	12	4670681	4670692	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017030	GGGGGA	2	12	4679871	4679882	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017030	TGGTTG	2	12	4934654	4934665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017030	CCTCCC	2	12	4945471	4945482	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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154	NC_017030	GCCCCC	2	12	5265746	5265757	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
155	NC_017030	TCACCG	2	12	5305346	5305357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
156	NC_017030	AGCCCC	2	12	5339820	5339831	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_017030	CGTGCC	2	12	5399830	5399841	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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243	NC_017030	CCAGCT	2	12	8673796	8673807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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249	NC_017030	CCGTTC	2	12	8840802	8840813	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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251	NC_017030	GGGGGA	2	12	8854078	8854089	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017030	TTCCGC	2	12	8889988	8889999	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.