MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	AAAGTA	2	12	790	801	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383311894
2	NC_017028	GTAGGT	2	12	3008	3019	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383311896
3	NC_017028	TCATTT	2	12	4771	4782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017028	GCCCCA	2	12	10828	10839	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383311904
5	NC_017028	TACAAT	2	12	11912	11923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383311905
6	NC_017028	CGGCAT	2	12	12600	12611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383311906
7	NC_017028	CCTAAT	2	12	17545	17556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017028	ATGTTA	2	12	18279	18290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383311910
9	NC_017028	AATGAA	2	12	18493	18504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383311910
10	NC_017028	TTAGCT	2	12	20631	20642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383311912
11	NC_017028	ATATTT	2	12	35909	35920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311930
12	NC_017028	TAATAT	2	12	36020	36031	50 %	50 %	0 %	0 %	383311930
13	NC_017028	GAAGTA	2	12	38832	38843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383311931
14	NC_017028	TATTGC	2	12	42855	42866	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383311934
15	NC_017028	ATTTAA	2	12	43290	43301	50 %	50 %	0 %	0 %	383311935
16	NC_017028	AGAACT	2	12	46061	46072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383311937
17	NC_017028	TATGAT	2	12	48094	48105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383311940
18	NC_017028	ATCTGC	2	12	58405	58416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383311955
19	NC_017028	CTACAT	2	12	59653	59664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311956
20	NC_017028	ATAAAA	2	12	62779	62790	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017028	TAAATA	2	12	64138	64149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311958
22	NC_017028	ATTTTT	2	12	66569	66580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383311962
23	NC_017028	TTTAAT	2	12	68053	68064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311963
24	NC_017028	ATACCG	2	12	68458	68469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383311963
25	NC_017028	TTTAGA	2	12	70469	70480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383311966
26	NC_017028	CAAAAT	2	12	70494	70505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383311966
27	NC_017028	ATATTA	2	12	70813	70824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017028	TCAATT	2	12	71657	71668	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017028	CGGTGG	2	12	73550	73561	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383311970
30	NC_017028	AATATC	2	12	76942	76953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383311975
31	NC_017028	TTTTCC	2	12	77942	77953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311976
32	NC_017028	AAAGTA	2	12	80132	80143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383311978
33	NC_017028	AGGATA	2	12	82536	82547	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383311981
34	NC_017028	CTAATA	2	12	83457	83468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383311981
35	NC_017028	CAAAAC	2	12	83974	83985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311981
36	NC_017028	CAAAAT	2	12	84827	84838	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383311981
37	NC_017028	ACCGTA	2	12	86377	86388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383311985
38	NC_017028	AAAGAC	2	12	90041	90052	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383311989
39	NC_017028	ATCTGA	2	12	93237	93248	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017028	TAAAAA	2	12	94881	94892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383311993
41	NC_017028	CTTTAA	2	12	95414	95425	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017028	TGAGCT	2	12	96696	96707	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017028	CCTTAA	2	12	97069	97080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311994
44	NC_017028	AGTATA	2	12	97290	97301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383311995
45	NC_017028	TATTAA	2	12	97380	97391	50 %	50 %	0 %	0 %	383311996
46	NC_017028	AGCTTT	2	12	97943	97954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383311996
47	NC_017028	ATTAAT	2	12	98108	98119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017028	AAAGAT	2	12	102084	102095	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383312003
49	NC_017028	AAATTA	2	12	104067	104078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017028	ATGAAG	2	12	104691	104702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017028	CAAAAA	2	12	104933	104944	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017028	TTGTAT	2	12	105511	105522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383312007
53	NC_017028	TATATG	2	12	109044	109055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383312012
54	NC_017028	TTAAAG	2	12	110474	110485	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017028	TAGAAT	2	12	113141	113152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312018
56	NC_017028	ACCTAA	2	12	114354	114365	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017028	ACTTTA	2	12	115775	115786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017028	ATAATT	2	12	118158	118169	50 %	50 %	0 %	0 %	383312023
59	NC_017028	TAATGC	2	12	118896	118907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312023
60	NC_017028	AGCTTC	2	12	120213	120224	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312023
61	NC_017028	CATCTG	2	12	120635	120646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312023
62	NC_017028	CTAAAT	2	12	121490	121501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312023
63	NC_017028	TCCGGT	2	12	123595	123606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312023
64	NC_017028	AAATTA	3	18	123854	123871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017028	GATATA	2	12	125830	125841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312026
66	NC_017028	AATTAG	2	12	126446	126457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312026
67	NC_017028	ATTTAA	2	12	126494	126505	50 %	50 %	0 %	0 %	383312026
68	NC_017028	TTTTCT	2	12	129164	129175	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017028	TTCTAA	2	12	134991	135002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017028	ATTGCT	2	12	140359	140370	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312038
71	NC_017028	ATTTAT	2	12	140940	140951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312039
72	NC_017028	ATAAGG	2	12	141139	141150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383312039
73	NC_017028	TAATAG	2	12	141911	141922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312040
74	NC_017028	ATCAGA	2	12	144985	144996	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312044
75	NC_017028	TTTTTG	2	12	147106	147117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383312046
76	NC_017028	AAAACA	2	12	148935	148946	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383312046
77	NC_017028	AATAAG	2	12	150416	150427	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017028	ATAAAA	2	12	152796	152807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017028	TAATAT	2	12	153648	153659	50 %	50 %	0 %	0 %	383312051
