MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corallococcus coralloides DSM 2259 chromosome

Total Repeats: 7188

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017030	CGTTG	2	10	1882	1891	0 %	40 %	40 %	20 %	383452026
2	NC_017030	TGGAT	2	10	2459	2468	20 %	40 %	40 %	0 %	383452027
3	NC_017030	AACCG	2	10	3877	3886	40 %	0 %	20 %	40 %	383452029
4	NC_017030	GGCCC	2	10	5665	5674	0 %	0 %	40 %	60 %	383452030
5	NC_017030	GCCTC	2	10	6974	6983	0 %	20 %	20 %	60 %	383452031
6	NC_017030	GCGGA	2	10	8395	8404	20 %	0 %	60 %	20 %	383452033
7	NC_017030	AGGCG	2	10	9980	9989	20 %	0 %	60 %	20 %	383452033
8	NC_017030	GGGGC	2	10	10183	10192	0 %	0 %	80 %	20 %	383452033
9	NC_017030	CGAGC	2	10	12280	12289	20 %	0 %	40 %	40 %	383452035
10	NC_017030	GCCCG	2	10	14384	14393	0 %	0 %	40 %	60 %	383452038
11	NC_017030	GATGC	2	10	18087	18096	20 %	20 %	40 %	20 %	383452041
12	NC_017030	CAGGC	2	10	18414	18423	20 %	0 %	40 %	40 %	383452042
13	NC_017030	CGCCC	2	10	19205	19214	0 %	0 %	20 %	80 %	383452043
14	NC_017030	CGCGT	2	10	20710	20719	0 %	20 %	40 %	40 %	383452045
15	NC_017030	GGGCG	2	10	22547	22556	0 %	0 %	80 %	20 %	383452046
16	NC_017030	GCCGC	2	10	24312	24321	0 %	0 %	40 %	60 %	383452048
17	NC_017030	TCGCG	2	10	25442	25451	0 %	20 %	40 %	40 %	383452049
18	NC_017030	GCGTG	2	10	25511	25520	0 %	20 %	60 %	20 %	383452049
19	NC_017030	AGGCC	2	10	26391	26400	20 %	0 %	40 %	40 %	383452050
20	NC_017030	GCGCG	2	10	26694	26703	0 %	0 %	60 %	40 %	383452050
21	NC_017030	GCGCG	2	10	28067	28076	0 %	0 %	60 %	40 %	383452051
22	NC_017030	GTGGA	2	10	29035	29044	20 %	20 %	60 %	0 %	383452053
23	NC_017030	ACGGC	2	10	29306	29315	20 %	0 %	40 %	40 %	383452053
24	NC_017030	GGACG	2	10	29535	29544	20 %	0 %	60 %	20 %	383452053
25	NC_017030	GGACG	2	10	29589	29598	20 %	0 %	60 %	20 %	383452053
26	NC_017030	GGGAT	2	10	31677	31686	20 %	20 %	60 %	0 %	383452054
27	NC_017030	GCCGC	2	10	31720	31729	0 %	0 %	40 %	60 %	383452054
28	NC_017030	GCCCG	2	10	32588	32597	0 %	0 %	40 %	60 %	383452055
29	NC_017030	CGGGG	2	10	32663	32672	0 %	0 %	80 %	20 %	383452055
30	NC_017030	CGGGG	2	10	35352	35361	0 %	0 %	80 %	20 %	383452058
31	NC_017030	TGGGG	2	10	38441	38450	0 %	20 %	80 %	0 %	383452059
32	NC_017030	GTGTC	2	10	42338	42347	0 %	40 %	40 %	20 %	383452064
33	NC_017030	TGGCG	2	10	46860	46869	0 %	20 %	60 %	20 %	383452069
34	NC_017030	CCCGC	2	10	47215	47224	0 %	0 %	20 %	80 %	383452069
35	NC_017030	GGCCA	2	10	47374	47383	20 %	0 %	40 %	40 %	383452069
36	NC_017030	GTCAG	2	10	48213	48222	20 %	20 %	40 %	20 %	383452070
37	NC_017030	GGCTC	2	10	48546	48555	0 %	20 %	40 %	40 %	383452071
