MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 13

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	TTAATC	2	12	272	283	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017020	TAGCTA	2	12	743	754	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017020	GATAAT	2	12	4971	4982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383327252
4	NC_017020	CAATTA	2	12	5145	5156	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017020	AAAAGA	2	12	7122	7133	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017020	AAATTC	2	12	9737	9748	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383327262
7	NC_017020	ACATAT	2	12	10653	10664	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017020	GAATTT	2	12	15769	15780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383327270
9	NC_017020	TTTAAT	2	12	20566	20577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327274
10	NC_017020	AATGTA	2	12	21424	21435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383327276
11	NC_017020	ATCATT	2	12	25026	25037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383327279
12	NC_017020	AATTAT	2	12	25425	25436	50 %	50 %	0 %	0 %	383327279
13	NC_017020	CAGGAA	2	12	31667	31678	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.