MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacterium indicum GPTSA100-9

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017025	AACATA	2	12	25013	25024	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017025	ATACAA	2	12	33367	33378	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017025	CAAAAT	2	12	40319	40330	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017025	CAAAAA	2	12	49545	49556	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017025	CCAATT	2	12	59077	59088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017025	TTATAA	2	12	69435	69446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017025	TATCAA	2	12	76879	76890	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017025	TAATTT	2	12	98151	98162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017025	TAAAAA	2	12	105066	105077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017025	GATATA	2	12	125646	125657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017025	AAAGAT	2	12	126033	126044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017025	GAATCA	2	12	127179	127190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017025	TATATG	2	12	129907	129918	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017025	TTGAAA	2	12	130093	130104	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017025	ATAAGA	2	12	134223	134234	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017025	TCAATC	2	12	139472	139483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017025	TCAATC	2	12	139668	139679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017025	TAAAAT	2	12	149412	149423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017025	ATTTTA	2	12	180513	180524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017025	TTATAC	2	12	183812	183823	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017025	TTATAC	2	12	187472	187483	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017025	AAACTT	2	12	225863	225874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017025	ATTTTT	2	12	227103	227114	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017025	ATTTTA	2	12	237964	237975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017025	AATTTG	2	12	261347	261358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017025	AATTAA	2	12	273423	273434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017025	AAACGT	2	12	308399	308410	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017025	CATTTT	2	12	329242	329253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017025	ATTTTT	2	12	343523	343534	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017025	AAAATT	2	12	408605	408616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017025	TATTAA	2	12	427431	427442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017025	GCTCTT	2	12	484777	484788	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017025	TCTTTT	2	12	484818	484829	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017025	AGAAAA	2	12	498406	498417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017025	TTCAAT	2	12	505199	505210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017025	TGCAAA	2	12	525466	525477	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017025	TTTGAA	2	12	558575	558586	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017025	CAACTA	2	12	561296	561307	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017025	ATTTAA	2	12	575568	575579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017025	ATTAAA	2	12	589642	589653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017025	TTGGTA	2	12	617068	617079	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017025	GTAATT	2	12	623628	623639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017025	AAGTTG	2	12	640915	640926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017025	TGAAAT	2	12	680140	680151	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017025	TCTTAA	2	12	683159	683170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017025	AATTTA	2	12	686861	686872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017025	TAAAGC	2	12	703489	703500	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017025	TCAATC	2	12	703652	703663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017025	ATAAAA	2	12	720190	720201	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017025	TATTCT	2	12	765778	765789	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017025	ATATTT	2	12	795812	795823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017025	TATTTT	2	12	806736	806747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017025	TCAATC	2	12	873891	873902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017025	ATCATA	2	12	952612	952623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017025	AGTAGA	2	12	999617	999628	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017025	ATGAAA	2	12	1003661	1003672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017025	GTATTT	2	12	1006249	1006260	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017025	TAGCGA	2	12	1009396	1009407	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017025	ATAAGA	2	12	1009531	1009542	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017025	TCAATC	2	12	1014803	1014814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017025	TAAAGC	2	12	1014838	1014849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017025	CATACA	2	12	1015265	1015276	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017025	TGGGTA	2	12	1034534	1034545	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017025	AATGTT	2	12	1043996	1044007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017025	ATTTTT	2	12	1072399	1072410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017025	ATTTTT	2	12	1118274	1118285	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017025	AACGTG	2	12	1120031	1120042	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017025	TTTTAT	2	12	1153107	1153118	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017025	GTTTTT	2	12	1181725	1181736	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017025	AACTAA	2	12	1205484	1205495	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017025	ATTTTT	2	12	1223223	1223234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017025	AATTAA	2	12	1245499	1245510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017025	ACATAC	2	12	1297000	1297011	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017025	AATTGA	2	12	1353894	1353905	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017025	TTTTAA	2	12	1385681	1385692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017025	TAAATT	2	12	1404865	1404876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017025	TAAAAA	2	12	1475952	1475963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017025	AATTTA	2	12	1487928	1487939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017025	AAAAAG	2	12	1504185	1504196	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017025	ATTTTT	2	12	1530334	1530345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017025	TACTAT	2	12	1545095	1545106	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017025	ATAAAA	2	12	1551252	1551263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017025	AATAAA	2	12	1556510	1556521	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017025	TTTAAT	2	12	1565450	1565461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017025	TCAATA	2	12	1579654	1579665	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017025	ATTCAA	2	12	1579695	1579706	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017025	TTCAAT	2	12	1579764	1579775	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017025	TATAAA	2	12	1597665	1597676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017025	ATCAGC	2	12	1654758	1654769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017025	TGTTAT	2	12	1655220	1655231	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017025	TGTTCC	2	12	1655651	1655662	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017025	TATTAA	2	12	1656731	1656742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017025	TGTTCC	2	12	1657463	1657474	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017025	ACTTGT	2	12	1659015	1659026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017025	TTTTTC	2	12	1660773	1660784	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017025	AAAATA	2	12	1663440	1663451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017025	ATTAAA	2	12	1667485	1667496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017025	TGTTCC	2	12	1668148	1668159	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017025	TCATAT	2	12	1669046	1669057	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017025	ATAATC	2	12	1669279	1669290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017025	ATAAGT	3	18	1670674	1670691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017025	ATTTCC	2	12	1672057	1672068	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017025	TTTTCC	2	12	1673463	1673474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017025	TAATAT	2	12	1673667	1673678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017025	CACTAT	2	12	1676013	1676024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017025	ATTAAT	2	12	1680792	1680803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017025	AATTAA	2	12	1680851	1680862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017025	TGTTTT	2	12	1699794	1699805	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017025	AAGAGA	2	12	1701039	1701050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017025	TTAATA	2	12	1708748	1708759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017025	AAATAT	2	12	1709018	1709029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017025	GTTGGG	2	12	1709033	1709044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017025	CTTATT	2	12	1725739	1725750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017025	CAATTT	2	12	1772211	1772222	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017025	AAAATG	2	12	1792024	1792035	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017025	TTTAAT	2	12	1805121	1805132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017025	ATTTAA	2	12	1826237	1826248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017025	TTATTT	2	12	1854039	1854050	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017025	TAAAAA	2	12	1877157	1877168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017025	ATTGAC	2	12	1877245	1877256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017025	ACTTTT	2	12	1879096	1879107	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017025	AACAAA	2	12	1885238	1885249	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017025	ATAAAA	2	12	1922026	1922037	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017025	TAAAAA	2	12	1951990	1952001	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017025	AAAACG	2	12	1954124	1954135	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017025	AATTCA	2	12	1973791	1973802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017025	AACATT	2	12	1997307	1997318	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017025	TAAAAA	2	12	2020565	2020576	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017025	TCAATT	2	12	2026158	2026169	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.