MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacterium indicum GPTSA100-9

Total Repeats: 434

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017025	TTAAA	2	10	6423	6432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017025	TCTTT	2	10	13902	13911	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017025	TTGTT	2	10	22966	22975	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017025	AAAAT	2	10	41141	41150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017025	AGTTA	2	10	58818	58827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017025	TAAGA	2	10	61669	61678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017025	TTAAT	2	10	69420	69429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017025	ATTTT	2	10	78048	78057	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017025	TTTAA	2	10	94846	94855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017025	AGATT	2	10	97264	97273	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017025	TTAGT	2	10	98763	98772	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017025	AGATT	2	10	98983	98992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017025	AGATG	2	10	99078	99087	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017025	GAAAT	2	10	101853	101862	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017025	AATAA	2	10	101875	101884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017025	CAACA	2	10	103107	103116	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_017025	AATTG	2	10	106267	106276	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017025	ATTTT	2	10	114599	114608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017025	ACGTA	2	10	118737	118746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017025	AAAAT	2	10	125463	125472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017025	TAAAT	2	10	129842	129851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017025	TGAAA	2	10	132253	132262	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017025	TGAAA	2	10	132335	132344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017025	TGGTA	2	10	134597	134606	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017025	TGTAG	2	10	135018	135027	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017025	CTGAA	2	10	136468	136477	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017025	CCGTA	2	10	137925	137934	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017025	ATTGA	2	10	138177	138186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017025	GTCTC	2	10	139575	139584	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017025	TTTTA	2	10	146289	146298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017025	TTAAT	2	10	152746	152755	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017025	ATTAA	2	10	160507	160516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017025	AGTTA	2	10	164794	164803	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017025	CAATT	2	10	178977	178986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017025	TAAAA	2	10	180875	180884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017025	TACGT	2	10	182344	182353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017025	CCAAA	2	10	182973	182982	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017025	ACCTG	2	10	187241	187250	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017025	CATAA	2	10	188296	188305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017025	TAAAA	2	10	201609	201618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017025	ATTTT	2	10	201792	201801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017025	GTTTA	2	10	221488	221497	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017025	CAATA	2	10	225536	225545	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017025	AATAA	2	10	227957	227966	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017025	TAAAA	2	10	230847	230856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017025	TAATA	2	10	231985	231994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017025	ATTAA	2	10	244590	244599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017025	ATTTA	2	10	257173	257182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017025	AGATT	2	10	273721	273730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017025	AGTTA	2	10	298401	298410	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017025	TATTT	2	10	302367	302376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017025	TTATT	2	10	302594	302603	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017025	AGTAG	2	10	306199	306208	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017025	TTCGT	2	10	306655	306664	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017025	AGTTA	2	10	313193	313202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017025	ATTTT	2	10	313284	313293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017025	TTGAA	2	10	319106	319115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017025	AAAAT	2	10	319956	319965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017025	AACGG	2	10	323806	323815	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017025	ATTAG	2	10	327078	327087	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017025	CTTTT	2	10	327180	327189	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017025	TAAAA	2	10	327917	327926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017025	TTGTA	2	10	329317	329326	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017025	TTTTC	2	10	329518	329527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017025	CGTTT	2	10	332440	332449	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017025	TGTAA	2	10	343625	343634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017025	TATAT	2	10	375321	375330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017025	CAATT	2	10	389519	389528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017025	TATAA	2	10	401601	401610	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017025	TAAAA	2	10	411056	411065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017025	CTAAA	2	10	427471	427480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017025	ATTAA	2	10	431178	431187	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017025	ATTTA	2	10	442179	442188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017025	TTAAT	2	10	466031	466040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017025	AATTT	2	10	499821	499830	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017025	AAATT	2	10	502135	502144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017025	ATCAA	2	10	518794	518803	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017025	ATTAA	2	10	539679	539688	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017025	ACTAT	2	10	562808	562817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017025	AATTT	2	10	589628	589637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017025	GTTTG	2	10	592443	592452	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017025	AAATG	2	10	592588	592597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017025	ATAAA	2	10	592705	592714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017025	AACAA	2	10	617018	617027	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017025	CAGTT	2	10	617029	617038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017025	ATTTG	2	10	627081	627090	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017025	GGTTT	2	10	628506	628515	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017025	CAAAC	2	10	630367	630376	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_017025	TAAAG	2	10	655569	655578	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017025	GAGTT	2	10	657346	657355	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017025	AAAAT	2	10	657405	657414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017025	TTTGT	2	10	660970	660979	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017025	TTAAA	2	10	664903	664912	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017025	TGGTA	2	10	698555	698564	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017025	TGTAG	2	10	698976	698985	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017025	CTGAA	2	10	700449	700458	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017025	CCGTA	2	10	701906	701915	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017025	ATTGA	2	10	702158	702167	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017025	GTCTC	2	10	703745	703754	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017025	TAAAA	2	10	718360	718369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017025	ACAAA	2	10	726168	726177	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017025	TTTTC	2	10	732801	732810	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017025	ATAGT	2	10	737355	737364	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017025	AGATT	2	10	754131	754140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017025	AGATT	2	10	754232	754241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017025	AGATT	2	10	754333	754342	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017025	AGATT	2	10	754435	754444	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017025	AGATT	2	10	754537	754546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017025	AGATT	2	10	754639	754648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017025	AGATT	2	10	754741	754750	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017025	AGATT	2	10	754843	754852	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017025	GTTTT	2	10	809107	809116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017025	TATTT	2	10	815439	815448	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017025	TAAAA	2	10	819276	819285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017025	TTAAT	2	10	834033	834042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017025	AAGAA	2	10	838112	838121	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017025	AGAAT	2	10	852854	852863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017025	AAAAT	2	10	854254	854263	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017025	ACTTA	2	10	864682	864691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017025	TGGTA	2	10	868597	868606	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017025	TGTAG	2	10	869018	869027	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017025	CTGAA	2	10	870491	870500	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017025	CCGTA	2	10	871948	871957	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017025	ATTGA	2	10	872200	872209	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017025	GTCTC	2	10	873600	873609	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017025	GTCTC	2	10	873797	873806	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017025	GTCTC	2	10	873983	873992	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017025	ATCTT	2	10	885422	885431	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017025	TTTTA	2	10	888948	888957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017025	TAAAA	2	10	920882	920891	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017025	ATTTT	2	10	942920	942929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017025	AAATA	2	10	952599	952608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017025	ATTCT	2	10	953659	953668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017025	TTGTA	2	10	962168	962177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017025	AACTT	2	10	962196	962205	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017025	ATTTT	2	10	968161	968170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017025	AGATT	2	10	968197	968206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017025	TTTCA	2	10	968926	968935	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017025	TCAAT	2	10	968962	968971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017025	ATAAA	2	10	992478	992487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017025	TGGTA	2	10	1009905	1009914	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017025	TGTAG	2	10	1010326	1010335	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017025	CTGAA	2	10	1011799	1011808	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017025	CCGTA	2	10	1013256	1013265	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017025	ATTGA	2	10	1013508	1013517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017025	GTCTC	2	10	1014908	1014917	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017025	TAATC	2	10	1015203	1015212	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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430	NC_017025	TTTCA	2	10	2945702	2945711	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
431	NC_017025	TAAAA	2	10	2970598	2970607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_017025	AAAAT	2	10	2991168	2991177	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.