MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_2

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017029	CCAT	2	8	116	123	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017029	ATCT	2	8	297	304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017029	ATTA	2	8	539	546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017029	ATTT	2	8	930	937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017029	CTTT	2	8	949	956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017029	TAAA	2	8	1070	1077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017029	TTAT	2	8	2016	2023	25 %	75 %	0 %	0 %	381214375
8	NC_017029	TTTA	2	8	2106	2113	25 %	75 %	0 %	0 %	381214375
9	NC_017029	TGTT	2	8	2154	2161	0 %	75 %	25 %	0 %	381214375
10	NC_017029	AGTT	2	8	2234	2241	25 %	50 %	25 %	0 %	381214375
11	NC_017029	TAAT	2	8	2249	2256	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
12	NC_017029	AATG	2	8	2413	2420	50 %	25 %	25 %	0 %	381214375
13	NC_017029	TACA	2	8	2519	2526	50 %	25 %	0 %	25 %	381214375
14	NC_017029	TAAA	2	8	2675	2682	75 %	25 %	0 %	0 %	381214375
15	NC_017029	AATA	2	8	2745	2752	75 %	25 %	0 %	0 %	381214375
16	NC_017029	TATC	3	12	2822	2833	25 %	50 %	0 %	25 %	381214375
17	NC_017029	AGTT	2	8	3030	3037	25 %	50 %	25 %	0 %	381214375
18	NC_017029	ATTT	2	8	3522	3529	25 %	75 %	0 %	0 %	381214375
19	NC_017029	AATA	2	8	4656	4663	75 %	25 %	0 %	0 %	381214375
20	NC_017029	TCCA	2	8	4765	4772	25 %	25 %	0 %	50 %	381214376
21	NC_017029	ATCA	2	8	5402	5409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017029	ATGT	2	8	5478	5485	25 %	50 %	25 %	0 %	381214377
23	NC_017029	GGTA	2	8	5773	5780	25 %	25 %	50 %	0 %	381214377
24	NC_017029	TTAT	2	8	6096	6103	25 %	75 %	0 %	0 %	381214378
25	NC_017029	GTAG	2	8	6453	6460	25 %	25 %	50 %	0 %	381214378
26	NC_017029	ACAT	2	8	6588	6595	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017029	CCTC	2	8	6797	6804	0 %	25 %	0 %	75 %	381214379
28	NC_017029	ATTA	2	8	7205	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	381214380
29	NC_017029	AAGA	2	8	7617	7624	75 %	0 %	25 %	0 %	381214380
30	NC_017029	ACAT	2	8	7676	7683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017029	ACAT	2	8	7714	7721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017029	TTGA	2	8	8077	8084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017029	AATC	2	8	8271	8278	50 %	25 %	0 %	25 %	381214382
34	NC_017029	AGAA	2	8	9046	9053	75 %	0 %	25 %	0 %	381214382
35	NC_017029	AGTT	2	8	9127	9134	25 %	50 %	25 %	0 %	381214382
36	NC_017029	ATAA	2	8	9210	9217	75 %	25 %	0 %	0 %	381214382
37	NC_017029	GCGA	2	8	9846	9853	25 %	0 %	50 %	25 %	381214382
38	NC_017029	GAAA	2	8	10221	10228	75 %	0 %	25 %	0 %	381214382
39	NC_017029	AAGT	2	8	10592	10599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017029	AAAG	2	8	10884	10891	75 %	0 %	25 %	0 %	381214383
41	NC_017029	TTGG	2	8	11116	11123	0 %	50 %	50 %	0 %	381214384
42	NC_017029	CATG	2	8	11261	11268	25 %	25 %	25 %	25 %	381214384
43	NC_017029	TTTA	2	8	11297	11304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017029	TGAT	2	8	11308	11315	25 %	50 %	25 %	0 %	381214385
45	NC_017029	AGGG	2	8	11325	11332	25 %	0 %	75 %	0 %	381214385
46	NC_017029	TCAT	2	8	13144	13151	25 %	50 %	0 %	25 %	381214386
47	NC_017029	TTAT	2	8	13179	13186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017029	TTTG	2	8	13646	13653	0 %	75 %	25 %	0 %	381214387
49	NC_017029	TTTA	2	8	13890	13897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017029	AGAA	2	8	13919	13926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017029	AGTA	2	8	14661	14668	50 %	25 %	25 %	0 %	381214388
52	NC_017029	AAGA	2	8	15604	15611	75 %	0 %	25 %	0 %	381214390
53	NC_017029	AAGA	2	8	15807	15814	75 %	0 %	25 %	0 %	381214390
54	NC_017029	CTTG	2	8	15940	15947	0 %	50 %	25 %	25 %	381214390
55	NC_017029	AGCT	2	8	16173	16180	25 %	25 %	25 %	25 %	381214390
56	NC_017029	TAAA	2	8	16200	16207	75 %	25 %	0 %	0 %	381214390
57	NC_017029	TTTC	2	8	16468	16475	0 %	75 %	0 %	25 %	381214391
58	NC_017029	TATT	2	8	17796	17803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.