MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis RGTB327 chromosome

Total Repeats: 58918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017026	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305934
2	NC_017026	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305934
3	NC_017026	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
4	NC_017026	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
5	NC_017026	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305934
6	NC_017026	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
7	NC_017026	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305934
8	NC_017026	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305934
9	NC_017026	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
10	NC_017026	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305934
11	NC_017026	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
12	NC_017026	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305934
13	NC_017026	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305934
14	NC_017026	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305934
15	NC_017026	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
16	NC_017026	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383305934
17	NC_017026	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305934
18	NC_017026	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
19	NC_017026	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305934
20	NC_017026	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
21	NC_017026	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305934
22	NC_017026	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305934
23	NC_017026	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305934
24	NC_017026	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305934
25	NC_017026	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305935
26	NC_017026	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305935
27	NC_017026	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305935
28	NC_017026	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305935
29	NC_017026	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305935
30	NC_017026	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383305935
31	NC_017026	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305935
32	NC_017026	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305935
33	NC_017026	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305935
34	NC_017026	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305935
35	NC_017026	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305935
36	NC_017026	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305935
37	NC_017026	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305935
38	NC_017026	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383305935
39	NC_017026	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305935
40	NC_017026	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305935
41	NC_017026	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305935
42	NC_017026	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305935
43	NC_017026	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305936
44	NC_017026	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305936
45	NC_017026	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305936
46	NC_017026	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305936
47	NC_017026	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305936
48	NC_017026	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305936
49	NC_017026	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305936
50	NC_017026	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305936
51	NC_017026	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383305936
52	NC_017026	AGC	2	6	4030	4035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305936
53	NC_017026	GGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305936
54	NC_017026	GGC	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305936
55	NC_017026	GAC	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305936
56	NC_017026	GGC	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305937
57	NC_017026	TGG	2	6	4228	4233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305937
58	NC_017026	GTT	2	6	4243	4248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305937
59	NC_017026	CGA	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305937
60	NC_017026	CGG	2	6	4302	4307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305937
61	NC_017026	CCG	2	6	4314	4319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305937
62	NC_017026	CCG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305937
63	NC_017026	GGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305937
64	NC_017026	AAG	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383305938
65	NC_017026	GGT	2	6	5385	5390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305938
66	NC_017026	CGA	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305938
67	NC_017026	TGC	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305938
68	NC_017026	CGA	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305938
69	NC_017026	GTG	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305938
70	NC_017026	CGG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305938
71	NC_017026	TGG	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305938
72	NC_017026	GGT	2	6	5619	5624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305938
73	NC_017026	AAG	2	6	5734	5739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383305938
74	NC_017026	CAA	2	6	5841	5846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305938
75	NC_017026	CGA	2	6	5868	5873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305938
76	NC_017026	GTC	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305938
77	NC_017026	TGG	2	6	6011	6016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305938
78	NC_017026	AGC	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305938
79	NC_017026	GGC	2	6	6178	6183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305938
80	NC_017026	GGT	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305938
81	NC_017026	GCG	2	6	6522	6527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305938
82	NC_017026	ATC	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305938
83	NC_017026	ATC	2	6	6754	6759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305938
84	NC_017026	ACG	2	6	6782	6787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305938
85	NC_017026	TGT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305938
86	NC_017026	GTT	3	9	6879	6887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305938
87	NC_017026	CCG	2	6	6937	6942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305938
88	NC_017026	CTG	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305938
89	NC_017026	GAA	2	6	7035	7040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383305938
90	NC_017026	CAA	2	6	7044	7049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305938
91	NC_017026	ACC	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305938
92	NC_017026	GAC	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305938
93	NC_017026	GCC	4	12	7162	7173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305938
94	NC_017026	GTT	2	6	7179	7184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305938
95	NC_017026	GCC	2	6	7321	7326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305939
96	NC_017026	GAC	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
97	NC_017026	CAG	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
98	NC_017026	TCG	2	6	7410	7415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305939
99	NC_017026	ACC	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305939
100	NC_017026	TGG	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305939
101	NC_017026	CGG	2	6	7674	7679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305939
102	NC_017026	CGA	2	6	7738	7743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
103	NC_017026	ACG	2	6	7770	7775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
104	NC_017026	CTG	2	6	7820	7825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305939
105	NC_017026	GGC	2	6	7838	7843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305939
106	NC_017026	CGC	2	6	7872	7877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305939
107	NC_017026	ACG	2	6	7926	7931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
108	NC_017026	CGA	2	6	7933	7938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
109	NC_017026	CCG	2	6	7992	7997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383305939
110	NC_017026	TCG	2	6	8004	8009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305939
111	NC_017026	GTT	2	6	8069	8074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305939
112	NC_017026	AGA	2	6	8080	8085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383305939
113	NC_017026	TCA	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305939
114	NC_017026	GGT	2	6	8278	8283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383305939
115	NC_017026	TCG	2	6	8346	8351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305939
116	NC_017026	ACC	2	6	8403	8408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305939
117	NC_017026	GCG	2	6	8425	8430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305939
118	NC_017026	CAC	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305939
119	NC_017026	GCT	2	6	8572	8577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305939
120	NC_017026	CGA	2	6	8584	8589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
121	NC_017026	GCG	2	6	8623	8628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305939
122	NC_017026	CAT	2	6	8653	8658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305939
123	NC_017026	CGA	2	6	8659	8664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
124	NC_017026	CGA	2	6	8743	8748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
125	NC_017026	CGA	2	6	8776	8781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
126	NC_017026	ATC	2	6	8795	8800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383305939
127	NC_017026	CGA	2	6	8821	8826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
128	NC_017026	CGT	2	6	8848	8853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305939
129	NC_017026	CGG	2	6	8920	8925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305939
130	NC_017026	GAC	2	6	8957	8962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
131	NC_017026	TCG	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383305939
132	NC_017026	CTT	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383305939
133	NC_017026	TTC	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383305939
134	NC_017026	ACC	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305939
135	NC_017026	GCA	2	6	9082	9087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
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139	NC_017026	CGA	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305939
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162	NC_017026	AAC	2	6	10648	10653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383305940
163	NC_017026	GCA	2	6	10661	10666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305940
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250	NC_017026	TGT	2	6	17673	17678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383305952
251	NC_017026	TGA	2	6	17691	17696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383305952
252	NC_017026	AGC	2	6	17699	17704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305952
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254	NC_017026	AGC	2	6	17750	17755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383305952
255	NC_017026	CGG	2	6	17785	17790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383305952
256	NC_017026	ACC	2	6	17797	17802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383305952
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260	NC_017026	TTC	2	6	18005	18010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383305952
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