MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Rickettsia amblyommii str. GAT-30V plasmid pMCE_1

Total Repeats: 506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017020	ATT	2	6	49	54	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017020	AGC	2	6	102	107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017020	ATT	3	9	118	126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017020	AAT	2	6	142	147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017020	TAA	2	6	228	233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017020	AAT	2	6	234	239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017020	ATG	2	6	241	246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017020	GGT	2	6	322	327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017020	AAT	2	6	445	450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017020	TTA	2	6	485	490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017020	ATA	2	6	491	496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017020	CTA	2	6	590	595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017020	CAG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017020	TAA	2	6	632	637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017020	ATG	2	6	661	666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017020	TAA	2	6	719	724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017020	ATA	2	6	761	766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017020	GAA	2	6	793	798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017020	ATA	2	6	1102	1107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327250
20	NC_017020	AAG	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327250
21	NC_017020	TAC	2	6	1268	1273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327250
22	NC_017020	ACT	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327250
23	NC_017020	CTT	2	6	1531	1536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327250
24	NC_017020	ATG	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017020	TCT	2	6	1644	1649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017020	CTA	2	6	1846	1851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017020	AGT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017020	TTA	2	6	1876	1881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017020	ATA	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017020	CAC	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017020	TGC	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017020	CAA	2	6	2168	2173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017020	ATG	2	6	2258	2263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017020	CAT	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017020	CAA	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017020	TCT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017020	TTA	2	6	2515	2520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017020	AGT	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017020	CAA	2	6	2669	2674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017020	CCA	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017020	TCC	2	6	2779	2784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017020	TAT	2	6	2785	2790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017020	TAC	2	6	2920	2925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327251
44	NC_017020	TCT	2	6	2940	2945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327251
45	NC_017020	TTG	2	6	2956	2961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327251
46	NC_017020	ATG	2	6	3019	3024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327251
47	NC_017020	CCT	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327251
48	NC_017020	ACT	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327251
49	NC_017020	TGA	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017020	CAT	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017020	CTT	2	6	3372	3377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017020	ATA	3	9	3389	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017020	GAA	2	6	3476	3481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017020	GCT	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017020	TCA	2	6	3585	3590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327252
56	NC_017020	TTC	2	6	3611	3616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327252
57	NC_017020	TAC	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327252
58	NC_017020	TAA	2	6	3824	3829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327252
59	NC_017020	TTC	2	6	3830	3835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327252
60	NC_017020	TCT	2	6	3852	3857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327252
61	NC_017020	TTA	2	6	3900	3905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327252
62	NC_017020	CTT	2	6	3910	3915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327252
63	NC_017020	GCT	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327252
64	NC_017020	TCT	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327252
65	NC_017020	CAT	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327252
66	NC_017020	TCT	2	6	4155	4160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327252
67	NC_017020	TGG	2	6	4186	4191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383327252
68	NC_017020	ACT	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327252
69	NC_017020	ATA	2	6	4318	4323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327252
70	NC_017020	ATC	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327252
71	NC_017020	TCC	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327252
72	NC_017020	TAT	2	6	4360	4365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327252
73	NC_017020	CCT	3	9	4444	4452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383327252
74	NC_017020	TTA	2	6	4479	4484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327252
75	NC_017020	TGT	2	6	4514	4519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327252
76	NC_017020	ATC	2	6	4559	4564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327252
77	NC_017020	TAT	2	6	4619	4624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327252
78	NC_017020	GTA	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327252
79	NC_017020	ATG	2	6	4664	4669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327252
80	NC_017020	CAT	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327252
81	NC_017020	TGC	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327252
82	NC_017020	TAA	2	6	4876	4881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327252
83	NC_017020	ACC	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383327252
84	NC_017020	TAT	2	6	5029	5034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327252
85	NC_017020	CTA	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327252
86	NC_017020	ATA	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017020	TTA	2	6	5272	5277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017020	TCT	2	6	5430	5435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327253
89	NC_017020	TAA	2	6	5438	5443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327253
90	NC_017020	TAT	3	9	5466	5474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327253
91	NC_017020	TGC	2	6	5728	5733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327253
92	NC_017020	CCA	2	6	5813	5818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017020	ACA	2	6	5834	5839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017020	TAT	2	6	5885	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017020	ACT	2	6	5951	5956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327254
96	NC_017020	CTG	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327254
