MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 488

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	AAAGTA	2	12	790	801	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383311894
2	NC_017028	GTAGGT	2	12	3008	3019	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383311896
3	NC_017028	GCCCCA	2	12	10828	10839	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383311904
4	NC_017028	TACAAT	2	12	11912	11923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383311905
5	NC_017028	CGGCAT	2	12	12600	12611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383311906
6	NC_017028	ATGTTA	2	12	18279	18290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383311910
7	NC_017028	AATGAA	2	12	18493	18504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383311910
8	NC_017028	TTAGCT	2	12	20631	20642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383311912
9	NC_017028	ATATTT	2	12	35909	35920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311930
10	NC_017028	TAATAT	2	12	36020	36031	50 %	50 %	0 %	0 %	383311930
11	NC_017028	GAAGTA	2	12	38832	38843	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383311931
12	NC_017028	TATTGC	2	12	42855	42866	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383311934
13	NC_017028	ATTTAA	2	12	43290	43301	50 %	50 %	0 %	0 %	383311935
14	NC_017028	AGAACT	2	12	46061	46072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383311937
15	NC_017028	TATGAT	2	12	48094	48105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383311940
16	NC_017028	ATCTGC	2	12	58405	58416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383311955
17	NC_017028	CTACAT	2	12	59653	59664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311956
18	NC_017028	TAAATA	2	12	64138	64149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311958
19	NC_017028	ATTTTT	2	12	66569	66580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383311962
20	NC_017028	TTTAAT	2	12	68053	68064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311963
21	NC_017028	ATACCG	2	12	68458	68469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383311963
22	NC_017028	TTTAGA	2	12	70469	70480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383311966
23	NC_017028	CAAAAT	2	12	70494	70505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383311966
24	NC_017028	CGGTGG	2	12	73550	73561	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383311970
25	NC_017028	AATATC	2	12	76942	76953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383311975
26	NC_017028	TTTTCC	2	12	77942	77953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311976
27	NC_017028	AAAGTA	2	12	80132	80143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383311978
28	NC_017028	AGGATA	2	12	82536	82547	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383311981
29	NC_017028	CTAATA	2	12	83457	83468	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383311981
30	NC_017028	CAAAAC	2	12	83974	83985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311981
31	NC_017028	CAAAAT	2	12	84827	84838	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383311981
32	NC_017028	ACCGTA	2	12	86377	86388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383311985
33	NC_017028	AAAGAC	2	12	90041	90052	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383311989
34	NC_017028	TAAAAA	2	12	94881	94892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383311993
35	NC_017028	CCTTAA	2	12	97069	97080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311994
36	NC_017028	AGTATA	2	12	97290	97301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383311995
37	NC_017028	TATTAA	2	12	97380	97391	50 %	50 %	0 %	0 %	383311996
38	NC_017028	AGCTTT	2	12	97943	97954	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383311996
39	NC_017028	AAAGAT	2	12	102084	102095	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383312003
40	NC_017028	TTGTAT	2	12	105511	105522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383312007
41	NC_017028	TATATG	2	12	109044	109055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383312012
42	NC_017028	TAGAAT	2	12	113141	113152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312018
43	NC_017028	ATAATT	2	12	118158	118169	50 %	50 %	0 %	0 %	383312023
44	NC_017028	TAATGC	2	12	118896	118907	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312023
45	NC_017028	AGCTTC	2	12	120213	120224	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312023
46	NC_017028	CATCTG	2	12	120635	120646	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312023
47	NC_017028	CTAAAT	2	12	121490	121501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312023
48	NC_017028	TCCGGT	2	12	123595	123606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383312023
49	NC_017028	GATATA	2	12	125830	125841	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312026
50	NC_017028	AATTAG	2	12	126446	126457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312026
51	NC_017028	ATTTAA	2	12	126494	126505	50 %	50 %	0 %	0 %	383312026
52	NC_017028	ATTGCT	2	12	140359	140370	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312038
53	NC_017028	ATTTAT	2	12	140940	140951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312039
54	NC_017028	ATAAGG	2	12	141139	141150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383312039
55	NC_017028	TAATAG	2	12	141911	141922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312040
56	NC_017028	ATCAGA	2	12	144985	144996	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312044
57	NC_017028	TTTTTG	2	12	147106	147117	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383312046
58	NC_017028	AAAACA	2	12	148935	148946	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383312046
59	NC_017028	TAATAT	2	12	153648	153659	50 %	50 %	0 %	0 %	383312051
60	NC_017028	CAGCAA	2	12	154317	154328	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383312052
61	NC_017028	ATAGTG	2	12	154648	154659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312052
62	NC_017028	AAAAAG	2	12	155476	155487	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383312052
63	NC_017028	ATCCTG	2	12	160826	160837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312057
64	NC_017028	AAAGCT	2	12	161245	161256	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312057
65	NC_017028	GTAATA	2	12	161884	161895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312057
66	NC_017028	CTAAAA	2	12	162215	162226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383312058
67	NC_017028	AGTAAA	2	12	170636	170647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383312066
68	NC_017028	AAGGAC	2	12	172541	172552	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383312069
69	NC_017028	CGTGAT	2	12	173498	173509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383312071
70	NC_017028	TTGATT	2	12	175994	176005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383312072
71	NC_017028	GAAGCA	2	12	177087	177098	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383312073
72	NC_017028	TCTTTA	2	12	188353	188364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312078
73	NC_017028	ATCTTT	2	12	188577	188588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312078
74	NC_017028	ATTAGC	2	12	189396	189407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312078
75	NC_017028	TATTTT	2	12	191943	191954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383312080
