MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 1166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	TAAA	2	8	1161	1168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017028	ATTT	2	8	2653	2660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017028	TATT	2	8	3843	3850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017028	ACTT	2	8	4612	4619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017028	GTCA	2	8	5031	5038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017028	CTTA	2	8	5169	5176	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017028	ATTT	2	8	5441	5448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017028	GTAG	2	8	8928	8935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017028	TGTA	2	8	10389	10396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017028	ATTA	2	8	10450	10457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017028	GCTT	2	8	10963	10970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017028	TGTT	2	8	11009	11016	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017028	GTTT	2	8	11042	11049	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017028	TTCC	2	8	11286	11293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017028	TAAT	2	8	11519	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017028	TATT	2	8	12275	12282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017028	TAAT	2	8	14358	14365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017028	ATCT	2	8	15913	15920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017028	ATTT	2	8	15952	15959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017028	ATTT	2	8	16165	16172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017028	ACAA	2	8	17178	17185	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017028	GCGA	2	8	19036	19043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017028	TCGC	2	8	20194	20201	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017028	AGTA	2	8	21549	21556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017028	GAAA	2	8	24357	24364	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017028	TAAA	2	8	24406	24413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017028	TGCA	2	8	24425	24432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017028	TAAA	2	8	25856	25863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017028	TAAA	2	8	27161	27168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017028	GAAA	2	8	31060	31067	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017028	TTGC	2	8	33770	33777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017028	TAAT	2	8	51450	51457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017028	TAAA	2	8	52354	52361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017028	TAAG	2	8	52866	52873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017028	ATTC	2	8	53072	53079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017028	TAAT	2	8	54021	54028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017028	CCAT	2	8	56880	56887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017028	CAAA	2	8	56957	56964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017028	GTTT	2	8	59905	59912	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017028	GCTT	2	8	60054	60061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017028	TTTA	2	8	60397	60404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017028	TATT	2	8	61321	61328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017028	ATTA	2	8	61451	61458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017028	TATC	2	8	61588	61595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017028	TATT	2	8	61687	61694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017028	TTTC	2	8	61919	61926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017028	CATT	2	8	62063	62070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017028	TAAT	2	8	62373	62380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017028	AATT	2	8	62533	62540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017028	ACAA	2	8	62681	62688	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017028	AGTT	2	8	62698	62705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017028	CAAT	2	8	63041	63048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017028	TACT	2	8	63377	63384	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017028	TTTA	2	8	63549	63556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017028	GCTT	2	8	65633	65640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017028	GCGA	2	8	66709	66716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017028	TAAA	2	8	68842	68849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017028	GTAA	2	8	68941	68948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017028	ATTC	2	8	69273	69280	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017028	GTTA	2	8	69867	69874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017028	TAAC	2	8	69883	69890	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017028	AATT	2	8	70033	70040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017028	AATT	2	8	74602	74609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017028	TTCA	2	8	74614	74621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017028	ATTC	2	8	74726	74733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017028	ATTT	2	8	74771	74778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017028	TAAA	2	8	75200	75207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017028	ATAA	2	8	75230	75237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017028	TAAT	2	8	75485	75492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017028	TTTA	2	8	75708	75715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017028	CTTT	2	8	75727	75734	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017028	GTAA	2	8	75790	75797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017028	TTTA	2	8	79664	79671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017028	TAAA	2	8	85508	85515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017028	AGTA	2	8	88012	88019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017028	CAAT	2	8	89136	89143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017028	ATTA	2	8	90148	90155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017028	TTTA	2	8	90985	90992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017028	AATT	2	8	91463	91470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017028	TTAA	2	8	91813	91820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017028	ATAA	2	8	92318	92325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017028	ATAA	2	8	92360	92367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017028	TAGT	2	8	92381	92388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017028	ATGT	2	8	92685	92692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017028	GTGA	2	8	92753	92760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017028	ATTT	2	8	93547	93554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017028	GTAA	2	8	95491	95498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017028	TAAT	2	8	95557	95564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017028	AAAT	2	8	95571	95578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017028	GGCT	2	8	96014	96021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017028	GTTA	2	8	98030	98037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017028	TCAT	2	8	98220	98227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017028	TATT	2	8	98417	98424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017028	TGCT	2	8	98487	98494	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017028	TTTG	2	8	99932	99939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017028	AAAT	2	8	100204	100211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017028	TTTC	2	8	100248	100255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017028	ATTT	2	8	100459	100466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017028	ATTA	2	8	100560	100567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017028	AGAA	2	8	101017	101024	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017028	CAAG	2	8	101431	101438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017028	TATT	2	8	101539	101546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017028	AGCA	2	8	101561	101568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017028	TGTT	2	8	103910	103917	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017028	CAAA	2	8	104152	104159	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017028	CATT	2	8	104912	104919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017028	AATT	2	8	107933	107940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017028	ATTA	2	8	112610	112617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017028	CTAG	2	8	113860	113867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017028	ATTT	2	8	113870	113877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017028	TATT	2	8	114169	114176	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017028	TTTA	2	8	114207	114214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017028	GTAC	2	8	114371	114378	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017028	GTAT	2	8	114414	114421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017028	AAAT	2	8	114633	114640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017028	TATT	2	8	114700	114707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017028	ATAA	2	8	115319	115326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017028	CTTT	2	8	115716	115723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017028	TACT	2	8	115731	115738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017028	ATAA	2	8	116487	116494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017028	ATCT	2	8	124077	124084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017028	AAAG	2	8	124454	124461	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017028	AGCA	2	8	124517	124524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017028	TACT	2	8	124569	124576	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017028	GCTT	2	8	124628	124635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017028	AAGA	2	8	128388	128395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017028	TTTA	2	8	128498	128505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017028	CTAA	2	8	128573	128580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017028	GAAA	2	8	128814	128821	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017028	ATGA	2	8	128836	128843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017028	TTTA	2	8	128956	128963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017028	TATT	2	8	129113	129120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017028	ACTT	2	8	130806	130813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017028	TTAA	2	8	130822	130829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017028	ACTA	2	8	131132	131139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017028	TTTA	2	8	131152	131159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017028	AACT	2	8	133301	133308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017028	TCTA	2	8	133420	133427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017028	CAAG	2	8	134567	134574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017028	CTGC	2	8	135031	135038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017028	ATCT	2	8	135214	135221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017028	TTTC	2	8	135524	135531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017028	TGCT	2	8	135693	135700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017028	TAAA	2	8	135946	135953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017028	ATTA	2	8	137045	137052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017028	TTAT	2	8	137060	137067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017028	ATTA	2	8	139871	139878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017028	TAAA	2	8	140484	140491	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017028	ATCT	2	8	141689	141696	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_017028	TTAT	2	8	143466	143473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017028	GTTT	2	8	143827	143834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017028	TAAA	2	8	146987	146994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017028	ATTT	2	8	149013	149020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017028	ATTT	2	8	606348	606355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017028	TATT	2	8	606473	606480	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017028	AATA	2	8	607193	607200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_017028	ATTT	2	8	641888	641895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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