MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_2

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017029	TTAT	2	8	2016	2023	25 %	75 %	0 %	0 %	381214375
2	NC_017029	TTTA	2	8	2106	2113	25 %	75 %	0 %	0 %	381214375
3	NC_017029	TGTT	2	8	2154	2161	0 %	75 %	25 %	0 %	381214375
4	NC_017029	AGTT	2	8	2234	2241	25 %	50 %	25 %	0 %	381214375
5	NC_017029	TAAT	2	8	2249	2256	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
6	NC_017029	AATG	2	8	2413	2420	50 %	25 %	25 %	0 %	381214375
7	NC_017029	TACA	2	8	2519	2526	50 %	25 %	0 %	25 %	381214375
8	NC_017029	TAAA	2	8	2675	2682	75 %	25 %	0 %	0 %	381214375
9	NC_017029	AATA	2	8	2745	2752	75 %	25 %	0 %	0 %	381214375
10	NC_017029	TATC	3	12	2822	2833	25 %	50 %	0 %	25 %	381214375
11	NC_017029	AGTT	2	8	3030	3037	25 %	50 %	25 %	0 %	381214375
12	NC_017029	ATTT	2	8	3522	3529	25 %	75 %	0 %	0 %	381214375
13	NC_017029	AATA	2	8	4656	4663	75 %	25 %	0 %	0 %	381214375
14	NC_017029	TCCA	2	8	4765	4772	25 %	25 %	0 %	50 %	381214376
15	NC_017029	ATGT	2	8	5478	5485	25 %	50 %	25 %	0 %	381214377
16	NC_017029	GGTA	2	8	5773	5780	25 %	25 %	50 %	0 %	381214377
17	NC_017029	TTAT	2	8	6096	6103	25 %	75 %	0 %	0 %	381214378
18	NC_017029	GTAG	2	8	6453	6460	25 %	25 %	50 %	0 %	381214378
19	NC_017029	CCTC	2	8	6797	6804	0 %	25 %	0 %	75 %	381214379
20	NC_017029	ATTA	2	8	7205	7212	50 %	50 %	0 %	0 %	381214380
21	NC_017029	AAGA	2	8	7617	7624	75 %	0 %	25 %	0 %	381214380
22	NC_017029	AATC	2	8	8271	8278	50 %	25 %	0 %	25 %	381214382
23	NC_017029	AGAA	2	8	9046	9053	75 %	0 %	25 %	0 %	381214382
24	NC_017029	AGTT	2	8	9127	9134	25 %	50 %	25 %	0 %	381214382
25	NC_017029	ATAA	2	8	9210	9217	75 %	25 %	0 %	0 %	381214382
26	NC_017029	GCGA	2	8	9846	9853	25 %	0 %	50 %	25 %	381214382
27	NC_017029	GAAA	2	8	10221	10228	75 %	0 %	25 %	0 %	381214382
28	NC_017029	AAAG	2	8	10884	10891	75 %	0 %	25 %	0 %	381214383
29	NC_017029	TTGG	2	8	11116	11123	0 %	50 %	50 %	0 %	381214384
30	NC_017029	CATG	2	8	11261	11268	25 %	25 %	25 %	25 %	381214384
31	NC_017029	TGAT	2	8	11308	11315	25 %	50 %	25 %	0 %	381214385
32	NC_017029	AGGG	2	8	11325	11332	25 %	0 %	75 %	0 %	381214385
33	NC_017029	TCAT	2	8	13144	13151	25 %	50 %	0 %	25 %	381214386
34	NC_017029	TTTG	2	8	13646	13653	0 %	75 %	25 %	0 %	381214387
35	NC_017029	AGTA	2	8	14661	14668	50 %	25 %	25 %	0 %	381214388
36	NC_017029	AAGA	2	8	15604	15611	75 %	0 %	25 %	0 %	381214390
37	NC_017029	AAGA	2	8	15807	15814	75 %	0 %	25 %	0 %	381214390
38	NC_017029	CTTG	2	8	15940	15947	0 %	50 %	25 %	25 %	381214390
39	NC_017029	AGCT	2	8	16173	16180	25 %	25 %	25 %	25 %	381214390
40	NC_017029	TAAA	2	8	16200	16207	75 %	25 %	0 %	0 %	381214390
41	NC_017029	TTTC	2	8	16468	16475	0 %	75 %	0 %	25 %	381214391

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.