38	NC_017030	AGGGC	2	10	49952	49961	20 %	0 %	60 %	20 %	383452072
39	NC_017030	CGGCC	2	10	50471	50480	0 %	0 %	40 %	60 %	383452073
40	NC_017030	GCGCC	2	10	51601	51610	0 %	0 %	40 %	60 %	383452074
41	NC_017030	AGGGC	2	10	51787	51796	20 %	0 %	60 %	20 %	383452074
42	NC_017030	CGGCG	2	10	52168	52177	0 %	0 %	60 %	40 %	383452075
43	NC_017030	GGCGA	2	10	54868	54877	20 %	0 %	60 %	20 %	383452076
44	NC_017030	GCGCG	2	10	61438	61447	0 %	0 %	60 %	40 %	383452082
45	NC_017030	CGGCC	2	10	62329	62338	0 %	0 %	40 %	60 %	383452083
46	NC_017030	ACCGC	2	10	63076	63085	20 %	0 %	20 %	60 %	383452083
47	NC_017030	CGTCG	2	10	63734	63743	0 %	20 %	40 %	40 %	383452083
48	NC_017030	CAGGG	2	10	64266	64275	20 %	0 %	60 %	20 %	383452083
49	NC_017030	GGCCA	2	10	64425	64434	20 %	0 %	40 %	40 %	383452083
50	NC_017030	CGGGG	2	10	66980	66989	0 %	0 %	80 %	20 %	383452084
51	NC_017030	GGGCG	2	10	67755	67764	0 %	0 %	80 %	20 %	383452085
52	NC_017030	GCCGC	2	10	67909	67918	0 %	0 %	40 %	60 %	383452085
53	NC_017030	GGGGT	2	10	68559	68568	0 %	20 %	80 %	0 %	383452086
54	NC_017030	CGAAG	2	10	69418	69427	40 %	0 %	40 %	20 %	383452089
55	NC_017030	CGCAT	2	10	70036	70045	20 %	20 %	20 %	40 %	383452089
56	NC_017030	CGTTG	2	10	70169	70178	0 %	40 %	40 %	20 %	383452089
57	NC_017030	AGCGG	2	10	71449	71458	20 %	0 %	60 %	20 %	383452090
58	NC_017030	CGCGG	2	10	80723	80732	0 %	0 %	60 %	40 %	383452099
59	NC_017030	TCGCG	2	10	81060	81069	0 %	20 %	40 %	40 %	383452099
60	NC_017030	CAGGG	2	10	83031	83040	20 %	0 %	60 %	20 %	383452103
61	NC_017030	GCGCG	2	10	84814	84823	0 %	0 %	60 %	40 %	383452103
62	NC_017030	TCGCG	2	10	88421	88430	0 %	20 %	40 %	40 %	383452105
63	NC_017030	TGCGC	2	10	89183	89192	0 %	20 %	40 %	40 %	383452105
64	NC_017030	GCGTC	2	10	89585	89594	0 %	20 %	40 %	40 %	383452105
65	NC_017030	CCAGC	2	10	94017	94026	20 %	0 %	20 %	60 %	383452107
66	NC_017030	GCCGC	2	10	94222	94231	0 %	0 %	40 %	60 %	383452107
67	NC_017030	TGGTC	2	10	94424	94433	0 %	40 %	40 %	20 %	383452107
68	NC_017030	GTCCG	2	10	95945	95954	0 %	20 %	40 %	40 %	383452108
69	NC_017030	CGGAC	2	10	97361	97370	20 %	0 %	40 %	40 %	383452109
70	NC_017030	GCCGG	2	10	98213	98222	0 %	0 %	60 %	40 %	383452109
71	NC_017030	CCTGC	2	10	98741	98750	0 %	20 %	20 %	60 %	383452109
72	NC_017030	CCGCG	2	10	103281	103290	0 %	0 %	40 %	60 %	383452114
73	NC_017030	TTCGA	2	10	104418	104427	20 %	40 %	20 %	20 %	383452115
74	NC_017030	CGACG	2	10	105174	105183	20 %	0 %	40 %	40 %	383452115
75	NC_017030	GGACG	2	10	105816	105825	20 %	0 %	60 %	20 %	383452115
