MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	ACAA	2	8	172	179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017020	TTAT	2	8	901	908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017020	AAGC	2	8	1048	1055	50 %	0 %	25 %	25 %	383327250
4	NC_017020	AATT	2	8	1941	1948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017020	TAAT	2	8	2453	2460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017020	ATTT	2	8	3082	3089	25 %	75 %	0 %	0 %	383327251
7	NC_017020	TTTA	2	8	3989	3996	25 %	75 %	0 %	0 %	383327252
8	NC_017020	TTTG	2	8	4030	4037	0 %	75 %	25 %	0 %	383327252
9	NC_017020	GCTA	2	8	4598	4605	25 %	25 %	25 %	25 %	383327252
10	NC_017020	AGTA	2	8	4835	4842	50 %	25 %	25 %	0 %	383327252
11	NC_017020	TTGA	2	8	4995	5002	25 %	50 %	25 %	0 %	383327252
12	NC_017020	TCTT	2	8	6371	6378	0 %	75 %	0 %	25 %	383327255
13	NC_017020	AATG	2	8	6809	6816	50 %	25 %	25 %	0 %	383327255
14	NC_017020	CTCC	2	8	7316	7323	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_017020	TATC	2	8	7706	7713	25 %	50 %	0 %	25 %	383327258
16	NC_017020	TGAT	2	8	8422	8429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017020	GTTT	2	8	8631	8638	0 %	75 %	25 %	0 %	383327260
18	NC_017020	TTAA	2	8	9038	9045	50 %	50 %	0 %	0 %	383327261
19	NC_017020	TTTC	2	8	9166	9173	0 %	75 %	0 %	25 %	383327261
20	NC_017020	TAAT	2	8	9481	9488	50 %	50 %	0 %	0 %	383327261
21	NC_017020	AATA	2	8	9523	9530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017020	CTTT	2	8	9987	9994	0 %	75 %	0 %	25 %	383327263
23	NC_017020	ATCA	2	8	10268	10275	50 %	25 %	0 %	25 %	383327263
24	NC_017020	AATT	2	8	10562	10569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017020	TAAT	3	12	10590	10601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017020	AATA	2	8	10945	10952	75 %	25 %	0 %	0 %	383327264
27	NC_017020	AATC	2	8	11164	11171	50 %	25 %	0 %	25 %	383327265
28	NC_017020	TCTT	2	8	11265	11272	0 %	75 %	0 %	25 %	383327265
29	NC_017020	CTGC	2	8	11311	11318	0 %	25 %	25 %	50 %	383327265
30	NC_017020	TAAT	2	8	11978	11985	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
31	NC_017020	CAAG	2	8	12058	12065	50 %	0 %	25 %	25 %	383327265
32	NC_017020	ACTT	2	8	12764	12771	25 %	50 %	0 %	25 %	383327265
33	NC_017020	AGCG	2	8	12958	12965	25 %	0 %	50 %	25 %	383327265
34	NC_017020	CTTT	2	8	13210	13217	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017020	TCTG	2	8	14575	14582	0 %	50 %	25 %	25 %	383327268
36	NC_017020	GAAA	2	8	16344	16351	75 %	0 %	25 %	0 %	383327271
37	NC_017020	AAGA	2	8	16606	16613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017020	ACCA	2	8	16672	16679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017020	TAAT	2	8	16698	16705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017020	TAAT	2	8	16753	16760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017020	TACG	2	8	16951	16958	25 %	25 %	25 %	25 %	383327272
42	NC_017020	TTTA	2	8	17923	17930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017020	ATTA	2	8	18322	18329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017020	AAGT	2	8	18623	18630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017020	GATA	2	8	20176	20183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017020	TAAA	2	8	20742	20749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017020	AAGA	2	8	21043	21050	75 %	0 %	25 %	0 %	383327275
48	NC_017020	TAGC	2	8	21363	21370	25 %	25 %	25 %	25 %	383327276
49	NC_017020	TCTT	2	8	21730	21737	0 %	75 %	0 %	25 %	383327276
50	NC_017020	AATA	2	8	21912	21919	75 %	25 %	0 %	0 %	383327276
51	NC_017020	TCTT	2	8	21933	21940	0 %	75 %	0 %	25 %	383327276
52	NC_017020	TACT	2	8	22876	22883	25 %	50 %	0 %	25 %	383327278
53	NC_017020	TTGT	2	8	23205	23212	0 %	75 %	25 %	0 %	383327278
54	NC_017020	AAAG	2	8	23397	23404	75 %	0 %	25 %	0 %	383327278
55	NC_017020	ATCT	2	8	23645	23652	25 %	50 %	0 %	25 %	383327278
56	NC_017020	TGAA	2	8	24732	24739	50 %	25 %	25 %	0 %	383327278
57	NC_017020	CTAA	2	8	24862	24869	50 %	25 %	0 %	25 %	383327278
58	NC_017020	CTGC	2	8	24905	24912	0 %	25 %	25 %	50 %	383327278
59	NC_017020	TTAC	2	8	25127	25134	25 %	50 %	0 %	25 %	383327279
60	NC_017020	TCGT	2	8	26900	26907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017020	TTGC	2	8	27100	27107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017020	ATCT	2	8	27404	27411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_017020	CTTA	2	8	27443	27450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017020	TGCT	2	8	27539	27546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017020	ACTT	2	8	28661	28668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017020	CTTT	2	8	28863	28870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017020	TGGA	2	8	29818	29825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017020	TGTA	2	8	29846	29853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017020	CATA	2	8	29859	29866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017020	TTTG	2	8	30225	30232	0 %	75 %	25 %	0 %	383327282
71	NC_017020	TTAT	2	8	30285	30292	25 %	75 %	0 %	0 %	383327282
72	NC_017020	TAAT	2	8	30349	30356	50 %	50 %	0 %	0 %	383327282
73	NC_017020	CATA	2	8	30566	30573	50 %	25 %	0 %	25 %	383327283
74	NC_017020	GATT	2	8	30899	30906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017020	ATTA	2	8	31441	31448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.