MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corallococcus coralloides DSM 2259 chromosome

Total Repeats: 8151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017030	CGTTG	2	10	1882	1891	0 %	40 %	40 %	20 %	383452026
2	NC_017030	TGGAT	2	10	2459	2468	20 %	40 %	40 %	0 %	383452027
3	NC_017030	AACCG	2	10	3877	3886	40 %	0 %	20 %	40 %	383452029
4	NC_017030	GGCCC	2	10	5665	5674	0 %	0 %	40 %	60 %	383452030
5	NC_017030	GCCTC	2	10	6974	6983	0 %	20 %	20 %	60 %	383452031
6	NC_017030	GCGGA	2	10	8395	8404	20 %	0 %	60 %	20 %	383452033
7	NC_017030	AGGCG	2	10	9980	9989	20 %	0 %	60 %	20 %	383452033
8	NC_017030	GGGGC	2	10	10183	10192	0 %	0 %	80 %	20 %	383452033
9	NC_017030	CGAGC	2	10	12280	12289	20 %	0 %	40 %	40 %	383452035
10	NC_017030	GATTC	2	10	14171	14180	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017030	GCCCG	2	10	14384	14393	0 %	0 %	40 %	60 %	383452038
12	NC_017030	GATGC	2	10	18087	18096	20 %	20 %	40 %	20 %	383452041
13	NC_017030	CAGGC	2	10	18414	18423	20 %	0 %	40 %	40 %	383452042
14	NC_017030	CGCCC	2	10	19205	19214	0 %	0 %	20 %	80 %	383452043
15	NC_017030	CGCGT	2	10	20710	20719	0 %	20 %	40 %	40 %	383452045
16	NC_017030	GGGCG	2	10	22547	22556	0 %	0 %	80 %	20 %	383452046
17	NC_017030	GCCGC	2	10	24312	24321	0 %	0 %	40 %	60 %	383452048
18	NC_017030	TCGCG	2	10	25442	25451	0 %	20 %	40 %	40 %	383452049
19	NC_017030	GCGTG	2	10	25511	25520	0 %	20 %	60 %	20 %	383452049
20	NC_017030	AGGCC	2	10	26391	26400	20 %	0 %	40 %	40 %	383452050
21	NC_017030	GCGCG	2	10	26694	26703	0 %	0 %	60 %	40 %	383452050
22	NC_017030	GCCGG	2	10	27641	27650	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017030	GCGCG	2	10	28067	28076	0 %	0 %	60 %	40 %	383452051
24	NC_017030	GTGGA	2	10	29035	29044	20 %	20 %	60 %	0 %	383452053
25	NC_017030	ACGGC	2	10	29306	29315	20 %	0 %	40 %	40 %	383452053
26	NC_017030	GGACG	2	10	29535	29544	20 %	0 %	60 %	20 %	383452053
27	NC_017030	GGACG	2	10	29589	29598	20 %	0 %	60 %	20 %	383452053
28	NC_017030	GGGAT	2	10	31677	31686	20 %	20 %	60 %	0 %	383452054
29	NC_017030	GCCGC	2	10	31720	31729	0 %	0 %	40 %	60 %	383452054
30	NC_017030	GCCCG	2	10	32588	32597	0 %	0 %	40 %	60 %	383452055
31	NC_017030	CGGGG	2	10	32663	32672	0 %	0 %	80 %	20 %	383452055
32	NC_017030	CGGGG	2	10	35352	35361	0 %	0 %	80 %	20 %	383452058
33	NC_017030	CGGAA	2	10	38292	38301	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017030	TGGGG	2	10	38441	38450	0 %	20 %	80 %	0 %	383452059
35	NC_017030	GTCAG	2	10	39669	39678	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017030	GTGTC	2	10	42338	42347	0 %	40 %	40 %	20 %	383452064
37	NC_017030	GAGGG	2	10	44466	44475	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017030	TGGCG	2	10	46860	46869	0 %	20 %	60 %	20 %	383452069
39	NC_017030	CCCGC	2	10	47215	47224	0 %	0 %	20 %	80 %	383452069
40	NC_017030	GGCCA	2	10	47374	47383	20 %	0 %	40 %	40 %	383452069
41	NC_017030	GTCAG	2	10	48213	48222	20 %	20 %	40 %	20 %	383452070
42	NC_017030	GGCTC	2	10	48546	48555	0 %	20 %	40 %	40 %	383452071
43	NC_017030	AGGGC	2	10	49952	49961	20 %	0 %	60 %	20 %	383452072
44	NC_017030	CGGCC	2	10	50471	50480	0 %	0 %	40 %	60 %	383452073
45	NC_017030	GAAGT	2	10	51266	51275	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017030	GCGCC	2	10	51601	51610	0 %	0 %	40 %	60 %	383452074
47	NC_017030	AGGGC	2	10	51787	51796	20 %	0 %	60 %	20 %	383452074
48	NC_017030	CGGCG	2	10	52168	52177	0 %	0 %	60 %	40 %	383452075