80	NC_017028	CAGCAA	2	12	154317	154328	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383312052
81	NC_017028	ATAGTG	2	12	154648	154659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312052
82	NC_017028	AAAAAG	2	12	155476	155487	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383312052
83	NC_017028	AATTTT	2	12	159481	159492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017028	ATCCTG	2	12	160826	160837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312057
85	NC_017028	AAAGCT	2	12	161245	161256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312057
86	NC_017028	GTAATA	2	12	161884	161895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312057
87	NC_017028	CTAAAA	2	12	162215	162226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383312058
88	NC_017028	AGTAAA	2	12	170636	170647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383312066
89	NC_017028	AAGGAC	2	12	172541	172552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383312069
90	NC_017028	CGTGAT	2	12	173498	173509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383312071
91	NC_017028	TTGATT	2	12	175994	176005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383312072
92	NC_017028	GAAGCA	2	12	177087	177098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383312073
93	NC_017028	TTTTAA	2	12	177360	177371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017028	TCTTTA	2	12	188353	188364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312078
95	NC_017028	ATCTTT	2	12	188577	188588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312078
96	NC_017028	ATTAGC	2	12	189396	189407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312078
97	NC_017028	TATTTT	2	12	191943	191954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383312080
98	NC_017028	ACTAAA	2	12	193585	193596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383312080
99	NC_017028	CTAAAG	2	12	194244	194255	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312080
100	NC_017028	TATCTT	2	12	194406	194417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312080
101	NC_017028	TAGCAA	2	12	194571	194582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312080
102	NC_017028	ACAAAG	2	12	196661	196672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383312081
103	NC_017028	AATTTT	2	12	204005	204016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312089
104	NC_017028	TATAGG	2	12	210219	210230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312097
105	NC_017028	CTTAAA	2	12	210492	210503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312098
106	NC_017028	AAAAAG	2	12	213061	213072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383312100
107	NC_017028	CCGCTA	2	12	213420	213431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383312100
108	NC_017028	ATTTTT	2	12	216436	216447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383312102
109	NC_017028	AGCGGT	2	12	228122	228133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383312110
110	NC_017028	TATAGG	2	12	229732	229743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312111
111	NC_017028	ATCCGT	2	12	233518	233529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312115
112	NC_017028	TAAAAA	2	12	234547	234558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383312117
113	NC_017028	ATTTAT	2	12	235231	235242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017028	TTTATC	2	12	238292	238303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312121
115	NC_017028	GATTTT	2	12	238586	238597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383312122
116	NC_017028	CTTTTG	2	12	241094	241105	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383312124
117	NC_017028	GTAAAA	2	12	242418	242429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383312125
118	NC_017028	CAATAT	2	12	245439	245450	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312130
119	NC_017028	ATTGAG	2	12	245790	245801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312131
120	NC_017028	CTTCAT	2	12	246016	246027	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383312131
121	NC_017028	TAGGAT	2	12	246079	246090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312131
122	NC_017028	TCAATT	2	12	247790	247801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383312133
123	NC_017028	AAAGAA	2	12	248430	248441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383312133
124	NC_017028	TCAAGC	2	12	248447	248458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383312133
125	NC_017028	GTTGAG	2	12	249015	249026	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383312134
126	NC_017028	ATCTAA	2	12	249652	249663	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312134
127	NC_017028	TAGAGC	2	12	253497	253508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383312138
128	NC_017028	AATTTA	2	12	255825	255836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017028	GAACAA	2	12	257018	257029	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383312142
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172	NC_017028	TTACTC	2	12	349135	349146	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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229	NC_017028	TTGATA	2	12	461532	461543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
230	NC_017028	TTTTAC	2	12	462599	462610	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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233	NC_017028	GTAATA	2	12	468974	468985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312334
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235	NC_017028	ATAAGA	2	12	474183	474194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383312338
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237	NC_017028	TAAAAT	2	12	476711	476722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_017028	AAATTA	2	12	476734	476745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_017028	ATGCTT	2	12	478242	478253	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312344
240	NC_017028	ATATTG	2	12	483312	483323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383312348
241	NC_017028	ATCTTT	2	12	484910	484921	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312349
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243	NC_017028	TTAATA	2	12	487618	487629	50 %	50 %	0 %	0 %	383312353
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251	NC_017028	ATTTAA	2	12	508049	508060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017028	GATTCA	2	12	508820	508831	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312370
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361	NC_017028	AATTAT	2	12	750128	750139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_017028	ATTCAA	2	12	1037123	1037134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312863
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476	NC_017028	TAAAAA	2	12	1040951	1040962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383312865
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478	NC_017028	TTAAAA	2	12	1056626	1056637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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