MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	TTTTA	2	10	190	199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017020	TAATT	2	10	675	684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017020	ATCTC	2	10	1193	1202	20 %	40 %	0 %	40 %	383327250
4	NC_017020	AAAGC	2	10	1459	1468	60 %	0 %	20 %	20 %	383327250
5	NC_017020	TATAA	2	10	3185	3194	60 %	40 %	0 %	0 %	383327251
6	NC_017020	ACTAT	2	10	3204	3213	40 %	40 %	0 %	20 %	383327251
7	NC_017020	TTGTT	2	10	3239	3248	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017020	TTCTA	2	10	5116	5125	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017020	CTTTG	2	10	6870	6879	0 %	60 %	20 %	20 %	383327255
10	NC_017020	GATAA	2	10	10991	11000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017020	AGTGG	2	10	13259	13268	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017020	ACAGG	2	10	14724	14733	40 %	0 %	40 %	20 %	383327268
13	NC_017020	ATTTT	2	10	14737	14746	20 %	80 %	0 %	0 %	383327268
14	NC_017020	GGTTT	2	10	15151	15160	0 %	60 %	40 %	0 %	383327269
15	NC_017020	ATTAG	2	10	15416	15425	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017020	ATATG	2	10	16617	16626	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017020	AGTGG	2	10	17174	17183	20 %	20 %	60 %	0 %	383327272
18	NC_017020	AATAT	2	10	19489	19498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017020	ACTCC	2	10	22884	22893	20 %	20 %	0 %	60 %	383327278
20	NC_017020	ATCTT	2	10	23761	23770	20 %	60 %	0 %	20 %	383327278
21	NC_017020	ACGCA	2	10	24109	24118	40 %	0 %	20 %	40 %	383327278
22	NC_017020	CTTCT	2	10	24936	24945	0 %	60 %	0 %	40 %	383327278
23	NC_017020	CTTTA	2	10	26254	26263	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017020	ATTAA	2	10	29510	29519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017020	ATATT	2	10	30115	30124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.