49	NC_017030	GGCGA	2	10	54868	54877	20 %	0 %	60 %	20 %	383452076
50	NC_017030	GCGCG	2	10	61438	61447	0 %	0 %	60 %	40 %	383452082
51	NC_017030	CGGCC	2	10	62329	62338	0 %	0 %	40 %	60 %	383452083
52	NC_017030	ACCGC	2	10	63076	63085	20 %	0 %	20 %	60 %	383452083
53	NC_017030	CGTCG	2	10	63734	63743	0 %	20 %	40 %	40 %	383452083
54	NC_017030	CAGGG	2	10	64266	64275	20 %	0 %	60 %	20 %	383452083
55	NC_017030	GGCCA	2	10	64425	64434	20 %	0 %	40 %	40 %	383452083
56	NC_017030	CCCGC	2	10	64661	64670	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
57	NC_017030	CGGGG	2	10	66980	66989	0 %	0 %	80 %	20 %	383452084
58	NC_017030	GGGCG	2	10	67755	67764	0 %	0 %	80 %	20 %	383452085
59	NC_017030	GCCGC	2	10	67909	67918	0 %	0 %	40 %	60 %	383452085
60	NC_017030	GGGGT	2	10	68559	68568	0 %	20 %	80 %	0 %	383452086
61	NC_017030	CCGGT	2	10	68688	68697	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017030	CGAAG	2	10	69418	69427	40 %	0 %	40 %	20 %	383452089
63	NC_017030	CGCAT	2	10	70036	70045	20 %	20 %	20 %	40 %	383452089
64	NC_017030	CGTTG	2	10	70169	70178	0 %	40 %	40 %	20 %	383452089
65	NC_017030	AGCGG	2	10	71449	71458	20 %	0 %	60 %	20 %	383452090
66	NC_017030	CGCGG	2	10	80723	80732	0 %	0 %	60 %	40 %	383452099
67	NC_017030	TCGCG	2	10	81060	81069	0 %	20 %	40 %	40 %	383452099
68	NC_017030	CAGGG	2	10	83031	83040	20 %	0 %	60 %	20 %	383452103
69	NC_017030	GCGCG	2	10	84814	84823	0 %	0 %	60 %	40 %	383452103
70	NC_017030	TCGCG	2	10	88421	88430	0 %	20 %	40 %	40 %	383452105
71	NC_017030	TGCGC	2	10	89183	89192	0 %	20 %	40 %	40 %	383452105
72	NC_017030	GCGTC	2	10	89585	89594	0 %	20 %	40 %	40 %	383452105
73	NC_017030	CCCCG	2	10	91240	91249	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
74	NC_017030	CCAGC	2	10	94017	94026	20 %	0 %	20 %	60 %	383452107
75	NC_017030	GCCGC	2	10	94222	94231	0 %	0 %	40 %	60 %	383452107
76	NC_017030	TGGTC	2	10	94424	94433	0 %	40 %	40 %	20 %	383452107
77	NC_017030	GTCCG	2	10	95945	95954	0 %	20 %	40 %	40 %	383452108
78	NC_017030	CGGAC	2	10	97361	97370	20 %	0 %	40 %	40 %	383452109
79	NC_017030	GCCGG	2	10	98213	98222	0 %	0 %	60 %	40 %	383452109
80	NC_017030	CCTGC	2	10	98741	98750	0 %	20 %	20 %	60 %	383452109
81	NC_017030	CGGTG	2	10	99011	99020	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017030	CCGCG	2	10	103281	103290	0 %	0 %	40 %	60 %	383452114
83	NC_017030	TTCGA	2	10	104418	104427	20 %	40 %	20 %	20 %	383452115
84	NC_017030	CGACG	2	10	105174	105183	20 %	0 %	40 %	40 %	383452115
85	NC_017030	GGACG	2	10	105816	105825	20 %	0 %	60 %	20 %	383452115
86	NC_017030	CCCGG	2	10	106471	106480	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_017030	ACGAA	2	10	108029	108038	60 %	0 %	20 %	20 %	383452117
88	NC_017030	GGCAG	2	10	110446	110455	20 %	0 %	60 %	20 %	383452119
89	NC_017030	TCGAT	2	10	110567	110576	20 %	40 %	20 %	20 %	383452119
90	NC_017030	GCGCC	2	10	110688	110697	0 %	0 %	40 %	60 %	383452119
91	NC_017030	CCCGG	2	10	111122	111131	0 %	0 %	40 %	60 %	383452119
92	NC_017030	TCCGC	2	10	111859	111868	0 %	20 %	20 %	60 %	383452120
93	NC_017030	GCCGT	2	10	112519	112528	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017030	GCGCG	2	10	113238	113247	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017030	CGCGG	2	10	115700	115709	0 %	0 %	60 %	40 %	383452123
96	NC_017030	GGGAC	2	10	116219	116228	20 %	0 %	60 %	20 %	383452123