76	NC_017028	ACTAAA	2	12	193585	193596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383312080
77	NC_017028	CTAAAG	2	12	194244	194255	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312080
78	NC_017028	TATCTT	2	12	194406	194417	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312080
79	NC_017028	TAGCAA	2	12	194571	194582	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312080
80	NC_017028	ACAAAG	2	12	196661	196672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383312081
81	NC_017028	AATTTT	2	12	204005	204016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383312089
82	NC_017028	TATAGG	2	12	210219	210230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312097
83	NC_017028	CTTAAA	2	12	210492	210503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312098
84	NC_017028	AAAAAG	2	12	213061	213072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383312100
85	NC_017028	CCGCTA	2	12	213420	213431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383312100
86	NC_017028	ATTTTT	2	12	216436	216447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383312102
87	NC_017028	AGCGGT	2	12	228122	228133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383312110
88	NC_017028	TATAGG	2	12	229732	229743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312111
89	NC_017028	ATCCGT	2	12	233518	233529	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383312115
90	NC_017028	TAAAAA	2	12	234547	234558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383312117
91	NC_017028	TTTATC	2	12	238292	238303	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312121
92	NC_017028	GATTTT	2	12	238586	238597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383312122
93	NC_017028	CTTTTG	2	12	241094	241105	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383312124
94	NC_017028	GTAAAA	2	12	242418	242429	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383312125
95	NC_017028	CAATAT	2	12	245439	245450	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312130
96	NC_017028	ATTGAG	2	12	245790	245801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312131
97	NC_017028	CTTCAT	2	12	246016	246027	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383312131
98	NC_017028	TAGGAT	2	12	246079	246090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383312131
99	NC_017028	TCAATT	2	12	247790	247801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383312133
100	NC_017028	AAAGAA	2	12	248430	248441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383312133
101	NC_017028	TCAAGC	2	12	248447	248458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383312133
102	NC_017028	GTTGAG	2	12	249015	249026	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383312134
103	NC_017028	ATCTAA	2	12	249652	249663	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383312134
104	NC_017028	TAGAGC	2	12	253497	253508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383312138
105	NC_017028	GAACAA	2	12	257018	257029	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383312142
106	NC_017028	ATAAAA	2	12	258435	258446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383312142
107	NC_017028	TTTTTA	2	12	259367	259378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383312143
108	NC_017028	CTGTAG	2	12	262401	262412	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383312148
109	NC_017028	TTAAAA	2	12	264636	264647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312149
110	NC_017028	GCTATT	2	12	266483	266494	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312149
111	NC_017028	ATAATT	2	12	272575	272586	50 %	50 %	0 %	0 %	383312151
112	NC_017028	GATGTT	2	12	274464	274475	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383312152
113	NC_017028	AAAAAT	2	12	276943	276954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383312155
114	NC_017028	AAGCCC	2	12	286127	286138	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383312161
115	NC_017028	TATAAA	2	12	290800	290811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312168
116	NC_017028	CTTTAG	2	12	295856	295867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312171
117	NC_017028	TGCCGA	2	12	296346	296357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383312171
118	NC_017028	GTTTCA	2	12	300120	300131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312175
119	NC_017028	AAAAGC	2	12	301340	301351	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383312176
120	NC_017028	TTTCTT	2	12	302795	302806	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383312178
121	NC_017028	AAATTA	2	12	303968	303979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383312180
122	NC_017028	AGTTAA	2	12	305899	305910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383312181
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125	NC_017028	AAGTGA	2	12	309595	309606	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383312184
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230	NC_017028	CTTTTG	2	12	626159	626170	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383312483
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233	NC_017028	GATTGT	2	12	632924	632935	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383312489
234	NC_017028	AATCCC	2	12	640288	640299	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383312495
235	NC_017028	GCTTAT	2	12	643127	643138	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383312497
236	NC_017028	CATATT	2	12	654069	654080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383312506
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238	NC_017028	TTGTTA	2	12	657866	657877	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383312510
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340	NC_017028	TATCAG	2	12	975873	975884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312820
341	NC_017028	TATCAG	2	12	976035	976046	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383312820
342	NC_017028	TGTTGC	2	12	977059	977070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383312820
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345	NC_017028	CTTTTA	2	12	981270	981281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383312820
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348	NC_017028	AGAGAT	2	12	991784	991795	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383312830
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352	NC_017028	TCAGAA	2	12	1000543	1000554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383312838
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449	NC_017028	GGCGTT	2	12	1345282	1345293	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383313147
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452	NC_017028	TTGCTC	2	12	1347863	1347874	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383313148
453	NC_017028	CTTACT	2	12	1352052	1352063	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383313153
454	NC_017028	TACCCG	2	12	1356498	1356509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383313155
455	NC_017028	AGCAGG	2	12	1358112	1358123	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383313157
456	NC_017028	ATCCGA	2	12	1359579	1359590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383313158
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