MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 plasmid AUS0004_p3

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017024	AAC	2	6	66	71	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315277
2	NC_017024	GTT	2	6	223	228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315277
3	NC_017024	ATT	2	6	306	311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315277
4	NC_017024	TTA	2	6	509	514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315277
5	NC_017024	ACA	2	6	626	631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315277
6	NC_017024	GTG	2	6	684	689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315277
7	NC_017024	CTG	2	6	785	790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383315277
8	NC_017024	ATG	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315277
9	NC_017024	AAC	2	6	828	833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315277
10	NC_017024	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315277
11	NC_017024	ATG	2	6	911	916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315277
12	NC_017024	AGG	2	6	1010	1015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315277
13	NC_017024	GTT	2	6	1092	1097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315278
14	NC_017024	ATA	2	6	1165	1170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315278
15	NC_017024	ATT	2	6	1185	1190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315278
16	NC_017024	AGT	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315278
17	NC_017024	TGA	2	6	1290	1295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315279
18	NC_017024	TGG	2	6	1328	1333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315279
19	NC_017024	ATT	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315279
20	NC_017024	ATG	2	6	1474	1479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315279
21	NC_017024	TTC	2	6	1518	1523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315279
22	NC_017024	AGA	2	6	1566	1571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315279
23	NC_017024	AAG	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315280
24	NC_017024	TGA	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315280
25	NC_017024	GGT	2	6	1841	1846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315280
26	NC_017024	TGA	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315280
27	NC_017024	ATT	2	6	2044	2049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017024	TTA	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383315281
29	NC_017024	AGG	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383315281
30	NC_017024	GAA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315281
31	NC_017024	ATA	2	6	2314	2319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315281
32	NC_017024	GAT	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383315281
33	NC_017024	TTC	2	6	2603	2608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383315281
34	NC_017024	ACA	2	6	2624	2629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315281
35	NC_017024	AGC	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315281
36	NC_017024	TAA	2	6	2819	2824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315281
37	NC_017024	CAA	2	6	2835	2840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315281
38	NC_017024	AAT	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383315281
39	NC_017024	AAG	2	6	2896	2901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315281
40	NC_017024	CAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315281
41	NC_017024	TGG	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383315281
42	NC_017024	GAA	2	6	3135	3140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383315281
43	NC_017024	CAA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383315281
44	NC_017024	GTT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383315281
45	NC_017024	CAG	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383315281
46	NC_017024	TAT	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017024	ACT	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017024	TTC	2	6	4024	4029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017024	GGA	2	6	4109	4114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.