76	NC_017030	ACGAA	2	10	108029	108038	60 %	0 %	20 %	20 %	383452117
77	NC_017030	GGCAG	2	10	110446	110455	20 %	0 %	60 %	20 %	383452119
78	NC_017030	TCGAT	2	10	110567	110576	20 %	40 %	20 %	20 %	383452119
79	NC_017030	GCGCC	2	10	110688	110697	0 %	0 %	40 %	60 %	383452119
80	NC_017030	CCCGG	2	10	111122	111131	0 %	0 %	40 %	60 %	383452119
81	NC_017030	TCCGC	2	10	111859	111868	0 %	20 %	20 %	60 %	383452120
82	NC_017030	CGCGG	2	10	115700	115709	0 %	0 %	60 %	40 %	383452123
83	NC_017030	GGGAC	2	10	116219	116228	20 %	0 %	60 %	20 %	383452123
84	NC_017030	GTGGC	2	10	116272	116281	0 %	20 %	60 %	20 %	383452124
85	NC_017030	GGGCA	2	10	117712	117721	20 %	0 %	60 %	20 %	383452125
86	NC_017030	GAAGC	2	10	117912	117921	40 %	0 %	40 %	20 %	383452125
87	NC_017030	GGACG	2	10	119937	119946	20 %	0 %	60 %	20 %	383452127
88	NC_017030	GACGT	2	10	119986	119995	20 %	20 %	40 %	20 %	383452127
89	NC_017030	GCAGG	2	10	123338	123347	20 %	0 %	60 %	20 %	383452130
90	NC_017030	GCCGG	2	10	124115	124124	0 %	0 %	60 %	40 %	383452130
91	NC_017030	GCGCC	2	10	125250	125259	0 %	0 %	40 %	60 %	383452131
92	NC_017030	TCACC	2	10	125277	125286	20 %	20 %	0 %	60 %	383452131
93	NC_017030	ACCGA	2	10	125765	125774	40 %	0 %	20 %	40 %	383452131
94	NC_017030	ACGCC	2	10	126141	126150	20 %	0 %	20 %	60 %	383452131
95	NC_017030	TCAGG	2	10	135131	135140	20 %	20 %	40 %	20 %	383452136
96	NC_017030	GACAC	2	10	138237	138246	40 %	0 %	20 %	40 %	383452140
97	NC_017030	CGTCG	2	10	138516	138525	0 %	20 %	40 %	40 %	383452141
98	NC_017030	GCGTC	2	10	141013	141022	0 %	20 %	40 %	40 %	383452142
99	NC_017030	GCTCC	2	10	141427	141436	0 %	20 %	20 %	60 %	383452143
100	NC_017030	TCGAG	2	10	142275	142284	20 %	20 %	40 %	20 %	383452144
101	NC_017030	TCACC	2	10	142666	142675	20 %	20 %	0 %	60 %	383452144
102	NC_017030	GCCGC	2	10	143550	143559	0 %	0 %	40 %	60 %	383452144
103	NC_017030	GCGCC	2	10	143585	143594	0 %	0 %	40 %	60 %	383452144
104	NC_017030	CTCGC	2	10	150443	150452	0 %	20 %	20 %	60 %	383452150
105	NC_017030	GTGGC	2	10	151976	151985	0 %	20 %	60 %	20 %	383452150
106	NC_017030	GCGAC	2	10	153394	153403	20 %	0 %	40 %	40 %	383452152
107	NC_017030	GGCGC	2	10	153626	153635	0 %	0 %	60 %	40 %	383452152
108	NC_017030	CGCGA	2	10	156499	156508	20 %	0 %	40 %	40 %	383452156
109	NC_017030	CGGGG	2	10	157564	157573	0 %	0 %	80 %	20 %	383452157
110	NC_017030	AGGGC	2	10	159042	159051	20 %	0 %	60 %	20 %	383452159
111	NC_017030	CTCGT	2	10	159966	159975	0 %	40 %	20 %	40 %	383452160
112	NC_017030	CGGCC	2	10	161287	161296	0 %	0 %	40 %	60 %	383452161
113	NC_017030	GGCCG	2	10	162403	162412	0 %	0 %	60 %	40 %	383452163
