MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecium Aus0004 chromosome

Total Repeats: 923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017022	TTTGAC	2	12	1655	1666	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383327322
2	NC_017022	TGACGG	2	12	6546	6557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383327326
3	NC_017022	GAAAAA	2	12	7312	7323	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327326
4	NC_017022	GAAGAT	2	12	7693	7704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327326
5	NC_017022	AAAAGG	2	12	14539	14550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327336
6	NC_017022	AAAGAT	2	12	21198	21209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327341
7	NC_017022	TTTTGA	2	12	24130	24141	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327343
8	NC_017022	ATCGAT	2	12	26765	26776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327345
9	NC_017022	TGTGAG	2	12	27112	27123	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383327345
10	NC_017022	TTTTAG	2	12	29165	29176	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327348
11	NC_017022	ATTACC	2	12	33544	33555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327352
12	NC_017022	AGATGG	2	12	40391	40402	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383327360
13	NC_017022	CATTTT	2	12	40641	40652	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383327361
14	NC_017022	GACTTA	2	12	46990	47001	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327364
15	NC_017022	AATCTA	2	12	47326	47337	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383327364
16	NC_017022	GAAAAC	2	12	49921	49932	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327366
17	NC_017022	AAGGAC	2	12	51763	51774	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383327369
18	NC_017022	GTGATT	2	12	57278	57289	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383327376
19	NC_017022	ACAAAA	2	12	61053	61064	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383327380
20	NC_017022	AAGACA	2	12	64598	64609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327382
21	NC_017022	AGAAAA	2	12	69553	69564	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327387
22	NC_017022	GACCAG	2	12	74840	74851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327393
23	NC_017022	GCAATG	2	12	81217	81228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327398
24	NC_017022	TCATGG	2	12	85903	85914	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383327403
25	NC_017022	GGAATG	2	12	89039	89050	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383327406
26	NC_017022	TTAATT	2	12	92842	92853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327410
27	NC_017022	ACAAGA	2	12	93654	93665	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327412
28	NC_017022	AGTTGA	2	12	93759	93770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327412
29	NC_017022	AACGTG	2	12	94532	94543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327412
30	NC_017022	GAAGTT	2	12	96475	96486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327413
31	NC_017022	TAAAAC	2	12	97652	97663	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383327414
32	NC_017022	TAAAGT	2	12	102877	102888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383327426
33	NC_017022	TAAAGG	2	12	104872	104883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327430
34	NC_017022	TTAGGT	2	12	111005	111016	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383327441
35	NC_017022	CGGATA	2	12	112746	112757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327444
36	NC_017022	TCGCAA	2	12	125262	125273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383327454
37	NC_017022	CAACGT	2	12	126242	126253	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383327455
38	NC_017022	CCAAAA	2	12	126610	126621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327455
39	NC_017022	ATCCAA	2	12	130124	130135	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383327458
40	NC_017022	CAAGAA	2	12	132262	132273	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327460
41	NC_017022	TGAAAA	2	12	133128	133139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327460
42	NC_017022	ATGCAT	2	12	139252	139263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327463
43	NC_017022	TTTTTC	2	12	139466	139477	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383327464
44	NC_017022	CTTGTT	2	12	141008	141019	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327466
45	NC_017022	ATTGTT	2	12	142492	142503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327467
46	NC_017022	AATCAA	2	12	145172	145183	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383327471
47	NC_017022	AAATGA	2	12	147350	147361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327473
48	NC_017022	GCTGTC	2	12	148590	148601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327474
49	NC_017022	TATTGA	2	12	149135	149146	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383327474
50	NC_017022	GAAGTA	2	12	149939	149950	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327475
51	NC_017022	AAATGA	2	12	150595	150606	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327475
52	NC_017022	GTTTTC	2	12	154588	154599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327480
53	NC_017022	CTCTTT	2	12	158290	158301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327485
54	NC_017022	CAAAAA	2	12	158856	158867	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383327485
55	NC_017022	GTTTTT	2	12	161966	161977	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383327490
56	NC_017022	AGTTTT	2	12	163280	163291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327492
57	NC_017022	TACACA	2	12	165629	165640	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383327494
58	NC_017022	AAATCG	2	12	170003	170014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383327497
59	NC_017022	GGCTGA	2	12	171333	171344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383327498
60	NC_017022	AGCACA	2	12	174387	174398	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383327500
61	NC_017022	AAATGA	2	12	183082	183093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327510
62	NC_017022	AGCAAA	2	12	183476	183487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327510
63	NC_017022	TTGATA	2	12	185264	185275	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383327512
64	NC_017022	TTTTGC	2	12	186184	186195	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327512
65	NC_017022	GAAAAA	2	12	188403	188414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327516
66	NC_017022	ATGAAG	2	12	192134	192145	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327520
67	NC_017022	ATCGAT	2	12	193045	193056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327520
68	NC_017022	GATCAT	2	12	218999	219010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327544
69	NC_017022	GAAAAA	2	12	223743	223754	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327545
70	NC_017022	AGATAC	2	12	225775	225786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383327548
71	NC_017022	AACAGA	2	12	226832	226843	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327550
