MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_3

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017021	ATC	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327285
2	NC_017021	CAA	3	9	154	162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327285
3	NC_017021	GAA	2	6	165	170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327285
4	NC_017021	AGC	2	6	223	228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327285
5	NC_017021	AAC	2	6	245	250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327285
6	NC_017021	CAA	2	6	314	319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327285
7	NC_017021	TGG	2	6	336	341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383327285
8	NC_017021	GGA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383327286
9	NC_017021	AGA	2	6	429	434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
10	NC_017021	TCA	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327286
11	NC_017021	AGT	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327286
12	NC_017021	ACA	2	6	556	561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327286
13	NC_017021	GAA	2	6	664	669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
14	NC_017021	AGA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
15	NC_017021	TAG	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327286
16	NC_017021	CAA	2	6	777	782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327286
17	NC_017021	GCA	3	9	791	799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327286
18	NC_017021	AGA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
19	NC_017021	AGC	2	6	889	894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327286
20	NC_017021	GCC	2	6	939	944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383327286
21	NC_017021	AGC	2	6	984	989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327286
22	NC_017021	ACT	2	6	1054	1059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327286
23	NC_017021	TGA	2	6	1083	1088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327286
24	NC_017021	AGA	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327286
25	NC_017021	CCA	2	6	1148	1153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383327286
26	NC_017021	GAG	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383327286
27	NC_017021	GCT	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327287
28	NC_017021	CTG	2	6	1533	1538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327287
29	NC_017021	TGA	2	6	1552	1557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
30	NC_017021	AGT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
31	NC_017021	AGT	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
32	NC_017021	CAA	2	6	1625	1630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327287
33	NC_017021	TAG	2	6	1657	1662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
34	NC_017021	AGT	2	6	1745	1750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327287
35	NC_017021	CAG	2	6	1890	1895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327287
36	NC_017021	AAG	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327287
37	NC_017021	AAT	2	6	2197	2202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327287
38	NC_017021	GCA	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327287
39	NC_017021	ATA	2	6	2716	2721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327288
40	NC_017021	TCT	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327288
41	NC_017021	CAG	2	6	2784	2789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327288
42	NC_017021	TGA	2	6	2861	2866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327288
43	NC_017021	ATG	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327288
44	NC_017021	CCA	2	6	3190	3195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383327289
45	NC_017021	TGC	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327289
46	NC_017021	ATA	2	6	3241	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327289
47	NC_017021	CAG	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327290
48	NC_017021	ATG	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327290
49	NC_017021	AAC	2	6	3443	3448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327290
50	NC_017021	ATG	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327290
51	NC_017021	TGC	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327291
52	NC_017021	AAG	2	6	3705	3710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327291
53	NC_017021	TAT	2	6	3993	3998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327292
54	NC_017021	AGG	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383327292
55	NC_017021	ATT	2	6	4286	4291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327293
56	NC_017021	TTG	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327293
57	NC_017021	CTT	3	9	4360	4368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327293
58	NC_017021	GAA	2	6	4598	4603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327293
59	NC_017021	TCA	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327293
60	NC_017021	TGA	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327293
61	NC_017021	ATC	2	6	4919	4924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327293
62	NC_017021	CAA	2	6	4978	4983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327293
63	NC_017021	CAT	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327293
64	NC_017021	ATT	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327293
65	NC_017021	TGT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327293
66	NC_017021	ATT	2	6	5165	5170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327293
67	NC_017021	TTC	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327293
68	NC_017021	CAG	2	6	6586	6591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327294
69	NC_017021	TGC	3	9	6592	6600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327294
70	NC_017021	TAT	2	6	6723	6728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327295
71	NC_017021	CTC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327295
72	NC_017021	CCT	2	6	6880	6885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327295
73	NC_017021	GCT	2	6	6907	6912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327295
74	NC_017021	AGC	2	6	7028	7033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327296
75	NC_017021	GTA	2	6	7114	7119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327296
76	NC_017021	CAA	2	6	7162	7167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327296
77	NC_017021	TAA	2	6	7213	7218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327296
78	NC_017021	TCA	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327296
79	NC_017021	ATT	2	6	7260	7265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327296
80	NC_017021	TGC	2	6	7361	7366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327297
81	NC_017021	CTG	2	6	7369	7374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327297
