MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_3

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017021	TA	3	6	281	286	50 %	50 %	0 %	0 %	383327285
2	NC_017021	AG	3	6	385	390	50 %	0 %	50 %	0 %	383327285
3	NC_017021	AG	3	6	399	404	50 %	0 %	50 %	0 %	383327285
4	NC_017021	TA	3	6	438	443	50 %	50 %	0 %	0 %	383327286
5	NC_017021	AG	3	6	1065	1070	50 %	0 %	50 %	0 %	383327286
6	NC_017021	TA	3	6	1826	1831	50 %	50 %	0 %	0 %	383327287
7	NC_017021	GA	3	6	1930	1935	50 %	0 %	50 %	0 %	383327287
8	NC_017021	AG	3	6	2233	2238	50 %	0 %	50 %	0 %	383327287
9	NC_017021	GA	3	6	3262	3267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017021	AG	3	6	4247	4252	50 %	0 %	50 %	0 %	383327293
11	NC_017021	TC	4	8	4575	4582	0 %	50 %	0 %	50 %	383327293
12	NC_017021	AT	3	6	4842	4847	50 %	50 %	0 %	0 %	383327293
13	NC_017021	CT	3	6	5233	5238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017021	TG	3	6	6434	6439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017021	AT	3	6	8889	8894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017021	AG	3	6	9004	9009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017021	CA	3	6	9363	9368	50 %	0 %	0 %	50 %	383327301
18	NC_017021	TA	3	6	9941	9946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017021	TA	3	6	9969	9974	50 %	50 %	0 %	0 %	383327302
20	NC_017021	AT	3	6	10140	10145	50 %	50 %	0 %	0 %	383327302
21	NC_017021	CA	3	6	10606	10611	50 %	0 %	0 %	50 %	383327303
22	NC_017021	CA	3	6	10770	10775	50 %	0 %	0 %	50 %	383327303
23	NC_017021	TC	3	6	11238	11243	0 %	50 %	0 %	50 %	383327304
24	NC_017021	AT	3	6	11623	11628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017021	AT	3	6	11693	11698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017021	AT	3	6	11871	11876	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
27	NC_017021	AT	3	6	12027	12032	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
28	NC_017021	TA	4	8	12749	12756	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
29	NC_017021	TA	3	6	12856	12861	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
30	NC_017021	GT	3	6	13126	13131	0 %	50 %	50 %	0 %	383327305
31	NC_017021	AT	3	6	13302	13307	50 %	50 %	0 %	0 %	383327305
32	NC_017021	AT	3	6	13652	13657	50 %	50 %	0 %	0 %	383327306
33	NC_017021	CT	3	6	13680	13685	0 %	50 %	0 %	50 %	383327306
34	NC_017021	TA	3	6	13924	13929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017021	CA	3	6	14589	14594	50 %	0 %	0 %	50 %	383327308
36	NC_017021	AT	3	6	14842	14847	50 %	50 %	0 %	0 %	383327309
37	NC_017021	CT	3	6	15670	15675	0 %	50 %	0 %	50 %	383327312
38	NC_017021	TC	3	6	16211	16216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017021	AT	3	6	16269	16274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017021	GT	3	6	17371	17376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017021	AT	3	6	18102	18107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017021	AT	3	6	18110	18115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017021	TA	3	6	18394	18399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017021	TA	4	8	18567	18574	50 %	50 %	0 %	0 %	383327315
45	NC_017021	CT	3	6	18866	18871	0 %	50 %	0 %	50 %	383327316
46	NC_017021	CT	3	6	19589	19594	0 %	50 %	0 %	50 %	383327316
47	NC_017021	AT	3	6	19603	19608	50 %	50 %	0 %	0 %	383327316
48	NC_017021	TA	3	6	19817	19822	50 %	50 %	0 %	0 %	383327316
49	NC_017021	GA	3	6	20048	20053	50 %	0 %	50 %	0 %	383327316
50	NC_017021	TA	3	6	20456	20461	50 %	50 %	0 %	0 %	383327316
51	NC_017021	GT	3	6	20486	20491	0 %	50 %	50 %	0 %	383327316
52	NC_017021	TC	3	6	20690	20695	0 %	50 %	0 %	50 %	383327316
53	NC_017021	AG	3	6	20715	20720	50 %	0 %	50 %	0 %	383327316
54	NC_017021	TA	4	8	21205	21212	50 %	50 %	0 %	0 %	383327317
55	NC_017021	AT	3	6	21725	21730	50 %	50 %	0 %	0 %	383327318
56	NC_017021	TA	3	6	22146	22151	50 %	50 %	0 %	0 %	383327319
57	NC_017021	TA	3	6	22406	22411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017021	TA	3	6	22436	22441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017021	TA	3	6	22695	22700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017021	AT	3	6	22704	22709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.