72	NC_017022	TCCGCT	2	12	229881	229892	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383327553
73	NC_017022	TTTTGA	2	12	230210	230221	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327554
74	NC_017022	GCGGCT	2	12	232611	232622	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383327555
75	NC_017022	TGCTAA	2	12	234737	234748	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327556
76	NC_017022	AGAAAA	2	12	237507	237518	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327559
77	NC_017022	ATGGCA	2	12	237634	237645	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327559
78	NC_017022	GCAGAT	2	12	241538	241549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383327561
79	NC_017022	AGAGGC	2	12	251531	251542	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383327571
80	NC_017022	CAGAAG	2	12	254692	254703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383327574
81	NC_017022	TTCTTG	2	12	258590	258601	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327578
82	NC_017022	TTTTGT	2	12	260217	260228	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383327580
83	NC_017022	GTGATT	2	12	260357	260368	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383327580
84	NC_017022	AACAGA	2	12	261683	261694	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383327581
85	NC_017022	AGAAAG	2	12	267271	267282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327588
86	NC_017022	TGTAGG	2	12	268216	268227	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383327588
87	NC_017022	TGGACC	2	12	272667	272678	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383327594
88	NC_017022	TTTCCT	2	12	274765	274776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327595
89	NC_017022	ATTTTG	2	12	278630	278641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327601
90	NC_017022	CAATCG	2	12	279283	279294	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383327601
91	NC_017022	AAAAGA	2	12	280499	280510	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327602
92	NC_017022	ATTGCG	2	12	280919	280930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383327603
93	NC_017022	TAGGTG	2	12	283999	284010	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383327606
94	NC_017022	ATATTT	2	12	290393	290404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327611
95	NC_017022	AATATT	2	12	290578	290589	50 %	50 %	0 %	0 %	383327611
96	NC_017022	TAATAG	2	12	291691	291702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383327613
97	NC_017022	TTCAAT	2	12	292178	292189	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383327614
98	NC_017022	ATTTTG	2	12	296646	296657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327619
99	NC_017022	GTTTTC	2	12	303644	303655	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383327629
100	NC_017022	TAAAAA	2	12	307120	307131	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383327631
101	NC_017022	CTGTAT	2	12	307188	307199	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383327631
102	NC_017022	ATAAAA	2	12	311996	312007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383327636
103	NC_017022	GAAGCG	2	12	326897	326908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383327650
104	NC_017022	AATGAC	2	12	327862	327873	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383327651
105	NC_017022	TCTATT	2	12	334894	334905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383327658
106	NC_017022	GATGGT	2	12	336384	336395	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383327659
107	NC_017022	GAAAAA	2	12	337513	337524	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327659
108	NC_017022	TAGAAA	2	12	341459	341470	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327661
109	NC_017022	ATTTCT	2	12	341879	341890	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383327662
110	NC_017022	TGATTT	2	12	349871	349882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383327669
111	NC_017022	GGAAAA	2	12	353633	353644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327674
112	NC_017022	AGAATT	2	12	362356	362367	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383327684
113	NC_017022	TCTTGA	2	12	364208	364219	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383327686
114	NC_017022	TTTATC	2	12	371039	371050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383327690
115	NC_017022	AAAAGA	2	12	373982	373993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383327692
116	NC_017022	ATCGTT	2	12	374957	374968	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383327693
117	NC_017022	GAAGAT	2	12	375702	375713	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383327694
118	NC_017022	AATGAA	2	12	399183	399194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383327716
119	NC_017022	AACAAA	2	12	400269	400280	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383327717
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121	NC_017022	CAGAAG	2	12	405339	405350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383327721
122	NC_017022	CTTGAA	2	12	408794	408805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383327723
123	NC_017022	AAACGG	2	12	409592	409603	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383327723
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125	NC_017022	ATCCAA	2	12	414576	414587	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383327728
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140	NC_017022	TTCTGG	2	12	442926	442937	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383327755
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225	NC_017022	CAAGAA	2	12	745132	745143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383328029
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227	NC_017022	AGTAGA	2	12	747159	747170	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383328033
228	NC_017022	TTTTGG	2	12	752184	752195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383328039
229	NC_017022	TTTTGC	2	12	753854	753865	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383328040
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231	NC_017022	AGCAGA	2	12	757551	757562	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383328042
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345	NC_017022	TCCGAT	2	12	1111639	1111650	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383328407
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456	NC_017022	TTCTTT	2	12	1477092	1477103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383328749
457	NC_017022	ATATCA	2	12	1477741	1477752	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383328749
458	NC_017022	TTACCA	2	12	1477816	1477827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383328749
459	NC_017022	ATCTAA	2	12	1478930	1478941	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383328752
460	NC_017022	CTCCTG	2	12	1483121	1483132	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383328761
461	NC_017022	ATAAAA	2	12	1487906	1487917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383328772
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463	NC_017022	TCAGCT	2	12	1488414	1488425	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383328773
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