97	NC_017030	GTGGC	2	10	116272	116281	0 %	20 %	60 %	20 %	383452124
98	NC_017030	GGGCA	2	10	117712	117721	20 %	0 %	60 %	20 %	383452125
99	NC_017030	GAAGC	2	10	117912	117921	40 %	0 %	40 %	20 %	383452125
100	NC_017030	GGACG	2	10	119937	119946	20 %	0 %	60 %	20 %	383452127
101	NC_017030	GACGT	2	10	119986	119995	20 %	20 %	40 %	20 %	383452127
102	NC_017030	GCAGG	2	10	123338	123347	20 %	0 %	60 %	20 %	383452130
103	NC_017030	GCCGG	2	10	124115	124124	0 %	0 %	60 %	40 %	383452130
104	NC_017030	GCGCC	2	10	125250	125259	0 %	0 %	40 %	60 %	383452131
105	NC_017030	TCACC	2	10	125277	125286	20 %	20 %	0 %	60 %	383452131
106	NC_017030	ACCGA	2	10	125765	125774	40 %	0 %	20 %	40 %	383452131
107	NC_017030	ACGCC	2	10	126141	126150	20 %	0 %	20 %	60 %	383452131
108	NC_017030	GAAAA	2	10	127901	127910	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017030	TCGTG	2	10	129509	129518	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017030	TCAGG	2	10	135131	135140	20 %	20 %	40 %	20 %	383452136
111	NC_017030	GACAC	2	10	138237	138246	40 %	0 %	20 %	40 %	383452140
112	NC_017030	CGTCG	2	10	138516	138525	0 %	20 %	40 %	40 %	383452141
113	NC_017030	GCGTC	2	10	141013	141022	0 %	20 %	40 %	40 %	383452142
114	NC_017030	GCTCC	2	10	141427	141436	0 %	20 %	20 %	60 %	383452143
115	NC_017030	TCGAG	2	10	142275	142284	20 %	20 %	40 %	20 %	383452144
116	NC_017030	TCACC	2	10	142666	142675	20 %	20 %	0 %	60 %	383452144
117	NC_017030	GCCGC	2	10	143550	143559	0 %	0 %	40 %	60 %	383452144
118	NC_017030	GCGCC	2	10	143585	143594	0 %	0 %	40 %	60 %	383452144
119	NC_017030	GCCGG	2	10	143720	143729	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017030	CTCGC	2	10	150443	150452	0 %	20 %	20 %	60 %	383452150
121	NC_017030	GTGGC	2	10	151976	151985	0 %	20 %	60 %	20 %	383452150
122	NC_017030	GCGAC	2	10	153394	153403	20 %	0 %	40 %	40 %	383452152
123	NC_017030	GGCGC	2	10	153626	153635	0 %	0 %	60 %	40 %	383452152
124	NC_017030	CGCGA	2	10	156499	156508	20 %	0 %	40 %	40 %	383452156
125	NC_017030	CGGGG	2	10	157564	157573	0 %	0 %	80 %	20 %	383452157
126	NC_017030	AGGGC	2	10	159042	159051	20 %	0 %	60 %	20 %	383452159
127	NC_017030	CTCGT	2	10	159966	159975	0 %	40 %	20 %	40 %	383452160
128	NC_017030	CGGCC	2	10	161287	161296	0 %	0 %	40 %	60 %	383452161
129	NC_017030	GAGGT	2	10	161689	161698	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017030	GGCCG	2	10	162403	162412	0 %	0 %	60 %	40 %	383452163
131	NC_017030	GGGCA	2	10	165204	165213	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017030	GGCAG	2	10	166136	166145	20 %	0 %	60 %	20 %	383452166
133	NC_017030	GCACG	2	10	167668	167677	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017030	ACCGC	2	10	168126	168135	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017030	GGACC	2	10	169148	169157	20 %	0 %	40 %	40 %	383452168
136	NC_017030	CCCGG	2	10	169951	169960	0 %	0 %	40 %	60 %	383452168
137	NC_017030	CCTTC	2	10	172978	172987	0 %	40 %	0 %	60 %	383452168
138	NC_017030	CGGAC	2	10	172999	173008	20 %	0 %	40 %	40 %	383452168
139	NC_017030	GCGCG	2	10	174323	174332	0 %	0 %	60 %	40 %	383452168
140	NC_017030	GGATT	2	10	174660	174669	20 %	40 %	40 %	0 %	383452168
141	NC_017030	GGACG	2	10	175701	175710	20 %	0 %	60 %	20 %	383452169
142	NC_017030	CCGCG	2	10	175868	175877	0 %	0 %	40 %	60 %	383452169
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152	NC_017030	GCGGA	2	10	192849	192858	20 %	0 %	60 %	20 %	383452182