114	NC_017030	GGCAG	2	10	166136	166145	20 %	0 %	60 %	20 %	383452166
115	NC_017030	GGACC	2	10	169148	169157	20 %	0 %	40 %	40 %	383452168
116	NC_017030	CCCGG	2	10	169951	169960	0 %	0 %	40 %	60 %	383452168
117	NC_017030	CCTTC	2	10	172978	172987	0 %	40 %	0 %	60 %	383452168
118	NC_017030	CGGAC	2	10	172999	173008	20 %	0 %	40 %	40 %	383452168
119	NC_017030	GCGCG	2	10	174323	174332	0 %	0 %	60 %	40 %	383452168
120	NC_017030	GGATT	2	10	174660	174669	20 %	40 %	40 %	0 %	383452168
121	NC_017030	GGACG	2	10	175701	175710	20 %	0 %	60 %	20 %	383452169
122	NC_017030	CCGCG	2	10	175868	175877	0 %	0 %	40 %	60 %	383452169
123	NC_017030	CGTGG	2	10	179204	179213	0 %	20 %	60 %	20 %	383452170
124	NC_017030	GGCCA	2	10	182499	182508	20 %	0 %	40 %	40 %	383452173
125	NC_017030	GCGAC	2	10	184033	184042	20 %	0 %	40 %	40 %	383452175
126	NC_017030	GCGTT	2	10	184236	184245	0 %	40 %	40 %	20 %	383452175
127	NC_017030	GCCGC	2	10	186667	186676	0 %	0 %	40 %	60 %	383452176
128	NC_017030	CGACG	2	10	188213	188222	20 %	0 %	40 %	40 %	383452178
129	NC_017030	AGCCC	2	10	188882	188891	20 %	0 %	20 %	60 %	383452179
130	NC_017030	CATCG	2	10	189791	189800	20 %	20 %	20 %	40 %	383452180
131	NC_017030	AGGGC	2	10	192625	192634	20 %	0 %	60 %	20 %	383452182
132	NC_017030	GCGGA	2	10	192849	192858	20 %	0 %	60 %	20 %	383452182
133	NC_017030	GTTCT	2	10	194672	194681	0 %	60 %	20 %	20 %	383452182
134	NC_017030	CTGCC	2	10	195588	195597	0 %	20 %	20 %	60 %	383452183
135	NC_017030	CCGGG	2	10	196345	196354	0 %	0 %	60 %	40 %	383452183
136	NC_017030	CGGCG	2	10	197935	197944	0 %	0 %	60 %	40 %	383452184
137	NC_017030	CACGC	2	10	199035	199044	20 %	0 %	20 %	60 %	383452185
138	NC_017030	CACGC	2	10	200390	200399	20 %	0 %	20 %	60 %	383452186
139	NC_017030	GCGAG	2	10	202291	202300	20 %	0 %	60 %	20 %	383452188
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142	NC_017030	CCGCG	2	10	204595	204604	0 %	0 %	40 %	60 %	383452190
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148	NC_017030	GTGGC	2	10	213856	213865	0 %	20 %	60 %	20 %	383452199
149	NC_017030	GCGCC	2	10	215603	215612	0 %	0 %	40 %	60 %	383452200
150	NC_017030	GCGGT	2	10	216310	216319	0 %	20 %	60 %	20 %	383452201
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176	NC_017030	GTCGA	2	10	261586	261595	20 %	20 %	40 %	20 %	383452242
177	NC_017030	CGCGC	2	10	261744	261753	0 %	0 %	40 %	60 %	383452242
178	NC_017030	CGCGT	2	10	262391	262400	0 %	20 %	40 %	40 %	383452243
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187	NC_017030	GCGCC	2	10	275567	275576	0 %	0 %	40 %	60 %	383452257
