MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 927

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	ATATA	2	10	459	468	60 %	40 %	0 %	0 %	383311894
2	NC_017028	ACTAA	2	10	778	787	60 %	20 %	0 %	20 %	383311894
3	NC_017028	GTTTT	2	10	2305	2314	0 %	80 %	20 %	0 %	383311895
4	NC_017028	GCAAA	2	10	2361	2370	60 %	0 %	20 %	20 %	383311895
5	NC_017028	GCATC	2	10	6406	6415	20 %	20 %	20 %	40 %	383311900
6	NC_017028	TATTT	2	10	6459	6468	20 %	80 %	0 %	0 %	383311900
7	NC_017028	AAATA	2	10	7757	7766	80 %	20 %	0 %	0 %	383311900
8	NC_017028	AAAAG	2	10	7994	8003	80 %	0 %	20 %	0 %	383311900
9	NC_017028	TAAAG	2	10	11953	11962	60 %	20 %	20 %	0 %	383311905
10	NC_017028	AAAAT	2	10	14054	14063	80 %	20 %	0 %	0 %	383311906
11	NC_017028	TGAAT	2	10	16585	16594	40 %	40 %	20 %	0 %	383311908
12	NC_017028	TGTTA	2	10	16667	16676	20 %	60 %	20 %	0 %	383311908
13	NC_017028	GGATT	2	10	17669	17678	20 %	40 %	40 %	0 %	383311910
14	NC_017028	TAAAT	2	10	18184	18193	60 %	40 %	0 %	0 %	383311910
15	NC_017028	TTTAA	2	10	18970	18979	40 %	60 %	0 %	0 %	383311910
16	NC_017028	TATTT	2	10	19160	19169	20 %	80 %	0 %	0 %	383311911
17	NC_017028	ATTTT	2	10	19296	19305	20 %	80 %	0 %	0 %	383311911
18	NC_017028	TACAT	2	10	19397	19406	40 %	40 %	0 %	20 %	383311911
19	NC_017028	GTCCG	2	10	20009	20018	0 %	20 %	40 %	40 %	383311911
20	NC_017028	ATATT	2	10	23164	23173	40 %	60 %	0 %	0 %	383311915
21	NC_017028	ATATA	2	10	23230	23239	60 %	40 %	0 %	0 %	383311915
22	NC_017028	ATTTT	2	10	24170	24179	20 %	80 %	0 %	0 %	383311916
23	NC_017028	ATAGA	2	10	24307	24316	60 %	20 %	20 %	0 %	383311916
24	NC_017028	TAAAA	2	10	27716	27725	80 %	20 %	0 %	0 %	383311921
25	NC_017028	ATTTT	2	10	29742	29751	20 %	80 %	0 %	0 %	383311922
26	NC_017028	ACTTA	2	10	31683	31692	40 %	40 %	0 %	20 %	383311925
27	NC_017028	TATAA	2	10	33596	33605	60 %	40 %	0 %	0 %	383311927
28	NC_017028	TTCTT	2	10	34366	34375	0 %	80 %	0 %	20 %	383311928
29	NC_017028	TTTTA	2	10	35145	35154	20 %	80 %	0 %	0 %	383311929
30	NC_017028	AGCTA	2	10	35879	35888	40 %	20 %	20 %	20 %	383311930
31	NC_017028	TTTTG	2	10	35985	35994	0 %	80 %	20 %	0 %	383311930
32	NC_017028	TATTT	2	10	36527	36536	20 %	80 %	0 %	0 %	383311930
33	NC_017028	CTTGG	2	10	38575	38584	0 %	40 %	40 %	20 %	383311931
34	NC_017028	AATTA	2	10	39392	39401	60 %	40 %	0 %	0 %	383311931
35	NC_017028	TTCTA	2	10	42247	42256	20 %	60 %	0 %	20 %	383311934
36	NC_017028	CATAC	2	10	42402	42411	40 %	20 %	0 %	40 %	383311934
37	NC_017028	TTTTC	2	10	43727	43736	0 %	80 %	0 %	20 %	383311935
38	NC_017028	CCCCT	2	10	44052	44061	0 %	20 %	0 %	80 %	383311935
39	NC_017028	ATCAT	2	10	50898	50907	40 %	40 %	0 %	20 %	383311943
40	NC_017028	TAGAA	2	10	51208	51217	60 %	20 %	20 %	0 %	383311944
41	NC_017028	ATTTT	2	10	51930	51939	20 %	80 %	0 %	0 %	383311946
42	NC_017028	ATATA	2	10	52337	52346	60 %	40 %	0 %	0 %	383311946
43	NC_017028	CGATG	2	10	54114	54123	20 %	20 %	40 %	20 %	383311950
44	NC_017028	GATTT	2	10	54964	54973	20 %	60 %	20 %	0 %	383311951
45	NC_017028	CTTGC	2	10	55277	55286	0 %	40 %	20 %	40 %	383311951
46	NC_017028	GTTTT	2	10	55686	55695	0 %	80 %	20 %	0 %	383311952
