MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 chromosome

Total Repeats: 1064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017022	TTTGAC	2	12	1655	1666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383327322
2	NC_017022	TGACGG	2	12	6546	6557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383327326
3	NC_017022	GAAAAA	2	12	7312	7323	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327326
4	NC_017022	GAAGAT	2	12	7693	7704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327326
5	NC_017022	AAAAGG	2	12	14539	14550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327336
6	NC_017022	AAAGAT	2	12	21198	21209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327341
7	NC_017022	AAAATG	2	12	21669	21680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017022	TTTTGA	2	12	24130	24141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327343
9	NC_017022	ATCGAT	2	12	26765	26776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327345
10	NC_017022	TGTGAG	2	12	27112	27123	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383327345
11	NC_017022	TTTTAG	2	12	29165	29176	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327348
12	NC_017022	ATAAAA	2	12	30080	30091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017022	ATTACC	2	12	33544	33555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327352
14	NC_017022	AGATGG	2	12	40391	40402	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383327360
15	NC_017022	CATTTT	2	12	40641	40652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383327361
16	NC_017022	GACTTA	2	12	46990	47001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327364
17	NC_017022	AATCTA	2	12	47326	47337	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383327364
18	NC_017022	GAAAAC	2	12	49921	49932	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327366
19	NC_017022	TGATAT	2	12	50262	50273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017022	AAGGAC	2	12	51763	51774	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383327369
21	NC_017022	GTGATT	2	12	57278	57289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383327376
22	NC_017022	ACAAAA	2	12	61053	61064	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383327380
23	NC_017022	AAGACA	2	12	64598	64609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327382
24	NC_017022	AGAAAA	2	12	69553	69564	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327387
25	NC_017022	GACCAG	2	12	74840	74851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327393
26	NC_017022	GCAATG	2	12	81217	81228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327398
27	NC_017022	TCATGG	2	12	85903	85914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383327403
28	NC_017022	AATAAA	2	12	86798	86809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017022	GGAATG	2	12	89039	89050	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383327406
30	NC_017022	TTAATT	2	12	92842	92853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327410
31	NC_017022	ACAAGA	2	12	93654	93665	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327412
32	NC_017022	AGTTGA	2	12	93759	93770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327412
33	NC_017022	AACGTG	2	12	94532	94543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327412
34	NC_017022	GAAGTT	2	12	96475	96486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327413
35	NC_017022	TAAAAC	2	12	97652	97663	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383327414
36	NC_017022	TAAAGT	2	12	102877	102888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383327426
37	NC_017022	TAAAGG	2	12	104872	104883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327430
38	NC_017022	AATAAA	2	12	105075	105086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017022	TTAGGT	2	12	111005	111016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383327441
40	NC_017022	CGGATA	2	12	112746	112757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327444
41	NC_017022	TCGCAA	2	12	125262	125273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383327454
42	NC_017022	CAACGT	2	12	126242	126253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383327455
43	NC_017022	CCAAAA	2	12	126610	126621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327455
44	NC_017022	ATCCAA	2	12	130124	130135	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383327458
45	NC_017022	CAAGAA	2	12	132262	132273	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327460
46	NC_017022	TGAAAA	2	12	133128	133139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327460
47	NC_017022	ATGCAT	2	12	139252	139263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327463
48	NC_017022	TTTTTC	2	12	139466	139477	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383327464
49	NC_017022	CTTGTT	2	12	141008	141019	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327466
50	NC_017022	ATTGTT	2	12	142492	142503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327467
51	NC_017022	AATCAA	2	12	145172	145183	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383327471
52	NC_017022	TAATTA	2	12	146440	146451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017022	AAATGA	2	12	147350	147361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327473
54	NC_017022	GCTGTC	2	12	148590	148601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327474
55	NC_017022	TATTGA	2	12	149135	149146	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383327474
56	NC_017022	GAAGTA	2	12	149939	149950	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327475