82	NC_017021	CTA	2	6	7387	7392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327297
83	NC_017021	TGC	3	9	7405	7413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327297
84	NC_017021	GTA	2	6	7595	7600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327298
85	NC_017021	TAT	2	6	7617	7622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327298
86	NC_017021	GCA	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327298
87	NC_017021	TTA	2	6	7742	7747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327298
88	NC_017021	ACT	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327298
89	NC_017021	CTA	2	6	7892	7897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327298
90	NC_017021	TGA	2	6	8287	8292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327299
91	NC_017021	AAG	3	9	8319	8327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327299
92	NC_017021	ATT	2	6	8357	8362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327299
93	NC_017021	TGC	2	6	8371	8376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327299
94	NC_017021	AAC	2	6	8592	8597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327299
95	NC_017021	TTA	2	6	8616	8621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327299
96	NC_017021	GAT	2	6	8733	8738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327299
97	NC_017021	ATT	2	6	9031	9036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327300
98	NC_017021	TAT	2	6	9045	9050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327300
99	NC_017021	TAA	2	6	9109	9114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327300
100	NC_017021	TCC	3	9	9142	9150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327300
101	NC_017021	CAT	2	6	9248	9253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327300
102	NC_017021	CAG	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327301
103	NC_017021	ACA	2	6	9975	9980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327302
104	NC_017021	ATA	2	6	10062	10067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327302
105	NC_017021	TAC	2	6	10127	10132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327302
106	NC_017021	AAT	2	6	10136	10141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327302
107	NC_017021	GAT	2	6	10148	10153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327302
108	NC_017021	TTA	2	6	10194	10199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327302
109	NC_017021	TAA	2	6	10276	10281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327302
110	NC_017021	ATT	2	6	10282	10287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327302
111	NC_017021	ATA	2	6	10311	10316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327302
112	NC_017021	GAT	2	6	10331	10336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327302
113	NC_017021	TGT	2	6	10360	10365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327302
114	NC_017021	ATA	2	6	10392	10397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327302
115	NC_017021	TTC	2	6	10399	10404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327302
116	NC_017021	ACA	2	6	10599	10604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327303
117	NC_017021	TGA	2	6	10629	10634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327303
118	NC_017021	TAA	2	6	10641	10646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327303
119	NC_017021	CTT	2	6	10647	10652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327303
120	NC_017021	CTT	2	6	10664	10669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327303
121	NC_017021	ATC	2	6	10742	10747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327303
122	NC_017021	ATA	2	6	10778	10783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327303
123	NC_017021	GAA	2	6	10927	10932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327303
124	NC_017021	ATA	2	6	11019	11024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327303
125	NC_017021	TAC	2	6	11041	11046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327304
126	NC_017021	TGC	2	6	11059	11064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327304
127	NC_017021	TCT	2	6	11068	11073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327304
128	NC_017021	CGG	2	6	11090	11095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383327304
129	NC_017021	TAA	2	6	11288	11293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327304
130	NC_017021	CAT	2	6	11327	11332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327304
131	NC_017021	CTT	2	6	11441	11446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327304
132	NC_017021	TAA	2	6	11457	11462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327304
133	NC_017021	TAC	2	6	11489	11494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327304
134	NC_017021	GCT	2	6	11570	11575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327304
135	NC_017021	AAT	2	6	11602	11607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327304
136	NC_017021	ATA	2	6	11917	11922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327305
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139	NC_017021	AAT	2	6	11981	11986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327305
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147	NC_017021	TAT	2	6	12293	12298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327305
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150	NC_017021	ATT	2	6	12347	12352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327305
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153	NC_017021	ATT	2	6	12815	12820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327305
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155	NC_017021	TAC	2	6	12943	12948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327305
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256	NC_017021	ATC	2	6	21463	21468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327318
257	NC_017021	TCC	2	6	21557	21562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327318
258	NC_017021	CAA	2	6	21585	21590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327318
259	NC_017021	TGC	2	6	21641	21646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327318
260	NC_017021	CTT	2	6	21658	21663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327318
261	NC_017021	TCA	2	6	21665	21670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327318
262	NC_017021	TAG	2	6	21675	21680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327318
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268	NC_017021	TAT	2	6	22074	22079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327319
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272	NC_017021	TTC	2	6	22194	22199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327319
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275	NC_017021	TAA	2	6	22376	22381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327319

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.