47	NC_017028	TAGTA	2	10	57040	57049	40 %	40 %	20 %	0 %	383311954
48	NC_017028	ATTTT	2	10	57975	57984	20 %	80 %	0 %	0 %	383311954
49	NC_017028	TTTAT	2	10	58797	58806	20 %	80 %	0 %	0 %	383311956
50	NC_017028	TTTTA	2	10	58940	58949	20 %	80 %	0 %	0 %	383311956
51	NC_017028	ATTTA	2	10	59300	59309	40 %	60 %	0 %	0 %	383311956
52	NC_017028	TGCTT	2	10	59442	59451	0 %	60 %	20 %	20 %	383311956
53	NC_017028	AATAA	2	10	60589	60598	80 %	20 %	0 %	0 %	383311957
54	NC_017028	AAGCA	2	10	64045	64054	60 %	0 %	20 %	20 %	383311958
55	NC_017028	ATATC	2	10	65187	65196	40 %	40 %	0 %	20 %	383311960
56	NC_017028	CATGC	2	10	65368	65377	20 %	20 %	20 %	40 %	383311960
57	NC_017028	GCCAA	2	10	66214	66223	40 %	0 %	20 %	40 %	383311961
58	NC_017028	ACTAT	2	10	67321	67330	40 %	40 %	0 %	20 %	383311963
59	NC_017028	AACCT	2	10	67714	67723	40 %	20 %	0 %	40 %	383311963
60	NC_017028	AATTT	2	10	74137	74146	40 %	60 %	0 %	0 %	383311970
61	NC_017028	CTACT	2	10	76698	76707	20 %	40 %	0 %	40 %	383311975
62	NC_017028	ATAGA	2	10	77302	77311	60 %	20 %	20 %	0 %	383311975
63	NC_017028	TTCTT	2	10	77379	77388	0 %	80 %	0 %	20 %	383311975
64	NC_017028	CTTTC	2	10	77477	77486	0 %	60 %	0 %	40 %	383311976
65	NC_017028	CACTC	2	10	77581	77590	20 %	20 %	0 %	60 %	383311976
66	NC_017028	TATTT	2	10	77897	77906	20 %	80 %	0 %	0 %	383311976
67	NC_017028	TAACG	2	10	79993	80002	40 %	20 %	20 %	20 %	383311978
68	NC_017028	TTTTA	2	10	81440	81449	20 %	80 %	0 %	0 %	383311980
69	NC_017028	ATTTA	2	10	81793	81802	40 %	60 %	0 %	0 %	383311980
70	NC_017028	GGTCA	2	10	83040	83049	20 %	20 %	40 %	20 %	383311981
71	NC_017028	TAAAT	2	10	83749	83758	60 %	40 %	0 %	0 %	383311981
72	NC_017028	GTAGT	2	10	84075	84084	20 %	40 %	40 %	0 %	383311981
73	NC_017028	AATAC	2	10	86225	86234	60 %	20 %	0 %	20 %	383311984
74	NC_017028	ATCCA	2	10	86722	86731	40 %	20 %	0 %	40 %	383311985
75	NC_017028	AGAAT	2	10	90095	90104	60 %	20 %	20 %	0 %	383311989
76	NC_017028	ATCTT	2	10	91840	91849	20 %	60 %	0 %	20 %	383311991
77	NC_017028	ATAAA	2	10	92188	92197	80 %	20 %	0 %	0 %	383311992
78	NC_017028	GAAAC	2	10	94660	94669	60 %	0 %	20 %	20 %	383311993
79	NC_017028	TTTCT	2	10	95100	95109	0 %	80 %	0 %	20 %	383311993
80	NC_017028	TTACG	2	10	97500	97509	20 %	40 %	20 %	20 %	383311996
81	NC_017028	GTTTG	2	10	97671	97680	0 %	60 %	40 %	0 %	383311996
82	NC_017028	CCTCT	2	10	97722	97731	0 %	40 %	0 %	60 %	383311996
83	NC_017028	TATGG	2	10	99253	99262	20 %	40 %	40 %	0 %	383311998
84	NC_017028	ATATA	2	10	102035	102044	60 %	40 %	0 %	0 %	383312003
85	NC_017028	ATAAA	2	10	107831	107840	80 %	20 %	0 %	0 %	383312011
86	NC_017028	GACAA	2	10	107962	107971	60 %	0 %	20 %	20 %	383312012
87	NC_017028	ACAAA	2	10	113090	113099	80 %	0 %	0 %	20 %	383312018
88	NC_017028	TGATC	2	10	114964	114973	20 %	40 %	20 %	20 %	383312020
89	NC_017028	TAATA	2	10	115184	115193	60 %	40 %	0 %	0 %	383312020
90	NC_017028	AGGTA	2	10	118989	118998	40 %	20 %	40 %	0 %	383312023
91	NC_017028	TCTTT	2	10	119489	119498	0 %	80 %	0 %	20 %	383312023
92	NC_017028	TCTGC	2	10	120670	120679	0 %	40 %	20 %	40 %	383312023
93	NC_017028	CTTTG	2	10	120982	120991	0 %	60 %	20 %	20 %	383312023
