MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_3

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017021	A	6	6	1430	1435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017021	A	6	6	1575	1580	100 %	0 %	0 %	0 %	383327287
3	NC_017021	A	6	6	1910	1915	100 %	0 %	0 %	0 %	383327287
4	NC_017021	A	7	7	2481	2487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017021	A	7	7	2584	2590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017021	A	6	6	2763	2768	100 %	0 %	0 %	0 %	383327288
7	NC_017021	A	6	6	2912	2917	100 %	0 %	0 %	0 %	383327288
8	NC_017021	A	7	7	2933	2939	100 %	0 %	0 %	0 %	383327288
9	NC_017021	A	7	7	3639	3645	100 %	0 %	0 %	0 %	383327291
10	NC_017021	A	6	6	3696	3701	100 %	0 %	0 %	0 %	383327291
11	NC_017021	A	7	7	3817	3823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017021	A	6	6	3917	3922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017021	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017021	A	6	6	4146	4151	100 %	0 %	0 %	0 %	383327292
15	NC_017021	T	6	6	4435	4440	0 %	100 %	0 %	0 %	383327293
16	NC_017021	T	6	6	4625	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	383327293
17	NC_017021	T	7	7	6522	6528	0 %	100 %	0 %	0 %	383327294
18	NC_017021	C	6	6	7577	7582	0 %	0 %	0 %	100 %	383327298
19	NC_017021	T	6	6	8390	8395	0 %	100 %	0 %	0 %	383327299
20	NC_017021	A	6	6	8466	8471	100 %	0 %	0 %	0 %	383327299
21	NC_017021	A	6	6	8653	8658	100 %	0 %	0 %	0 %	383327299
22	NC_017021	A	7	7	8851	8857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017021	T	7	7	8995	9001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017021	A	6	6	9023	9028	100 %	0 %	0 %	0 %	383327300
25	NC_017021	A	7	7	9122	9128	100 %	0 %	0 %	0 %	383327300
26	NC_017021	A	6	6	9735	9740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017021	A	6	6	10846	10851	100 %	0 %	0 %	0 %	383327303
28	NC_017021	A	6	6	10981	10986	100 %	0 %	0 %	0 %	383327303
29	NC_017021	T	6	6	12000	12005	0 %	100 %	0 %	0 %	383327305
30	NC_017021	T	7	7	12020	12026	0 %	100 %	0 %	0 %	383327305
31	NC_017021	A	6	6	12173	12178	100 %	0 %	0 %	0 %	383327305
32	NC_017021	T	6	6	12341	12346	0 %	100 %	0 %	0 %	383327305
33	NC_017021	T	6	6	14240	14245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017021	T	7	7	14648	14654	0 %	100 %	0 %	0 %	383327308
35	NC_017021	T	6	6	14876	14881	0 %	100 %	0 %	0 %	383327309
36	NC_017021	T	6	6	15962	15967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017021	T	6	6	16178	16183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017021	T	8	8	17262	17269	0 %	100 %	0 %	0 %	383327313
39	NC_017021	A	6	6	17812	17817	100 %	0 %	0 %	0 %	383327314
40	NC_017021	T	6	6	17963	17968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017021	T	6	6	18191	18196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017021	G	6	6	19634	19639	0 %	0 %	100 %	0 %	383327316
43	NC_017021	T	6	6	19736	19741	0 %	100 %	0 %	0 %	383327316
44	NC_017021	A	6	6	20123	20128	100 %	0 %	0 %	0 %	383327316
45	NC_017021	A	7	7	20306	20312	100 %	0 %	0 %	0 %	383327316
46	NC_017021	T	6	6	20404	20409	0 %	100 %	0 %	0 %	383327316
47	NC_017021	T	6	6	20978	20983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017021	T	6	6	21102	21107	0 %	100 %	0 %	0 %	383327317
49	NC_017021	T	6	6	21287	21292	0 %	100 %	0 %	0 %	383327317
50	NC_017021	T	6	6	21382	21387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017021	A	6	6	21396	21401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017021	T	6	6	21600	21605	0 %	100 %	0 %	0 %	383327318
53	NC_017021	G	6	6	21683	21688	0 %	0 %	100 %	0 %	383327318
54	NC_017021	T	6	6	21692	21697	0 %	100 %	0 %	0 %	383327318
55	NC_017021	T	6	6	21712	21717	0 %	100 %	0 %	0 %	383327318
56	NC_017021	T	6	6	21738	21743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017021	A	6	6	22616	22621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.