MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017022	AAAATG	2	12	21669	21680	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017022	ATAAAA	2	12	30080	30091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017022	TGATAT	2	12	50262	50273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017022	AATAAA	2	12	86798	86809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017022	AATAAA	2	12	105075	105086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017022	TAATTA	2	12	146440	146451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017022	TTTTAT	2	12	199878	199889	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017022	CGTATA	2	12	218682	218693	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017022	ATTTTG	2	12	224191	224202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017022	AGGATG	2	12	226133	226144	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017022	GTTTTT	2	12	312853	312864	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017022	GAAAAA	2	12	331117	331128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017022	AAAACA	2	12	336051	336062	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017022	TGCTTC	2	12	411390	411401	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017022	TCCTTT	2	12	448891	448902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017022	AAAAAG	2	12	449179	449190	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017022	CATTTT	2	12	467634	467645	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017022	ACTTAA	2	12	499959	499970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017022	ATTTAG	2	12	525264	525275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017022	CAAGAA	2	12	526008	526019	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017022	CATTCT	2	12	527164	527175	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017022	TAAAAT	2	12	531818	531829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017022	GAAAAA	2	12	592027	592038	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017022	CAAGAC	2	12	592615	592626	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017022	GTATTT	2	12	621036	621047	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017022	AAAATG	2	12	623432	623443	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017022	TTAGTA	2	12	623522	623533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017022	TAGTAA	2	12	629833	629844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017022	CATTTT	2	12	647270	647281	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017022	TTTTTA	2	12	651483	651494	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017022	TAAAAA	2	12	666192	666203	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017022	AAAATG	2	12	688136	688147	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017022	ATAGTT	2	12	715484	715495	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017022	GAAAAA	2	12	726311	726322	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017022	ATTTTC	2	12	728302	728313	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017022	ATTCTT	2	12	768548	768559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017022	CTCTTT	2	12	827211	827222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017022	TATTAC	2	12	830438	830449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017022	TAAAAA	2	12	864987	864998	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017022	TTTCTT	2	12	905147	905158	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017022	CATTCT	2	12	965313	965324	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017022	AAAGAA	2	12	994985	994996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017022	CTATTA	2	12	999483	999494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017022	ATCCGA	2	12	1000167	1000178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017022	CGAAAA	2	12	1029928	1029939	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017022	CATTTT	2	12	1070303	1070314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017022	TATCTT	2	12	1070772	1070783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017022	GTTTTC	2	12	1075233	1075244	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017022	AGTTTA	2	12	1080900	1080911	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017022	TTTTTA	2	12	1099245	1099256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017022	TGGTAC	2	12	1101430	1101441	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017022	AAAATG	2	12	1143548	1143559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017022	TTATTT	2	12	1149290	1149301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017022	AACAAA	2	12	1176939	1176950	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017022	AAGTGA	2	12	1214504	1214515	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017022	AAATAA	2	12	1216546	1216557	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017022	TTATTT	2	12	1233398	1233409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017022	TCTTTT	2	12	1234092	1234103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017022	TAGAGT	2	12	1246321	1246332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017022	TGCTTC	2	12	1266864	1266875	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017022	TTTGAT	2	12	1294585	1294596	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017022	TACCCT	2	12	1301176	1301187	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017022	ATTTTA	2	12	1308987	1308998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017022	AAATTT	2	12	1309324	1309335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017022	ACTATC	2	12	1352310	1352321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017022	TTTTTA	2	12	1369621	1369632	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017022	CTTCAA	2	12	1372354	1372365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017022	TTTTTA	2	12	1378431	1378442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017022	ACAAAA	2	12	1400536	1400547	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017022	AAATGT	2	12	1403798	1403809	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017022	AAAGAG	2	12	1491562	1491573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017022	CATTTT	2	12	1510113	1510124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017022	AAATGA	2	12	1530175	1530186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017022	AAACTC	2	12	1532502	1532513	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017022	TTTGAT	2	12	1535605	1535616	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017022	TAAAAA	2	12	1574788	1574799	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017022	AAAAAG	2	12	1581639	1581650	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017022	CTGCTC	2	12	1637521	1637532	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017022	AAAACT	2	12	1681589	1681600	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017022	AAAAAG	2	12	1683904	1683915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017022	TTTTCT	2	12	1708882	1708893	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017022	CAAACT	2	12	1738274	1738285	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017022	TATTTT	2	12	1748246	1748257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017022	TCTTTT	2	12	1784144	1784155	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017022	TTTATT	2	12	1800801	1800812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017022	TATTCA	2	12	1815264	1815275	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017022	AGAACA	2	12	1833970	1833981	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017022	AAAAGT	2	12	1881109	1881120	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017022	AATTTT	2	12	1893572	1893583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017022	ACAAAT	2	12	1915078	1915089	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017022	TTTGAT	2	12	1919794	1919805	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017022	ATAAAA	2	12	1922705	1922716	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017022	TCACTA	2	12	1928042	1928053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017022	ATAAAA	2	12	1984363	1984374	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017022	AAAATT	2	12	1993942	1993953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017022	TGCTTC	2	12	2069109	2069120	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017022	TGATTC	2	12	2076388	2076399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017022	AAAAGC	2	12	2089348	2089359	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017022	AAAAGG	2	12	2113243	2113254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017022	GTCTTT	2	12	2166595	2166606	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017022	TTTGAT	2	12	2196321	2196332	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017022	ACAAGA	2	12	2234191	2234202	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017022	TCTTGC	2	12	2234213	2234224	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017022	ATCCTT	2	12	2241471	2241482	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017022	AAGAAA	2	12	2243471	2243482	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017022	TTTCTT	2	12	2243497	2243508	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017022	TTATTT	2	12	2243698	2243709	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017022	TTTCGA	2	12	2255636	2255647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017022	TAAGAA	2	12	2347460	2347471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017022	CATTCT	2	12	2370647	2370658	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017022	AAAACA	2	12	2391882	2391893	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017022	GAAGCA	2	12	2399346	2399357	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017022	ACATAA	2	12	2465847	2465858	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017022	TGTTTT	2	12	2490740	2490751	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017022	GAAATA	2	12	2502843	2502854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017022	TCGGGT	2	12	2531043	2531054	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017022	AGAAAC	2	12	2572240	2572251	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017022	AAATAC	2	12	2573541	2573552	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017022	TAAAAA	2	12	2575915	2575926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017022	AGTAAC	2	12	2581452	2581463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017022	TTTTAT	2	12	2614950	2614961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017022	AATAAC	2	12	2622680	2622691	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017022	TTTATT	2	12	2632396	2632407	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017022	CTACGT	2	12	2634918	2634929	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017022	AAAAAG	2	12	2645755	2645766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017022	TAAAAA	2	12	2674967	2674978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017022	AATAAA	2	12	2715968	2715979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017022	TTTGAT	2	12	2727193	2727204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017022	ATTTTT	2	12	2746272	2746283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017022	TAAATA	2	12	2749184	2749195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017022	ATTTAT	2	12	2765624	2765635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017022	ATTTTT	2	12	2766528	2766539	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017022	TAAAAG	2	12	2807502	2807513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017022	TTCTTT	2	12	2820137	2820148	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017022	TTATAA	2	12	2823293	2823304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017022	CTTTTT	2	12	2824702	2824713	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017022	AATCGT	2	12	2833217	2833228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017022	AATGAT	2	12	2879227	2879238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017022	AAAGTA	2	12	2908100	2908111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017022	ATTTCT	2	12	2923775	2923786	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017022	ATGTTC	2	12	2937575	2937586	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.