94	NC_017028	TTGAT	2	10	121908	121917	20 %	60 %	20 %	0 %	383312023
95	NC_017028	TTCTT	2	10	122504	122513	0 %	80 %	0 %	20 %	383312023
96	NC_017028	TTTAT	2	10	122770	122779	20 %	80 %	0 %	0 %	383312023
97	NC_017028	CTTGA	2	10	122824	122833	20 %	40 %	20 %	20 %	383312023
98	NC_017028	TAAAT	2	10	126657	126666	60 %	40 %	0 %	0 %	383312026
99	NC_017028	AATTT	2	10	128090	128099	40 %	60 %	0 %	0 %	383312028
100	NC_017028	AGTTA	2	10	128311	128320	40 %	40 %	20 %	0 %	383312028
101	NC_017028	ATTAA	2	10	129489	129498	60 %	40 %	0 %	0 %	383312029
102	NC_017028	TTTAT	2	10	131323	131332	20 %	80 %	0 %	0 %	383312030
103	NC_017028	TTGAT	2	10	138242	138251	20 %	60 %	20 %	0 %	383312037
104	NC_017028	TAAAG	2	10	139269	139278	60 %	20 %	20 %	0 %	383312037
105	NC_017028	ATTAT	2	10	139342	139351	40 %	60 %	0 %	0 %	383312037
106	NC_017028	TCGGT	2	10	144813	144822	0 %	40 %	40 %	20 %	383312044
107	NC_017028	GCTTT	2	10	146406	146415	0 %	60 %	20 %	20 %	383312045
108	NC_017028	TAAAA	2	10	150197	150206	80 %	20 %	0 %	0 %	383312047
109	NC_017028	TCGAT	2	10	150782	150791	20 %	40 %	20 %	20 %	383312049
110	NC_017028	ATAAA	2	10	152407	152416	80 %	20 %	0 %	0 %	383312050
111	NC_017028	ACTTT	2	10	153072	153081	20 %	60 %	0 %	20 %	383312051
112	NC_017028	GCTTA	2	10	153261	153270	20 %	40 %	20 %	20 %	383312051
113	NC_017028	CATTT	2	10	153964	153973	20 %	60 %	0 %	20 %	383312051
114	NC_017028	TTAAA	2	10	153989	153998	60 %	40 %	0 %	0 %	383312051
115	NC_017028	TTAGT	2	10	154591	154600	20 %	60 %	20 %	0 %	383312052
116	NC_017028	AAAAG	2	10	161235	161244	80 %	0 %	20 %	0 %	383312057
117	NC_017028	GGGTT	2	10	161445	161454	0 %	40 %	60 %	0 %	383312057
118	NC_017028	TTTAT	2	10	161821	161830	20 %	80 %	0 %	0 %	383312057
119	NC_017028	GCTTA	2	10	163158	163167	20 %	40 %	20 %	20 %	383312058
120	NC_017028	ACAAT	2	10	163522	163531	60 %	20 %	0 %	20 %	383312059
121	NC_017028	GTTAT	2	10	164147	164156	20 %	60 %	20 %	0 %	383312060
122	NC_017028	GTAGA	2	10	164453	164462	40 %	20 %	40 %	0 %	383312060
123	NC_017028	CAATG	2	10	166805	166814	40 %	20 %	20 %	20 %	383312062
124	NC_017028	ATAAA	2	10	167268	167277	80 %	20 %	0 %	0 %	383312063
125	NC_017028	ATTAA	2	10	167974	167983	60 %	40 %	0 %	0 %	383312063
126	NC_017028	ATGTC	2	10	168215	168224	20 %	40 %	20 %	20 %	383312064
127	NC_017028	GAAAA	2	10	168500	168509	80 %	0 %	20 %	0 %	383312064
128	NC_017028	TGAAA	2	10	179484	179493	60 %	20 %	20 %	0 %	383312074
129	NC_017028	TATTT	2	10	180378	180387	20 %	80 %	0 %	0 %	383312076
130	NC_017028	ACCAT	2	10	183390	183399	40 %	20 %	0 %	40 %	383312076
131	NC_017028	AATAA	2	10	184150	184159	80 %	20 %	0 %	0 %	383312077
132	NC_017028	ATAAC	2	10	184554	184563	60 %	20 %	0 %	20 %	383312077
133	NC_017028	CTGCA	2	10	184970	184979	20 %	20 %	20 %	40 %	383312077
134	NC_017028	AACTA	2	10	185963	185972	60 %	20 %	0 %	20 %	383312077
135	NC_017028	CTTGT	2	10	186827	186836	0 %	60 %	20 %	20 %	383312078
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262	NC_017028	TTTCC	2	10	386199	386208	0 %	60 %	0 %	40 %	383312246
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