MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	ACAA	2	8	172	179	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017020	TTAT	2	8	901	908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017020	AATT	2	8	1941	1948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017020	TAAT	2	8	2453	2460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017020	CTCC	2	8	7316	7323	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_017020	TGAT	2	8	8422	8429	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017020	AATA	2	8	9523	9530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017020	AATT	2	8	10562	10569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017020	TAAT	3	12	10590	10601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017020	CTTT	2	8	13210	13217	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017020	AAGA	2	8	16606	16613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017020	ACCA	2	8	16672	16679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017020	TAAT	2	8	16698	16705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017020	TAAT	2	8	16753	16760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017020	TTTA	2	8	17923	17930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017020	ATTA	2	8	18322	18329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017020	AAGT	2	8	18623	18630	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017020	GATA	2	8	20176	20183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017020	TAAA	2	8	20742	20749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017020	TCGT	2	8	26900	26907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017020	TTGC	2	8	27100	27107	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017020	ATCT	2	8	27404	27411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017020	CTTA	2	8	27443	27450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017020	TGCT	2	8	27539	27546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017020	ACTT	2	8	28661	28668	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017020	CTTT	2	8	28863	28870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017020	TGGA	2	8	29818	29825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017020	TGTA	2	8	29846	29853	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017020	CATA	2	8	29859	29866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017020	GATT	2	8	30899	30906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017020	ATTA	2	8	31441	31448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.