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192	NC_017030	CGTCC	2	10	283348	283357	0 %	20 %	20 %	60 %	383452263
193	NC_017030	GAGGC	2	10	289645	289654	20 %	0 %	60 %	20 %	383452267
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195	NC_017030	GGGTG	2	10	291080	291089	0 %	20 %	80 %	0 %	383452268
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199	NC_017030	GGCAC	2	10	299792	299801	20 %	0 %	40 %	40 %	383452278
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205	NC_017030	CCCAG	2	10	308556	308565	20 %	0 %	20 %	60 %	383452284
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231	NC_017030	CGGGG	2	10	352607	352616	0 %	0 %	80 %	20 %	383452322
232	NC_017030	AGGCG	2	10	353610	353619	20 %	0 %	60 %	20 %	383452323
233	NC_017030	AGGTC	2	10	354998	355007	20 %	20 %	40 %	20 %	383452324
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237	NC_017030	CAAGG	2	10	357851	357860	40 %	0 %	40 %	20 %	383452328
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243	NC_017030	GCCCG	2	10	362882	362891	0 %	0 %	40 %	60 %	383452332
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245	NC_017030	CGCGG	2	10	364111	364120	0 %	0 %	60 %	40 %	383452334
246	NC_017030	GCGCC	2	10	364308	364317	0 %	0 %	40 %	60 %	383452334
247	NC_017030	GCCGG	2	10	364683	364692	0 %	0 %	60 %	40 %	383452334
248	NC_017030	GTCCA	2	10	365727	365736	20 %	20 %	20 %	40 %	383452335
249	NC_017030	CGCGC	2	10	365893	365902	0 %	0 %	40 %	60 %	383452335
250	NC_017030	CGCGG	2	10	367862	367871	0 %	0 %	60 %	40 %	383452335
251	NC_017030	CCGTG	2	10	370377	370386	0 %	20 %	40 %	40 %	383452336
252	NC_017030	CCCGT	2	10	371769	371778	0 %	20 %	20 %	60 %	383452338
253	NC_017030	GGGGC	2	10	379564	379573	0 %	0 %	80 %	20 %	383452343
254	NC_017030	GGCGA	2	10	379610	379619	20 %	0 %	60 %	20 %	383452343
255	NC_017030	CGCGG	2	10	381331	381340	0 %	0 %	60 %	40 %	383452344
256	NC_017030	GATGC	2	10	384385	384394	20 %	20 %	40 %	20 %	383452346
257	NC_017030	GGGCA	2	10	385796	385805	20 %	0 %	60 %	20 %	383452347
258	NC_017030	ATCGC	2	10	389713	389722	20 %	20 %	20 %	40 %	383452350
259	NC_017030	CCGGC	2	10	392650	392659	0 %	0 %	40 %	60 %	383452352
260	NC_017030	TCCAG	2	10	395321	395330	20 %	20 %	20 %	40 %	383452355
261	NC_017030	CGCGC	2	10	400118	400127	0 %	0 %	40 %	60 %	383452360
262	NC_017030	GGGAC	2	10	400636	400645	20 %	0 %	60 %	20 %	383452360
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264	NC_017030	GCTTC	2	10	401931	401940	0 %	40 %	20 %	40 %	383452361
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