97	NC_017020	TGC	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327254
98	NC_017020	TGC	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327254
99	NC_017020	ATC	2	6	6141	6146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017020	CAA	2	6	6244	6249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327255
101	NC_017020	TCA	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327255
102	NC_017020	ATC	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327255
103	NC_017020	TGT	2	6	6489	6494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327255
104	NC_017020	CTT	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327255
105	NC_017020	TCA	2	6	6605	6610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327255
106	NC_017020	ATC	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327255
107	NC_017020	TGC	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383327255
108	NC_017020	TGC	2	6	6958	6963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017020	TGT	2	6	6998	7003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017020	CTT	2	6	7056	7061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017020	GAA	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017020	TCT	2	6	7213	7218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327256
113	NC_017020	ATA	2	6	7284	7289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017020	GTA	2	6	7305	7310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017020	TAA	2	6	7405	7410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327257
116	NC_017020	TCA	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327257
117	NC_017020	ATT	2	6	7566	7571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327258
118	NC_017020	TTA	2	6	7591	7596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327258
119	NC_017020	CTA	2	6	7616	7621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327258
120	NC_017020	CTT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327258
121	NC_017020	TTC	2	6	7734	7739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327258
122	NC_017020	ATA	3	9	7767	7775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327258
123	NC_017020	TCA	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327258
124	NC_017020	ATC	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327258
125	NC_017020	ATA	2	6	7866	7871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327259
126	NC_017020	TCT	2	6	7909	7914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327259
127	NC_017020	TTG	2	6	8008	8013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383327259
128	NC_017020	ATT	2	6	8041	8046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327259
129	NC_017020	ATT	2	6	8080	8085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017020	TGA	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017020	GAA	2	6	8186	8191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017020	TAC	2	6	8226	8231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017020	TCT	2	6	8304	8309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017020	TCA	3	9	8521	8529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017020	CAG	2	6	8697	8702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327260
136	NC_017020	TAC	2	6	8731	8736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327260
137	NC_017020	CTA	2	6	8738	8743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327260
138	NC_017020	TAT	2	6	8886	8891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017020	AGA	2	6	9030	9035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327261
140	NC_017020	ATT	2	6	9110	9115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327261
141	NC_017020	ATT	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327261
142	NC_017020	TGA	2	6	9184	9189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327261
143	NC_017020	CAA	3	9	9230	9238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327261
144	NC_017020	TTA	2	6	9285	9290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327261
145	NC_017020	GTA	2	6	9384	9389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327261
146	NC_017020	AGT	2	6	9404	9409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327261
147	NC_017020	ATT	2	6	9432	9437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327261
148	NC_017020	ATT	2	6	9632	9637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327262
149	NC_017020	TTC	2	6	9673	9678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327262
150	NC_017020	AAT	2	6	9815	9820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017020	ATT	2	6	9841	9846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327263
152	NC_017020	ATA	2	6	10023	10028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327263
153	NC_017020	TTA	2	6	10092	10097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327263
154	NC_017020	ATA	2	6	10149	10154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327263
155	NC_017020	CTT	2	6	10221	10226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383327263
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157	NC_017020	TCA	2	6	10251	10256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383327263
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159	NC_017020	TAA	2	6	10316	10321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327263
160	NC_017020	TTA	2	6	10353	10358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327263
161	NC_017020	AAT	2	6	10434	10439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327263
162	NC_017020	TGA	2	6	10528	10533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327263
163	NC_017020	AAT	2	6	10588	10593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017020	TAA	2	6	10611	10616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017020	ATT	2	6	10640	10645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017020	ATG	2	6	10774	10779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327264
167	NC_017020	AAT	2	6	11037	11042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017020	ATT	2	6	11097	11102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327265
169	NC_017020	ACC	2	6	11155	11160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383327265
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173	NC_017020	ATT	2	6	11446	11451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327265
174	NC_017020	CAA	2	6	11456	11461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383327265
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176	NC_017020	ATA	2	6	11573	11578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327265
177	NC_017020	TAA	2	6	11702	11707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327265
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179	NC_017020	TAA	2	6	11745	11750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383327265
180	NC_017020	TGA	2	6	11760	11765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383327265
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232	NC_017020	GGT	2	6	15063	15068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_017020	TAA	2	6	16020	16025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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256	NC_017020	AGG	2	6	16713	16718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_017020	TAT	2	6	16820	16825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383327272
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260	NC_017020	AAG	2	6	16939	16944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383327272
261	NC_017020	CAG	2	6	17166	17171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327272
262	NC_017020	AGC	2	6	17188	17193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383327272
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