MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_2

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017029	CA	3	6	1850	1855	50 %	0 %	0 %	50 %	381214375
2	NC_017029	AT	3	6	2048	2053	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
3	NC_017029	AT	4	8	2093	2100	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
4	NC_017029	CA	3	6	2333	2338	50 %	0 %	0 %	50 %	381214375
5	NC_017029	AT	3	6	2772	2777	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
6	NC_017029	AT	3	6	2919	2924	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
7	NC_017029	CT	3	6	3112	3117	0 %	50 %	0 %	50 %	381214375
8	NC_017029	TA	3	6	3202	3207	50 %	50 %	0 %	0 %	381214375
9	NC_017029	AT	3	6	5137	5142	50 %	50 %	0 %	0 %	381214376
10	NC_017029	CT	3	6	5327	5332	0 %	50 %	0 %	50 %	381214376
11	NC_017029	TA	3	6	6429	6434	50 %	50 %	0 %	0 %	381214378
12	NC_017029	TA	3	6	6751	6756	50 %	50 %	0 %	0 %	381214379
13	NC_017029	CT	3	6	7111	7116	0 %	50 %	0 %	50 %	381214380
14	NC_017029	AT	3	6	7294	7299	50 %	50 %	0 %	0 %	381214380
15	NC_017029	AT	3	6	7367	7372	50 %	50 %	0 %	0 %	381214380
16	NC_017029	AT	3	6	8311	8316	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
17	NC_017029	AT	3	6	9199	9204	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
18	NC_017029	TA	3	6	9349	9354	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
19	NC_017029	TA	3	6	9399	9404	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
20	NC_017029	AT	3	6	9447	9452	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
21	NC_017029	AT	3	6	9652	9657	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
22	NC_017029	TA	3	6	9775	9780	50 %	50 %	0 %	0 %	381214382
23	NC_017029	GA	3	6	10232	10237	50 %	0 %	50 %	0 %	381214382
24	NC_017029	AG	3	6	10552	10557	50 %	0 %	50 %	0 %	381214382
25	NC_017029	AT	3	6	10855	10860	50 %	50 %	0 %	0 %	381214383
26	NC_017029	AT	3	6	11145	11150	50 %	50 %	0 %	0 %	381214384
27	NC_017029	GA	3	6	11275	11280	50 %	0 %	50 %	0 %	381214384
28	NC_017029	AT	3	6	11447	11452	50 %	50 %	0 %	0 %	381214385
29	NC_017029	AT	3	6	11534	11539	50 %	50 %	0 %	0 %	381214385
30	NC_017029	AT	3	6	12033	12038	50 %	50 %	0 %	0 %	381214386
31	NC_017029	AT	3	6	12276	12281	50 %	50 %	0 %	0 %	381214386
32	NC_017029	AT	3	6	12652	12657	50 %	50 %	0 %	0 %	381214386
33	NC_017029	TG	3	6	13110	13115	0 %	50 %	50 %	0 %	381214386
34	NC_017029	TC	3	6	13682	13687	0 %	50 %	0 %	50 %	381214387
35	NC_017029	TA	3	6	14530	14535	50 %	50 %	0 %	0 %	381214388
36	NC_017029	AT	3	6	15229	15234	50 %	50 %	0 %	0 %	381214389
37	NC_017029	AT	3	6	16246	16251	50 %	50 %	0 %	0 %	381214390
38	NC_017029	TA	3	6	17835	17840	50 %	50 %	0 %	0 %	381214394
39	NC_017029	TG	3	6	18051	18056	0 %	50 %	50 %	0 %	381214395

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.