MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	AAGC	2	8	1048	1055	50 %	0 %	25 %	25 %	383327250
2	NC_017020	ATTT	2	8	3082	3089	25 %	75 %	0 %	0 %	383327251
3	NC_017020	TTTA	2	8	3989	3996	25 %	75 %	0 %	0 %	383327252
4	NC_017020	TTTG	2	8	4030	4037	0 %	75 %	25 %	0 %	383327252
5	NC_017020	GCTA	2	8	4598	4605	25 %	25 %	25 %	25 %	383327252
6	NC_017020	AGTA	2	8	4835	4842	50 %	25 %	25 %	0 %	383327252
7	NC_017020	TTGA	2	8	4995	5002	25 %	50 %	25 %	0 %	383327252
8	NC_017020	TCTT	2	8	6371	6378	0 %	75 %	0 %	25 %	383327255
9	NC_017020	AATG	2	8	6809	6816	50 %	25 %	25 %	0 %	383327255
10	NC_017020	TATC	2	8	7706	7713	25 %	50 %	0 %	25 %	383327258
11	NC_017020	GTTT	2	8	8631	8638	0 %	75 %	25 %	0 %	383327260
12	NC_017020	TTAA	2	8	9038	9045	50 %	50 %	0 %	0 %	383327261
13	NC_017020	TTTC	2	8	9166	9173	0 %	75 %	0 %	25 %	383327261
14	NC_017020	TAAT	2	8	9481	9488	50 %	50 %	0 %	0 %	383327261
15	NC_017020	CTTT	2	8	9987	9994	0 %	75 %	0 %	25 %	383327263
16	NC_017020	ATCA	2	8	10268	10275	50 %	25 %	0 %	25 %	383327263
17	NC_017020	AATA	2	8	10945	10952	75 %	25 %	0 %	0 %	383327264
18	NC_017020	AATC	2	8	11164	11171	50 %	25 %	0 %	25 %	383327265
19	NC_017020	TCTT	2	8	11265	11272	0 %	75 %	0 %	25 %	383327265
20	NC_017020	CTGC	2	8	11311	11318	0 %	25 %	25 %	50 %	383327265
21	NC_017020	TAAT	2	8	11978	11985	50 %	50 %	0 %	0 %	383327265
22	NC_017020	CAAG	2	8	12058	12065	50 %	0 %	25 %	25 %	383327265
23	NC_017020	ACTT	2	8	12764	12771	25 %	50 %	0 %	25 %	383327265
24	NC_017020	AGCG	2	8	12958	12965	25 %	0 %	50 %	25 %	383327265
25	NC_017020	TCTG	2	8	14575	14582	0 %	50 %	25 %	25 %	383327268
26	NC_017020	GAAA	2	8	16344	16351	75 %	0 %	25 %	0 %	383327271
27	NC_017020	TACG	2	8	16951	16958	25 %	25 %	25 %	25 %	383327272
28	NC_017020	AAGA	2	8	21043	21050	75 %	0 %	25 %	0 %	383327275
29	NC_017020	TAGC	2	8	21363	21370	25 %	25 %	25 %	25 %	383327276
30	NC_017020	TCTT	2	8	21730	21737	0 %	75 %	0 %	25 %	383327276
31	NC_017020	AATA	2	8	21912	21919	75 %	25 %	0 %	0 %	383327276
32	NC_017020	TCTT	2	8	21933	21940	0 %	75 %	0 %	25 %	383327276
33	NC_017020	TACT	2	8	22876	22883	25 %	50 %	0 %	25 %	383327278
34	NC_017020	TTGT	2	8	23205	23212	0 %	75 %	25 %	0 %	383327278
35	NC_017020	AAAG	2	8	23397	23404	75 %	0 %	25 %	0 %	383327278
36	NC_017020	ATCT	2	8	23645	23652	25 %	50 %	0 %	25 %	383327278
37	NC_017020	TGAA	2	8	24732	24739	50 %	25 %	25 %	0 %	383327278
38	NC_017020	CTAA	2	8	24862	24869	50 %	25 %	0 %	25 %	383327278
39	NC_017020	CTGC	2	8	24905	24912	0 %	25 %	25 %	50 %	383327278
40	NC_017020	TTAC	2	8	25127	25134	25 %	50 %	0 %	25 %	383327279
41	NC_017020	TTTG	2	8	30225	30232	0 %	75 %	25 %	0 %	383327282
42	NC_017020	TTAT	2	8	30285	30292	25 %	75 %	0 %	0 %	383327282
43	NC_017020	TAAT	2	8	30349	30356	50 %	50 %	0 %	0 %	383327282
44	NC_017020	CATA	2	8	30566	30573	50 %	25 %	0 %	25 %	383327283

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.