MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V chromosome

Total Repeats: 16271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017028	CGC	2	6	250	255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311893
2	NC_017028	ATC	2	6	293	298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311893
3	NC_017028	ACA	2	6	381	386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311893
4	NC_017028	TAT	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311894
5	NC_017028	TAA	2	6	473	478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
6	NC_017028	AAT	2	6	618	623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
7	NC_017028	AGA	2	6	624	629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311894
8	NC_017028	TAT	2	6	650	655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311894
9	NC_017028	TAA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
10	NC_017028	ATA	2	6	689	694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
11	NC_017028	ATA	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
12	NC_017028	CCA	2	6	735	740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311894
13	NC_017028	TAG	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311894
14	NC_017028	TGC	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311894
15	NC_017028	ATC	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311894
16	NC_017028	TAT	2	6	1038	1043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311894
17	NC_017028	ATA	2	6	1068	1073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311894
18	NC_017028	CAT	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311895
19	NC_017028	ACT	2	6	1364	1369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311895
20	NC_017028	AGA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311895
21	NC_017028	AAT	2	6	1553	1558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
22	NC_017028	CAA	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311895
23	NC_017028	TTA	2	6	1716	1721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311895
24	NC_017028	CTT	2	6	1729	1734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311895
25	NC_017028	CAA	2	6	1738	1743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311895
26	NC_017028	TTC	2	6	1766	1771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311895
27	NC_017028	TGG	2	6	1788	1793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311895
28	NC_017028	ATT	2	6	1797	1802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311895
29	NC_017028	TTA	2	6	1968	1973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311895
30	NC_017028	CTA	2	6	2020	2025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311895
31	NC_017028	AAG	2	6	2056	2061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311895
32	NC_017028	AAT	2	6	2094	2099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
33	NC_017028	CAA	2	6	2104	2109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311895
34	NC_017028	AAT	2	6	2116	2121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
35	NC_017028	AAT	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
36	NC_017028	AAT	2	6	2246	2251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
37	NC_017028	AGT	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311895
38	NC_017028	GAA	2	6	2334	2339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311895
39	NC_017028	GAT	4	12	2422	2433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311895
40	NC_017028	CGG	2	6	2435	2440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311895
41	NC_017028	TAA	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311895
42	NC_017028	AGG	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311895
43	NC_017028	AAG	2	6	2509	2514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311895
44	NC_017028	GTA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311895
45	NC_017028	TTA	2	6	2608	2613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311895
46	NC_017028	TAT	2	6	2847	2852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311896
47	NC_017028	CTT	2	6	2939	2944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311896
48	NC_017028	GGC	2	6	2954	2959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311896
49	NC_017028	TTG	2	6	3000	3005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311896
50	NC_017028	TGG	2	6	3040	3045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311896
51	NC_017028	AGA	2	6	3077	3082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311896
52	NC_017028	GTA	2	6	3129	3134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311896
53	NC_017028	TAA	2	6	3184	3189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311896
54	NC_017028	ACA	2	6	3256	3261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311896
55	NC_017028	GAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311897
56	NC_017028	CAG	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311897
57	NC_017028	TAA	2	6	3945	3950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311898
58	NC_017028	ACT	2	6	3997	4002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311898
59	NC_017028	GCG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311898
60	NC_017028	AGG	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311898
61	NC_017028	TAA	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311898
62	NC_017028	ATT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311898
63	NC_017028	CAA	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311898
64	NC_017028	TTA	2	6	4388	4393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311898
65	NC_017028	TAA	2	6	4454	4459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311898
66	NC_017028	CAC	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311898
67	NC_017028	ATC	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311899
68	NC_017028	ATC	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311899
69	NC_017028	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311900
70	NC_017028	AAT	2	6	6092	6097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311900
71	NC_017028	CAA	2	6	6160	6165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311900
72	NC_017028	TTA	2	6	6189	6194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
73	NC_017028	TCG	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383311900
74	NC_017028	TCA	2	6	6225	6230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
75	NC_017028	CAC	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383311900
76	NC_017028	AGT	2	6	6311	6316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311900
77	NC_017028	TCA	3	9	6424	6432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
78	NC_017028	TAT	2	6	6481	6486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
79	NC_017028	TTA	2	6	6550	6555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
80	NC_017028	GAG	2	6	6706	6711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383311900
81	NC_017028	AAT	2	6	6740	6745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311900
82	NC_017028	ATC	2	6	6846	6851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
83	NC_017028	TTG	2	6	6933	6938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311900
84	NC_017028	TAT	2	6	6967	6972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
85	NC_017028	GAC	2	6	7012	7017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311900
86	NC_017028	TTC	2	6	7043	7048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311900
87	NC_017028	TTC	2	6	7061	7066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311900
88	NC_017028	CCG	2	6	7092	7097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383311900
89	NC_017028	AAT	2	6	7124	7129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311900
90	NC_017028	TTC	2	6	7151	7156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311900
91	NC_017028	TAT	2	6	7225	7230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
92	NC_017028	TGA	2	6	7236	7241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311900
93	NC_017028	TCA	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
94	NC_017028	TCT	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311900
95	NC_017028	TCT	2	6	7617	7622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311900
96	NC_017028	TAT	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
97	NC_017028	GTT	2	6	7687	7692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311900
98	NC_017028	TTA	2	6	7693	7698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
99	NC_017028	TTA	2	6	7732	7737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
100	NC_017028	AGA	2	6	7859	7864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311900
101	NC_017028	TAC	2	6	7867	7872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
102	NC_017028	CGG	2	6	8105	8110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311900
103	NC_017028	TAT	2	6	8230	8235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311900
104	NC_017028	CTT	2	6	8237	8242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311900
105	NC_017028	ATC	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311900
106	NC_017028	ATA	2	6	8494	8499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311900
107	NC_017028	AGT	2	6	8558	8563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311900
108	NC_017028	AGA	2	6	8711	8716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383311900
109	NC_017028	AAC	2	6	8744	8749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311900
110	NC_017028	CAA	2	6	9045	9050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311901
111	NC_017028	AGT	2	6	9109	9114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311901
112	NC_017028	ATT	2	6	9277	9282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311901
113	NC_017028	TAA	2	6	9298	9303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311901
114	NC_017028	GAC	2	6	9380	9385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311901
115	NC_017028	AAT	2	6	9432	9437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311902
116	NC_017028	CTA	2	6	9470	9475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383311902
117	NC_017028	ATG	2	6	9479	9484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383311902
118	NC_017028	GGT	2	6	9553	9558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383311902
119	NC_017028	ATT	2	6	9788	9793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311902
120	NC_017028	GGC	2	6	9895	9900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311902
121	NC_017028	TAA	2	6	10053	10058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311902
122	NC_017028	AGC	2	6	10113	10118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311902
123	NC_017028	CAA	2	6	10467	10472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383311903
124	NC_017028	AGC	2	6	10770	10775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383311904
125	NC_017028	GGC	2	6	10863	10868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383311904
126	NC_017028	TTG	2	6	10869	10874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383311904
127	NC_017028	TCT	2	6	11924	11929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383311905
128	NC_017028	ATT	2	6	11999	12004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311905
129	NC_017028	AAT	2	6	12005	12010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383311905
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131	NC_017028	ATT	2	6	12078	12083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383311905
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