57	NC_017022	AAATGA	2	12	150595	150606	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327475
58	NC_017022	GTTTTC	2	12	154588	154599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327480
59	NC_017022	CTCTTT	2	12	158290	158301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327485
60	NC_017022	CAAAAA	2	12	158856	158867	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383327485
61	NC_017022	GTTTTT	2	12	161966	161977	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383327490
62	NC_017022	AGTTTT	2	12	163280	163291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327492
63	NC_017022	TACACA	2	12	165629	165640	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383327494
64	NC_017022	AAATCG	2	12	170003	170014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383327497
65	NC_017022	GGCTGA	2	12	171333	171344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383327498
66	NC_017022	AGCACA	2	12	174387	174398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383327500
67	NC_017022	AAATGA	2	12	183082	183093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327510
68	NC_017022	AGCAAA	2	12	183476	183487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327510
69	NC_017022	TTGATA	2	12	185264	185275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383327512
70	NC_017022	TTTTGC	2	12	186184	186195	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327512
71	NC_017022	GAAAAA	2	12	188403	188414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327516
72	NC_017022	ATGAAG	2	12	192134	192145	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327520
73	NC_017022	ATCGAT	2	12	193045	193056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327520
74	NC_017022	TTTTAT	2	12	199878	199889	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017022	CGTATA	2	12	218682	218693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017022	GATCAT	2	12	218999	219010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327544
77	NC_017022	GAAAAA	2	12	223743	223754	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327545
78	NC_017022	ATTTTG	2	12	224191	224202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017022	AGATAC	2	12	225775	225786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383327548
80	NC_017022	AGGATG	2	12	226133	226144	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017022	AACAGA	2	12	226832	226843	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327550
82	NC_017022	TCCGCT	2	12	229881	229892	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383327553
83	NC_017022	TTTTGA	2	12	230210	230221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327554
84	NC_017022	GCGGCT	2	12	232611	232622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383327555
85	NC_017022	TGCTAA	2	12	234737	234748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327556
86	NC_017022	AGAAAA	2	12	237507	237518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327559
87	NC_017022	ATGGCA	2	12	237634	237645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327559
88	NC_017022	GCAGAT	2	12	241538	241549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327561
89	NC_017022	AGAGGC	2	12	251531	251542	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383327571
90	NC_017022	CAGAAG	2	12	254692	254703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383327574
91	NC_017022	TTCTTG	2	12	258590	258601	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327578
92	NC_017022	TTTTGT	2	12	260217	260228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383327580
93	NC_017022	GTGATT	2	12	260357	260368	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383327580
94	NC_017022	AACAGA	2	12	261683	261694	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327581
95	NC_017022	AGAAAG	2	12	267271	267282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327588
96	NC_017022	TGTAGG	2	12	268216	268227	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383327588
97	NC_017022	TGGACC	2	12	272667	272678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383327594
98	NC_017022	TTTCCT	2	12	274765	274776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327595
99	NC_017022	ATTTTG	2	12	278630	278641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327601
100	NC_017022	CAATCG	2	12	279283	279294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383327601
101	NC_017022	AAAAGA	2	12	280499	280510	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327602
102	NC_017022	ATTGCG	2	12	280919	280930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383327603
103	NC_017022	TAGGTG	2	12	283999	284010	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383327606
104	NC_017022	ATATTT	2	12	290393	290404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327611
105	NC_017022	AATATT	2	12	290578	290589	50 %	50 %	0 %	0 %	383327611
106	NC_017022	TAATAG	2	12	291691	291702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383327613
107	NC_017022	TTCAAT	2	12	292178	292189	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383327614
108	NC_017022	ATTTTG	2	12	296646	296657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327619
109	NC_017022	GTTTTC	2	12	303644	303655	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327629
110	NC_017022	TAAAAA	2	12	307120	307131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383327631
111	NC_017022	CTGTAT	2	12	307188	307199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383327631
112	NC_017022	ATAAAA	2	12	311996	312007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383327636