153	NC_017030	GTTCT	2	10	194672	194681	0 %	60 %	20 %	20 %	383452182
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159	NC_017030	CCAAG	2	10	201261	201270	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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171	NC_017030	GTGGC	2	10	213856	213865	0 %	20 %	60 %	20 %	383452199
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187	NC_017030	TCGTC	2	10	239216	239225	0 %	40 %	20 %	40 %	383452222
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214	NC_017030	GCGCC	2	10	275567	275576	0 %	0 %	40 %	60 %	383452257
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234	NC_017030	CCGGC	2	10	310109	310118	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
235	NC_017030	CCCGG	2	10	310169	310178	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
236	NC_017030	AGGTC	2	10	310570	310579	20 %	20 %	40 %	20 %	383452285
237	NC_017030	TGGGC	2	10	311158	311167	0 %	20 %	60 %	20 %	383452285
238	NC_017030	CCCAG	2	10	312899	312908	20 %	0 %	20 %	60 %	383452286
239	NC_017030	GGCCG	2	10	314518	314527	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
240	NC_017030	GGAGT	2	10	316353	316362	20 %	20 %	60 %	0 %	383452288
241	NC_017030	ATCGA	2	10	316456	316465	40 %	20 %	20 %	20 %	383452289
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247	NC_017030	GCACG	2	10	321056	321065	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
248	NC_017030	CTGGG	2	10	321304	321313	0 %	20 %	60 %	20 %	383452294
249	NC_017030	GACGT	2	10	324703	324712	20 %	20 %	40 %	20 %	383452295
250	NC_017030	TGCGC	2	10	325078	325087	0 %	20 %	40 %	40 %	383452296
251	NC_017030	AGCGG	2	10	325153	325162	20 %	0 %	60 %	20 %	383452296
252	NC_017030	ATCGC	2	10	325251	325260	20 %	20 %	20 %	40 %	383452296
253	NC_017030	CGGAC	2	10	326820	326829	20 %	0 %	40 %	40 %	383452297
254	NC_017030	GGCGT	2	10	330615	330624	0 %	20 %	60 %	20 %	383452300
255	NC_017030	AAAGG	2	10	332620	332629	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017030	CAGGA	2	10	338881	338890	40 %	0 %	40 %	20 %	383452310
257	NC_017030	ACCAC	2	10	344089	344098	40 %	0 %	0 %	60 %	383452313
258	NC_017030	GGGCT	2	10	345579	345588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
259	NC_017030	CGCGG	2	10	345781	345790	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
260	NC_017030	CCGCG	2	10	346099	346108	0 %	0 %	40 %	60 %	383452316
261	NC_017030	CTGGG	2	10	346756	346765	0 %	20 %	60 %	20 %	383452316
262	NC_017030	GGCCG	2	10	347208	347217	0 %	0 %	60 %	40 %	383452316
263	NC_017030	GGAGG	2	10	350197	350206	20 %	0 %	80 %	0 %	383452319
264	NC_017030	CGGCC	2	10	350543	350552	0 %	0 %	40 %	60 %	383452319
265	NC_017030	CCCGG	2	10	350907	350916	0 %	0 %	40 %	60 %	383452319
266	NC_017030	CGGGG	2	10	352607	352616	0 %	0 %	80 %	20 %	383452322
267	NC_017030	AGGCG	2	10	353610	353619	20 %	0 %	60 %	20 %	383452323
268	NC_017030	AGGTC	2	10	354998	355007	20 %	20 %	40 %	20 %	383452324
269	NC_017030	GCGGA	2	10	355534	355543	20 %	0 %	60 %	20 %	383452325
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391	NC_017030	GCTCC	2	10	520426	520435	0 %	20 %	20 %	60 %	383452460
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397	NC_017030	CGCTT	2	10	525556	525565	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
398	NC_017030	CCGCG	2	10	529684	529693	0 %	0 %	40 %	60 %	383452473
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