MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 3400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017026	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017026	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017026	GAGC	2	8	12096	12103	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017026	CTCA	2	8	12307	12314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017026	GCCC	2	8	12457	12464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_017026	ATTC	2	8	13695	13702	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017026	GGCC	2	8	25567	25574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017026	GCTC	2	8	26518	26525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017026	CCAA	2	8	26737	26744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017026	CAGC	2	8	26803	26810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017026	ACCA	2	8	31139	31146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017026	GCTA	2	8	33870	33877	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017026	CTAC	2	8	47234	47241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017026	GTGC	2	8	48434	48441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017026	GCCG	2	8	48719	48726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017026	CTGG	2	8	52735	52742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017026	ACCG	2	8	55528	55535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017026	GGCC	2	8	56365	56372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017026	CGCT	2	8	57093	57100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017026	CGGC	2	8	60022	60029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017026	GCGG	2	8	60034	60041	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017026	AACC	2	8	64706	64713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017026	CTGG	2	8	67067	67074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017026	GGCA	2	8	68721	68728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017026	TGCT	2	8	68890	68897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017026	TCGC	2	8	68915	68922	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017026	GCCG	2	8	68989	68996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017026	TTCG	2	8	69053	69060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017026	CGGT	2	8	69165	69172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017026	ATCG	2	8	69855	69862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017026	GCTC	2	8	70515	70522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017026	TCGA	2	8	70641	70648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017026	GCGT	2	8	71268	71275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017026	GCAC	2	8	75214	75221	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017026	CCGG	2	8	75382	75389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017026	ACCA	2	8	75705	75712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017026	TTGA	2	8	75741	75748	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017026	CGGT	2	8	79215	79222	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017026	CGGT	2	8	79400	79407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017026	GGCC	2	8	87017	87024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017026	CTGG	2	8	87249	87256	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017026	CGCA	2	8	89550	89557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017026	CGGT	2	8	90647	90654	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017026	TCGG	2	8	90689	90696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017026	GCCG	2	8	90744	90751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017026	CGCC	2	8	90828	90835	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_017026	CGCT	2	8	97683	97690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017026	CCTG	2	8	97730	97737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017026	GCGA	2	8	97774	97781	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017026	ACCG	2	8	99497	99504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017026	CGAT	2	8	99930	99937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017026	ACCG	2	8	100101	100108	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017026	ATCG	2	8	100141	100148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017026	CAGC	2	8	108682	108689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017026	CCTG	2	8	108913	108920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017026	AGTT	2	8	109030	109037	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017026	CCGA	2	8	109202	109209	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017026	CCGT	2	8	109249	109256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017026	TCGT	2	8	109824	109831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017026	CACC	2	8	120275	120282	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_017026	TCCT	2	8	120330	120337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017026	CGAC	2	8	120554	120561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017026	TCGC	2	8	120831	120838	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017026	ATCG	2	8	121363	121370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017026	TCGC	2	8	121451	121458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017026	GACG	2	8	121687	121694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017026	CCGA	2	8	121724	121731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017026	CAGC	2	8	121896	121903	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017026	ATCC	2	8	125651	125658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017026	GCGA	2	8	130740	130747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017026	CGGG	2	8	130783	130790	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017026	GGTG	2	8	131246	131253	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017026	GCTC	2	8	131296	131303	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017026	TACA	2	8	133217	133224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017026	CGGG	2	8	134015	134022	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017026	GTCG	2	8	134083	134090	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017026	GCCA	2	8	134176	134183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017026	GGCT	2	8	134889	134896	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017026	GGCC	2	8	135609	135616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017026	AGCG	2	8	135762	135769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017026	CTAC	2	8	136457	136464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017026	CCGG	2	8	136617	136624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017026	CGCA	2	8	136691	136698	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017026	TTCT	2	8	139933	139940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017026	ACGC	2	8	140005	140012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017026	AGCA	2	8	141181	141188	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017026	GCCG	2	8	143987	143994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017026	GCGT	2	8	148532	148539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017026	GCGG	2	8	149598	149605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017026	GCGG	2	8	150247	150254	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017026	CAGG	2	8	150548	150555	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017026	GCCG	2	8	152328	152335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017026	CCGG	2	8	155697	155704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017026	GCGT	3	12	155725	155736	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017026	TACC	2	8	156405	156412	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017026	TCAA	2	8	156437	156444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017026	GGCT	2	8	157873	157880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017026	CGCA	2	8	157899	157906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017026	TCGT	2	8	161590	161597	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017026	CCGG	2	8	161598	161605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017026	CCCG	2	8	161810	161817	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_017026	GGTA	2	8	170549	170556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017026	ACTT	2	8	171294	171301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017026	GGCC	2	8	171842	171849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017026	GCGA	2	8	172047	172054	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017026	TGGC	2	8	172121	172128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017026	TGGC	2	8	172135	172142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017026	ACCC	2	8	179334	179341	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_017026	TTGA	2	8	186831	186838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017026	TCGA	2	8	194504	194511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017026	GGGC	2	8	195301	195308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017026	CTGG	2	8	196825	196832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017026	CGGG	2	8	207650	207657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017026	AATG	2	8	208140	208147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017026	CCGC	2	8	208277	208284	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_017026	CTGT	2	8	212384	212391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017026	CCAG	2	8	213807	213814	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017026	CGGA	2	8	213843	213850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017026	CGGC	2	8	213883	213890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017026	CAGG	2	8	213913	213920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017026	AGCC	2	8	215728	215735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017026	GATG	2	8	219566	219573	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017026	CCCG	2	8	224229	224236	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_017026	CGGC	2	8	224327	224334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017026	ACGT	2	8	227235	227242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017026	CCAC	2	8	227563	227570	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_017026	ATGG	2	8	227801	227808	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017026	GCCT	2	8	227853	227860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017026	CGGC	2	8	227874	227881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017026	GCCG	2	8	227959	227966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017026	CACC	2	8	228841	228848	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_017026	TCGG	2	8	229654	229661	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017026	CCGG	2	8	229915	229922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017026	ACGG	2	8	230132	230139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017026	AACT	2	8	230764	230771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017026	GGAA	2	8	230939	230946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017026	ACGT	2	8	231691	231698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017026	ACAT	2	8	231758	231765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017026	GTGC	2	8	241474	241481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017026	CCAC	2	8	247916	247923	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_017026	CGGC	2	8	247999	248006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017026	CGGC	2	8	248076	248083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017026	GAAC	2	8	249162	249169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017026	CGCA	2	8	253773	253780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017026	GACG	2	8	256182	256189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017026	TCCG	2	8	256358	256365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017026	TCGG	2	8	258168	258175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017026	GGTC	2	8	258477	258484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017026	GCCC	2	8	258738	258745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_017026	ACGG	2	8	258920	258927	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017026	CGCT	2	8	268952	268959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_017026	GCCG	2	8	664167	664174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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