113	NC_017022	GTTTTT	2	12	312853	312864	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017022	GAAGCG	2	12	326897	326908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383327650
115	NC_017022	AATGAC	2	12	327862	327873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383327651
116	NC_017022	GAAAAA	2	12	331117	331128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017022	TCTATT	2	12	334894	334905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383327658
118	NC_017022	AAAACA	2	12	336051	336062	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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234	NC_017022	CTTGTT	2	12	667512	667523	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327955
235	NC_017022	ACGTTC	2	12	674546	674557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383327963
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350	NC_017022	ATCCGA	2	12	1000167	1000178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
351	NC_017022	CGTTTT	2	12	1001789	1001800	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383328301
352	NC_017022	TCTTTT	2	12	1003933	1003944	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383328303
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454	NC_017022	CAGCGA	2	12	1270178	1270189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383328557
455	NC_017022	TGCTTT	2	12	1270800	1270811	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383328558
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457	NC_017022	TACGGC	3	18	1277233	1277250	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383328561
458	NC_017022	CAAAAG	2	12	1279002	1279013	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383328562
459	NC_017022	TAGGCA	2	12	1290480	1290491	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383328574
460	NC_017022	AAAAGG	2	12	1293935	1293946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383328578
461	NC_017022	TTTGAT	2	12	1294585	1294596	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017022	GTAGCA	2	12	1296274	1296285	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383328580
463	NC_017022	GTTTTC	2	12	1297671	1297682	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383328581
464	NC_017022	TACCCT	2	12	1301176	1301187	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_017022	GTCCAT	2	12	1301374	1301385	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383328586
466	NC_017022	ATGAGT	2	12	1301600	1301611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383328586
467	NC_017022	ATTTTA	2	12	1308987	1308998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_017022	AAATTT	2	12	1309324	1309335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017022	TGATCA	2	12	1312089	1312100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383328597
470	NC_017022	AATCAA	2	12	1313161	1313172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383328597
471	NC_017022	AGTATG	2	12	1317198	1317209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383328601
472	NC_017022	CATAAA	2	12	1327195	1327206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383328603
473	NC_017022	CACGTT	2	12	1327732	1327743	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383328604
474	NC_017022	ACTATC	2	12	1352310	1352321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
475	NC_017022	GAAACA	2	12	1352781	1352792	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383328622
476	NC_017022	TGAAAC	2	12	1352906	1352917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383328622
477	NC_017022	GGATCA	2	12	1356262	1356273	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383328624
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481	NC_017022	TTGCTT	2	12	1366631	1366642	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383328638
482	NC_017022	TTTTTA	2	12	1369621	1369632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017022	TAATTA	2	12	1371650	1371661	50 %	50 %	0 %	0 %	383328644
484	NC_017022	CTTCAA	2	12	1372354	1372365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
485	NC_017022	CGATAT	2	12	1372417	1372428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383328645
486	NC_017022	GCTTTT	2	12	1373482	1373493	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383328646
487	NC_017022	TCTAGT	2	12	1374644	1374655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383328647
488	NC_017022	TTTTTA	2	12	1378431	1378442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_017022	ATTTGG	2	12	1378754	1378765	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383328651
490	NC_017022	AAAAGA	2	12	1379867	1379878	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383328651
491	NC_017022	TTTTCA	2	12	1381546	1381557	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383328653
492	NC_017022	GCCTTT	2	12	1389745	1389756	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383328660
493	NC_017022	CATAAC	2	12	1392959	1392970	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383328664
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496	NC_017022	ACAAAA	2	12	1400536	1400547	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
497	NC_017022	AAATGT	2	12	1403798	1403809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
498	NC_017022	AGGTCC	2	12	1404005	1404016	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383328677
499	NC_017022	GGCTAT	2	12	1405507	1405518	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383328678
500	NC_017022	CACTTT	2	12	1406792	1406803	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383328679

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